基于条件随机场的RNA二级结构预测算法
摘要 | 第1-6页 |
Abstract | 第6-10页 |
第一章 绪论 | 第10-16页 |
·引言 | 第10-12页 |
·研究背景 | 第12-14页 |
·RNA 的测序 | 第12-13页 |
·RNA 的功能研究 | 第13-14页 |
·论文内容及结构安排 | 第14-16页 |
第二章 RNA 二级结构预测基础 | 第16-22页 |
·RNA 的生物学背景 | 第16-18页 |
·RNA 的二级结构概念 | 第18-21页 |
·本章小结 | 第21-22页 |
第三章 RNA 的二级机构预测方法 | 第22-36页 |
·基于比较序列分析模型方法 | 第22-24页 |
·单RNA 序列分析模型方法 | 第24-34页 |
·隐马尔可夫模型模型 | 第25-29页 |
·最大碱基配对算法 | 第29-30页 |
·最小自由能法 | 第30-31页 |
·随机上下文无关文法模型 | 第31-34页 |
·本章小结 | 第34-36页 |
第四章 基于条件随机场的RNA 二级结构预测 | 第36-53页 |
·条件随机场模型 | 第36-38页 |
·基于条件随机场的RNA 二级结构预测 | 第38-48页 |
·特征函数选取 | 第38-39页 |
·模型训练 | 第39-48页 |
·实验结果 | 第48-51页 |
·序列的选择 | 第48-49页 |
·参数的选择 | 第49页 |
·实验结果及分析 | 第49-51页 |
·本章小结 | 第51-53页 |
第五章 总结与展望 | 第53-56页 |
致谢 | 第56-57页 |
参考文献 | 第57-60页 |