基于条件随机场的RNA二级结构预测算法
| 摘要 | 第1-6页 |
| Abstract | 第6-10页 |
| 第一章 绪论 | 第10-16页 |
| ·引言 | 第10-12页 |
| ·研究背景 | 第12-14页 |
| ·RNA 的测序 | 第12-13页 |
| ·RNA 的功能研究 | 第13-14页 |
| ·论文内容及结构安排 | 第14-16页 |
| 第二章 RNA 二级结构预测基础 | 第16-22页 |
| ·RNA 的生物学背景 | 第16-18页 |
| ·RNA 的二级结构概念 | 第18-21页 |
| ·本章小结 | 第21-22页 |
| 第三章 RNA 的二级机构预测方法 | 第22-36页 |
| ·基于比较序列分析模型方法 | 第22-24页 |
| ·单RNA 序列分析模型方法 | 第24-34页 |
| ·隐马尔可夫模型模型 | 第25-29页 |
| ·最大碱基配对算法 | 第29-30页 |
| ·最小自由能法 | 第30-31页 |
| ·随机上下文无关文法模型 | 第31-34页 |
| ·本章小结 | 第34-36页 |
| 第四章 基于条件随机场的RNA 二级结构预测 | 第36-53页 |
| ·条件随机场模型 | 第36-38页 |
| ·基于条件随机场的RNA 二级结构预测 | 第38-48页 |
| ·特征函数选取 | 第38-39页 |
| ·模型训练 | 第39-48页 |
| ·实验结果 | 第48-51页 |
| ·序列的选择 | 第48-49页 |
| ·参数的选择 | 第49页 |
| ·实验结果及分析 | 第49-51页 |
| ·本章小结 | 第51-53页 |
| 第五章 总结与展望 | 第53-56页 |
| 致谢 | 第56-57页 |
| 参考文献 | 第57-60页 |