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细菌Comamonas serinivorans C35对木质素的降解及其代谢机制初步研究

摘要第5-7页
ABSTRACT第7-8页
第一章 绪论第12-29页
    1.1 木质素概述第12-15页
        1.1.1 木质素来源、结构与性质第12-13页
        1.1.2 木质素与环境污染第13-14页
        1.1.3 木质素与生物质能源第14-15页
    1.2 木质素的生物降解第15-21页
        1.2.1 木质素降解的微生物种类第15-17页
        1.2.2 木质素生物降解酶系及作用机理第17-19页
        1.2.3 木质素生物降解的应用第19-21页
    1.3 木质素及其模型化合物的生物降解机制第21-24页
        1.3.1 芳基醚的裂解第21-22页
        1.3.2 联苯代谢途径第22页
        1.3.3 阿魏酸代谢途径第22-23页
        1.3.4 没食子酸甲脂代谢途径第23-24页
        1.3.5 原儿茶酸代谢途径第24页
    1.4 木质素生物降解分子生物学研究进展第24-25页
        1.4.1 真菌降解木质素分子生物学研究第24-25页
        1.4.2 细菌降解木质素分子生物学研究第25页
    1.5 丛毛单胞菌降解环境污染物研究进展第25-26页
    1.6 本课题研究思路、内容和路线第26-29页
        1.6.1 研究思路第26-27页
        1.6.2 研究内容第27-28页
        1.6.3 研究路线第28-29页
第二章 Comamonas serinivorans C35木质素降解性能研究第29-39页
    2.1 实验材料与仪器第29-30页
        2.1.1 实验菌株和试剂第29-30页
        2.1.2 实验仪器第30页
        2.1.3 培养基的配制第30页
    2.2 实验方法第30-33页
        2.2.1 菌株的生长及COD的测定第31页
        2.2.2 木质素降解酶活的测定第31-32页
        2.2.3 扫描电镜(SEM)第32-33页
    2.3 实验结果与讨论第33-37页
        2.3.1 菌株的生长及COD的去除第33-34页
        2.3.2 木质素降解酶活第34-36页
        2.3.3 木质素颗粒形貌变化第36-37页
    2.4 本章小结第37-39页
第三章 Comamonas serinivorans C35木质素代谢产物分析第39-54页
    3.1 实验材料与仪器第39-40页
        3.1.1 实验菌株和试剂第39-40页
        3.1.2 实验仪器第40页
        3.1.3 培养基的配制第40页
    3.2 实验方法第40-42页
        3.2.1 傅里叶变换红外光谱(FTIR)检测第40-41页
        3.2.2 单环芳香族化合物做碳源试验第41页
        3.2.3 气相色谱/质谱联用(GC-MS)检测第41-42页
    3.3 实验结果与讨论第42-53页
        3.3.1 木质素结构中化学键的变化第42-43页
        3.3.2 单环芳香族化合物做碳源的利用情况第43-44页
        3.3.3 木质素降解产物分析第44-53页
    3.4 本章小结第53-54页
第四章 Comamonas serinivorans C35全基因组分析第54-71页
    4.1 实验材料与仪器第54-55页
        4.1.1 实验菌株和试剂第54-55页
        4.1.2 实验仪器第55页
        4.1.3 培养基的配制第55页
    4.2 实验方法第55-57页
        4.2.1 菌株培养及细胞收集第55页
        4.2.2 菌株全基因组提取和质检第55-56页
        4.2.3 菌株全基因组建库测序第56-57页
        4.2.4 生物信息学分析第57页
    4.3 实验结果与讨论第57-70页
        4.3.1 基因组样品质检结果第57-58页
        4.3.2 测序数据质控第58-59页
        4.3.3 测序数据组装第59页
        4.3.4 基因预测第59-60页
        4.3.5 基因功能注释第60-62页
        4.3.6 基因组圈图第62-63页
        4.3.7 木质素降解相关酶筛选第63-67页
        4.3.8 Comamonas serinivorans C35木质素代谢途径推断第67-70页
    4.4 本章小结第70-71页
第五章 结论与展望第71-73页
    5.1 结论第71页
    5.2 展望第71-73页
参考文献第73-84页
致谢第84-85页
在学期间发表的学术论文及其他科研成果第85页

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