| 摘要 | 第6-8页 |
| ABSTRACT | 第8-9页 |
| 1 前言 | 第10-21页 |
| 1.1 土壤微生物 | 第10页 |
| 1.2 土壤中的微生物多样性 | 第10-16页 |
| 1.2.1 土壤微生物多样性调查方法 | 第10-14页 |
| 1.2.2 微生物多样性研究进展 | 第14-16页 |
| 1.3 土壤铁锰氧化物及铁锰结核 | 第16-17页 |
| 1.4 微生物在铁锰元素地球化学循环中的作用及生物锰氧化物形成机制 | 第17-19页 |
| 1.5 研究目的和意义 | 第19-20页 |
| 1.6 技术路线 | 第20-21页 |
| 2 四种地带性土壤及铁锰结核中微生物多样性研究 | 第21-60页 |
| 2.1 引言 | 第21-22页 |
| 2.2 材料和方法 | 第22-28页 |
| 2.2.1 供试土壤及铁锰结核 | 第22页 |
| 2.2.2 土壤及铁锰结核采集 | 第22-23页 |
| 2.2.3 土壤及铁锰结核DNA提取 | 第23-24页 |
| 2.2.4 实时荧光定量PCR分析 | 第24-25页 |
| 2.2.5 克隆文库构建 | 第25-26页 |
| 2.2.6 测序及系统发育树分析 | 第26-27页 |
| 2.2.7 微生物种群多样性分析 | 第27-28页 |
| 2.3 结果与分析 | 第28-53页 |
| 2.3.1 土壤和铁锰结核中细菌的丰度 | 第28-29页 |
| 2.3.2 土壤和铁锰结核中细菌群落的多样性分析 | 第29-31页 |
| 2.3.3 土壤和铁锰结核中细菌群落的聚类分析 | 第31页 |
| 2.3.4 土壤和铁锰结核中细菌群落组成 | 第31-37页 |
| 2.3.5 土壤和铁锰结核中主要细菌种群的系统发育分析 | 第37-45页 |
| 2.3.6 土壤和铁锰结核中古菌的丰度 | 第45页 |
| 2.3.7 土壤和铁锰结核中古菌群落的多样性分析 | 第45-47页 |
| 2.3.8 土壤和铁锰结核中古菌群落的聚类分析 | 第47-48页 |
| 2.3.9 土壤和铁锰结核中古菌群落组成 | 第48-51页 |
| 2.3.10 土壤和铁锰结核中古菌种群的系统发育分析 | 第51-53页 |
| 2.4 讨论 | 第53-59页 |
| 2.4.1 土壤和铁锰结核中细菌和古菌多样性 | 第53-54页 |
| 2.4.2 土壤和铁锰结核中细菌种群差异及影响因素 | 第54-55页 |
| 2.4.3 土壤和铁锰结核中细菌的潜在生态学功能 | 第55-57页 |
| 2.4.4 土壤和铁锰结核中古菌种群差异及影响因素 | 第57-58页 |
| 2.4.5 土壤及铁锰结核中古菌的潜在生态学功能 | 第58-59页 |
| 2.5 小结 | 第59-60页 |
| 3 神农架山地土壤微生物多样性研究 | 第60-86页 |
| 3.1 引言 | 第60-61页 |
| 3.2 材料与方法 | 第61-63页 |
| 3.2.1 供试土壤 | 第61页 |
| 3.2.2 土壤采集 | 第61-62页 |
| 3.2.3 土壤样品处理 | 第62页 |
| 3.2.4 实时荧光定量PCR分析 | 第62页 |
| 3.2.5 PCR扩增及Miseq边合成法测序 | 第62-63页 |
| 3.2.6 序列处理及数据分析 | 第63页 |
| 3.3 结果与分析 | 第63-83页 |
| 3.3.1 不同海拔山地土壤理化性质 | 第63-67页 |
| 3.3.2 不同海拔山地土壤中细菌和古菌的丰度 | 第67-68页 |
| 3.3.3 不同海拔山地土壤中微生物多样性 | 第68-71页 |
| 3.3.4 不同海拔山地土壤中微生物群落聚类分析 | 第71-72页 |
| 3.3.5 不同海拔山地土壤中微生物的群落组成 | 第72-83页 |
| 3.4 讨论 | 第83-85页 |
| 3.5 小结 | 第85-86页 |
| 4 结论与展望 | 第86-88页 |
| 4.1 结论 | 第86-87页 |
| 4.2 展望 | 第87-88页 |
| 5 论文创新点 | 第88-89页 |
| 参考文献 | 第89-104页 |
| 附录 | 第104-120页 |
| 博士期间撰写与发表的文章 | 第120-121页 |
| 致谢 | 第121-122页 |
