基于线粒体基因组全序列的鱚属鱼类系统发育研究
| 摘要 | 第5-7页 |
| Abstract | 第7-8页 |
| 第一章 绪论 | 第12-21页 |
| 1.1 鱼类线粒体基因组 | 第12-16页 |
| 1.1.1 鱼类mtDNA的结构与组成 | 第12-14页 |
| 1.1.2 鱼类mtDNA特性 | 第14页 |
| 1.1.3 鱼类mtDNA的应用 | 第14-16页 |
| 1.2 鱚科鱼类研究概况 | 第16-20页 |
| 1.2.1 鳍科鱼类的分类地位及分布 | 第16页 |
| 1.2.2 鱚科鱼类的生活习性 | 第16页 |
| 1.2.3 鳍科鱼类系统发育研究进展 | 第16-17页 |
| 1.2.4 鳍科鱼类分类研究进展 | 第17-18页 |
| 1.2.5 我国鳍科鱼类研究概况 | 第18-20页 |
| 1.3 本研究的目的和意义 | 第20-21页 |
| 第二章 斑鱚线粒体基因组结构及特征分析 | 第21-33页 |
| 2.1 前言 | 第21-22页 |
| 2.2 材料与方法 | 第22-23页 |
| 2.2.1 实验材料 | 第22页 |
| 2.2.2 基因组DNA提取 | 第22页 |
| 2.2.3 PCR引物设计 | 第22页 |
| 2.2.4 PCR扩增、产物纯化与测序 | 第22-23页 |
| 2.2.5 数据分析 | 第23页 |
| 2.3 结果与分析 | 第23-33页 |
| 2.3.1 结构与组成 | 第23-24页 |
| 2.3.2 碱基组成 | 第24-27页 |
| 2.3.3 蛋白质编码基因 | 第27-29页 |
| 2.3.4 rRNA和tRNA基因 | 第29-31页 |
| 2.3.5 非编码区域 | 第31-33页 |
| 第三章 亚洲鳝线粒体基因组结构及特征分析 | 第33-44页 |
| 3.1 前言 | 第33页 |
| 3.2 材料与方法 | 第33-34页 |
| 3.2.1 实验材料 | 第33-34页 |
| 3.2.2 基因组DNA提取 | 第34页 |
| 3.2.3 PCR引物设计 | 第34页 |
| 3.2.4 PCR扩增与测序 | 第34页 |
| 3.2.5 数据分析 | 第34页 |
| 3.3 结果与分析 | 第34-44页 |
| 3.3.1 结构与组成 | 第34-35页 |
| 3.3.2 碱基组成 | 第35-38页 |
| 3.3.3 蛋白质编码基因 | 第38-40页 |
| 3.3.4 rRNA和tRNA基因 | 第40-42页 |
| 3.3.5 非编码区域 | 第42-44页 |
| 第四章 中国鱚线粒体基因组结构及特征分析 | 第44-55页 |
| 4.1 前言 | 第44页 |
| 4.2 材料与方法 | 第44-45页 |
| 4.2.1 实验材料 | 第44-45页 |
| 4.2.2 基因组DNA提取 | 第45页 |
| 4.2.3 PCR引物设计 | 第45页 |
| 4.2.4 PCR扩增、产物纯化与测序 | 第45页 |
| 4.2.5 数据分析 | 第45页 |
| 4.3 结果与分析 | 第45-55页 |
| 4.3.1 结构与组成 | 第45-46页 |
| 4.3.2 碱基组成 | 第46-49页 |
| 4.3.3 蛋白质编码基因 | 第49-50页 |
| 4.3.4 rRNA和tRNA基因 | 第50-53页 |
| 4.3.5 非编码区域 | 第53-55页 |
| 第五章 少鳞鱚线粒体基因组结构及特征分析 | 第55-66页 |
| 5.1 前言 | 第55页 |
| 5.2 材料与方法 | 第55-56页 |
| 5.2.1 实验材料 | 第55-56页 |
| 5.2.2 基因组DNA提取 | 第56页 |
| 5.2.3 PCR引物设计 | 第56页 |
| 5.2.4 PCR扩增、产物纯化与测序 | 第56页 |
| 5.2.5 数据分析 | 第56页 |
| 5.3 结果与分析 | 第56-66页 |
| 5.3.1 结构与组成 | 第56-57页 |
| 5.3.2 碱基组成 | 第57-60页 |
| 5.3.3 蛋白质编码基因 | 第60-61页 |
| 5.3.4 rRNA和tRNA基因 | 第61-64页 |
| 5.3.5 非编码区域 | 第64-66页 |
| 第六章 多鳞鱚线粒体基因组结构及特征分析 | 第66-77页 |
| 6.1 前言 | 第66页 |
| 6.2 材料与方法 | 第66-67页 |
| 6.2.1 实验材料 | 第67页 |
| 6.2.2 基因组DNA提取 | 第67页 |
| 6.2.3 PCR引物设计 | 第67页 |
| 6.2.4 PCR扩增、产物纯化与测序 | 第67页 |
| 6.2.5 数据分析 | 第67页 |
| 6.3 结果与分析 | 第67-77页 |
| 6.3.1 结构与组成 | 第67-68页 |
| 6.3.2 碱基组成 | 第68-71页 |
| 6.3.3 蛋白质编码基因 | 第71-73页 |
| 6.3.4 rRNA和tRNA基因 | 第73-75页 |
| 6.3.5 非编码区域 | 第75-77页 |
| 第七章 印度鱚线粒体基因组结构及特征分析 | 第77-88页 |
| 7.1 前言 | 第77-78页 |
| 7.2 材料与方法 | 第78页 |
| 7.2.1 实验材料 | 第78页 |
| 7.2.2 基因组DNA提取 | 第78页 |
| 7.2.3 PCR引物设计 | 第78页 |
| 7.2.4 PCR扩增、产物纯化与测序 | 第78页 |
| 7.2.5 数据分析 | 第78页 |
| 7.3 结果与分析 | 第78-88页 |
| 7.3.1 结构与组成 | 第78-79页 |
| 7.3.2 碱基组成 | 第79-82页 |
| 7.3.3 蛋白质编码基因 | 第82-84页 |
| 7.3.4 rRNA和tRNA基因 | 第84-86页 |
| 7.3.5 非编码区域 | 第86-88页 |
| 第八章 六种鱚属鱼类线粒体DNA比较 | 第88-93页 |
| 8.1 线粒体基因组结构 | 第88-89页 |
| 8.2 线粒体基因组碱基组成 | 第89-90页 |
| 8.3 线粒体蛋白质编码基因 | 第90-91页 |
| 8.4 rRNA基因和tRNA基因 | 第91-92页 |
| 8.5 非编码区 | 第92-93页 |
| 第九章 六种鱚属鱼类系统发育分析 | 第93-103页 |
| 9.1 前言 | 第93页 |
| 9.2 材料与方法 | 第93-94页 |
| 9.2.1 实验材料 | 第93页 |
| 9.2.2 线粒体DNA提取及测序分析 | 第93页 |
| 9.2.3 数据分析 | 第93-94页 |
| 9.3 结果与分析 | 第94-100页 |
| 9.3.1 碱基替换饱和度分析 | 第94-97页 |
| 9.3.2 遗传距离分析 | 第97-98页 |
| 9.3.3 系统发育分析 | 第98-99页 |
| 9.3.4 分化时间估算 | 第99-100页 |
| 9.4 讨论 | 第100-103页 |
| 参考文献 | 第103-116页 |
| 致谢 | 第116-117页 |
| 在校期间发表的论文 | 第117页 |
