| 摘要 | 第1-6页 |
| Abstract | 第6-11页 |
| 第一章 绪论 | 第11-20页 |
| ·黄单胞菌属的基因组学研究 | 第11-14页 |
| ·黄单胞菌属的基因组特征 | 第11页 |
| ·与致病相关的功能基因 | 第11-13页 |
| ·致病相关基因的种间差异 | 第13-14页 |
| ·细菌第二信使环鸟苷二磷酸c-di-GMP | 第14-18页 |
| ·C-di-GMP 信号受体蛋白 | 第14-17页 |
| ·核糖开关作为c-di-GMP 的效应子 | 第17-18页 |
| ·本研究的目的意义和技术路线 | 第18-20页 |
| ·研究目的和意义 | 第18-19页 |
| ·技术路线 | 第19-20页 |
| 第二章 转录调控因子Clpxoo 的表达与纯化 | 第20-29页 |
| ·实验材料 | 第20-21页 |
| ·菌株和质粒 | 第20页 |
| ·生化试剂 | 第20页 |
| ·培养基和菌株培养条件 | 第20-21页 |
| ·主要仪器 | 第21页 |
| ·实验方法 | 第21-25页 |
| ·Xoo 基因组DNA 的制备 | 第21页 |
| ·Clpxoo 表达质粒的构建 | 第21-23页 |
| ·Clpxoo 蛋白的表达与纯化 | 第23-25页 |
| ·结果与分析 | 第25-27页 |
| ·clpxoo 克隆与表达质粒构建 | 第25-26页 |
| ·重组质粒的序列测定 | 第26页 |
| ·SDS-PAGE 鉴定Clpxoo 蛋白诱导表达结果 | 第26页 |
| ·蛋白可溶性检测和诱导表达条件的优化 | 第26页 |
| ·目的蛋白的纯化、透析及浓缩 | 第26-27页 |
| ·讨论 | 第27-29页 |
| 第三章 转录调控因子Clpxoo 的HTH 功能结构域的解析 | 第29-39页 |
| ·实验材料 | 第29-30页 |
| ·qRT-PCR 实验的供试菌株、生物试剂和主要仪器 | 第29-30页 |
| ·EMSA 的实验材料、生化试剂和主要仪器 | 第30页 |
| ·实验方法 | 第30-34页 |
| ·相关基因的启动子分析 | 第30页 |
| ·相关基因的qRT-PCR | 第30-32页 |
| ·生物素化学发光EMSA | 第32-34页 |
| ·实验结果 | 第34-38页 |
| ·相关基因启动子分析 | 第34页 |
| ·△clpxoo 中相关基因表达检测 | 第34-35页 |
| ·生物素化学发光EMSA | 第35-38页 |
| ·讨论 | 第38-39页 |
| 第四章 转录调控因子Clpxoo 的cNMP 受体功能结构域的解析 | 第39-43页 |
| ·实验材料 | 第39页 |
| ·实验方法 | 第39-40页 |
| ·Clpxoo 蛋白和小分子初步准备 | 第39页 |
| ·Clpxoo 蛋白纯化的改进 | 第39-40页 |
| ·ITC 实验 | 第40页 |
| ·实验结果 | 第40-42页 |
| ·Clpxoo 蛋白的纯化和浓度测定 | 第40页 |
| ·Clpxoo 蛋白纯化的改进和浓度测定 | 第40-41页 |
| ·ITC 实验 | 第41-42页 |
| ·讨论 | 第42-43页 |
| 第五章 C-di-GMP 信号途径相关基因PXO_01019、PXO_03877 及PXO_04753 的表达 | 第43-50页 |
| ·实验材料 | 第43页 |
| ·菌株、质粒和培养条件 | 第43页 |
| ·生化试剂 | 第43页 |
| ·实验方法 | 第43-45页 |
| ·Xoo 基因组DNA 的制备 | 第43-44页 |
| ·重组表达质粒的构建与验证 | 第44页 |
| ·重组蛋白的表达 | 第44-45页 |
| ·结果与分析 | 第45-49页 |
| ·PXO_01019、PXO_03877 及PXO_04753 的基因克隆和功能结构域分析 | 第45页 |
| ·PXO_01019、PXO_03877 及PXO_04753 基因的表达质粒的构建 | 第45-46页 |
| ·PXO_01019、PXO_03877 及PXO_04753 蛋白的诱导表达 | 第46-49页 |
| ·讨论 | 第49-50页 |
| 第六章 全文结论 | 第50-51页 |
| 参考文献 | 第51-57页 |
| 附录 | 第57-58页 |
| 致谢 | 第58-59页 |
| 作者简历 | 第59页 |
