| 摘要 | 第5-7页 |
| Abstract | 第7-8页 |
| 第一部分：拟南芥突变体edt1根系发育的分子机制 | 第13-69页 |
| 第1.1章 绪论 | 第15-31页 |
| 1.1.1 拟南芥突变体edt1介绍 | 第15-16页 |
| 1.1.2 HD-ZIP家族介绍 | 第16-22页 |
| 1.1.3 拟南芥根系发育 | 第22-25页 |
| 1.1.4 细胞壁结构及功能 | 第25-27页 |
| 1.1.5 细胞壁松弛因子 | 第27-31页 |
| 第1.2章 实验材料和方法 | 第31-41页 |
| 1.2.1 植物材料和生长条件 | 第31页 |
| 1.2.2 突变体和野生型根系转录本检测 | 第31页 |
| 1.2.3 芯片数据分析方法 | 第31-32页 |
| 1.2.4 RNA抽提 | 第32-33页 |
| 1.2.5 RNA电泳 | 第33页 |
| 1.2.6 载体构建 | 第33-34页 |
| 1.2.7 酵母单杂交 | 第34-37页 |
| 1.2.8 ChIP-PCR | 第37-39页 |
| 1.2.9 RNA反转 | 第39页 |
| 1.2.10 荧光定量PCR | 第39页 |
| 1.2.11 过表达植物材料的获得 | 第39-40页 |
| 1.2.12 浸花转化拟南芥 | 第40-41页 |
| 第1.3章 实验结果 | 第41-63页 |
| 1.3.1 edt1根系转录组比较分析 | 第41-52页 |
| 1.3.1.1 整体分析 | 第41-46页 |
| 1.3.1.2 不同发育阶段比较分析 | 第46-52页 |
| 1.3.2 很多细胞壁松弛蛋白相关基因在edt1中被显著上调 | 第52-54页 |
| 1.3.3 在edt1中被显著上调的细胞壁松弛基因的启动子中大都含有可以被HDG11识别结合的homeobox顺式元件 | 第54-55页 |
| 1.3.4 体外实验表明HDG11与这些homeobox具有不同的亲和性 | 第55-57页 |
| 1.3.5 HDG11在体内可以与膨胀素基因EXPA5和EXPB3的启动子区域结合 | 第57-58页 |
| 1.3.6 组成型高表达EXPA5可以增大主根长度 | 第58-60页 |
| 1.3.7 组成型高表达At5g62360或At2g32990没有改变根系构型 | 第60-61页 |
| 1.3.8 显著上调的细胞壁松弛相关基因对MeJA和IAA的应答情况 | 第61-63页 |
| 第1.4章 讨论 | 第63-69页 |
| 1.4.1 edt1根系发育的分子机制 | 第63-66页 |
| 1.4.2 细胞壁松弛因子协同作用改变细胞壁柔性从而影响根系构型 | 第66-69页 |
| 第二部分：拟南芥突变体pqt24-1耐百草枯机制研究 | 第69-97页 |
| 第2.1章 绪论 | 第71-77页 |
| 2.1.1 植物中的氧化胁迫 | 第71页 |
| 2.1.2 激活突变体库 | 第71-72页 |
| 2.1.3 百草枯及植物对于百草枯的耐受机制 | 第72-74页 |
| 2.1.4 ABC转运蛋白及PDR家族介绍 | 第74-77页 |
| 第2.2章 实验材料和方法 | 第77-85页 |
| 2.2.1 激活突变体库的获得 | 第77页 |
| 2.2.2 拟南芥耐百草枯突变体的筛选 | 第77页 |
| 2.2.3 突变体存活率分析 | 第77页 |
| 2.2.4 遗传分析 | 第77-78页 |
| 2.2.5 Tail-PCR鉴定pqt24-1突变体T-DNA插入位点 | 第78-80页 |
| 2.2.6 T-DNA插入缺失突变体纯合体的获得 | 第80-81页 |
| 2.2.7 植物DNA的抽提 | 第81页 |
| 2.2.8 重组载体的构建和转基因植株的获得 | 第81-83页 |
| 2.2.9 GUS组织化学染色法获得基因表达谱 | 第83页 |
| 2.2.10 GFP观察蛋白亚细胞定位 | 第83页 |
| 2.2.11 同位素14C标记的百草枯吸收测定实验 | 第83-84页 |
| 2.2.12 AtPDR11胁迫应答分析 | 第84页 |
| 2.2.13 根系生长实验 | 第84-85页 |
| 第2.3章 实验结果 | 第85-95页 |
| 2.3.1 筛选得到耐百草枯的突变体pqt24-1 | 第85-86页 |
| 2.3.2 对耐百草枯突变体pqt24-1百草枯抗性的遗传分析 | 第86页 |
| 2.3.3 pdt24-1的T-DNA插入位点的鉴定 | 第86-87页 |
| 2.3.4 复等位基因突变分析及功能互补实验 | 第87页 |
| 2.3.5 pdr6突变体对百草枯不耐受 | 第87-88页 |
| 2.3.6 百草枯吸收的动力学分析 | 第88-90页 |
| 2.3.7 AtPDR11蛋白定位在质膜上 | 第90-91页 |
| 2.3.8 AtPDR11表达模式及其胁迫应答 | 第91-92页 |
| 2.3.9 生长素、多胺、镉和钙处理下根系延伸实验 | 第92-95页 |
| 第2.4章 讨论 | 第95-97页 |
| 参考文献 | 第97-103页 |
| 附录 | 第103-155页 |
| 附录Ⅰ 缩略词 | 第103-104页 |
| 附录Ⅱ 实验中涉及到的溶液的配方 | 第104-107页 |
| 附录Ⅲ 根系转录组中显著上调基因列表 | 第107-121页 |
| 附录Ⅳ 显著上调基因显著富集功能类基因列表(部分) | 第121-126页 |
| 71.01 Cell Wall | 第121-123页 |
| 32.01.01 Oxidative Stress Response | 第123-124页 |
| 32.07.07 Oxygen and radical detoxification | 第124-125页 |
| 32.07.07.05 Peroxidase Reaction | 第125页 |
| 34.11.03.13 osmosensing and response | 第125-126页 |
| 附录Ⅴ 显著上调基因显著富集功能类基因Homeobox分布情况 | 第126-129页 |
| 32.01.01 Oxidative Stress Response | 第126-127页 |
| 32.07.07 Oxygen and radical detoxification | 第127页 |
| 34.11.03.13 osmosensing and response | 第127-129页 |
| 附录Ⅵ 相邻时间点比较分析中不同基因 | 第129-147页 |
| 1. 显著上调基因 | 第129-137页 |
| 6D/3D(125 genes) | 第129-132页 |
| 10D/6D(155 genes) | 第132-135页 |
| 15D/10D(67 genes) | 第135-137页 |
| 20D/15D(28 genes) | 第137页 |
| 2. 显著下调基因 | 第137-147页 |
| 6D/3D(151 genes) | 第137-141页 |
| 10D/6D(210 genes) | 第141-146页 |
| 15D/10D(13 genes) | 第146页 |
| 20D/15D(14 genes) | 第146-147页 |
| 附录Ⅶ 实验中用到的引物序列和构建的载体信息 | 第147-153页 |
| 附录Ⅷ 膨胀素家族(expansin)和木葡聚糖转移酶家族(XTH)基因列表 | 第153-155页 |
| 致谢 | 第155-157页 |
| 在读期间发表的学术论文与取得的研究成果 | 第157页 |
