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非昔罗霉素生物合成基因簇的分离与鉴定

摘要第4-5页
ABSTRACT第5页
1 前言第9-20页
    1.1 链霉菌简介第9-11页
        1.1.1 链霉菌及其基因组概述第9-10页
        1.1.2 链霉菌的应用价值第10-11页
    1.2 非昔罗霉素的介绍第11-13页
        1.2.1 非昔罗霉素的结构特点及生物活性第11-12页
        1.2.2 非昔罗霉素的作用机制第12-13页
    1.3 非昔罗霉素的合成方式第13-16页
        1.3.1 非昔罗霉素的生物合成方式第13-15页
        1.3.2 非昔罗霉素的化学合成第15-16页
    1.4 结构相关的其它天然产物第16-18页
    1.5 本课题的立题依据及研究内容第18-20页
        1.5.1 本课题的立题依据第18-19页
        1.5.2 本课题的研究内容第19-20页
2 材料与方法第20-35页
    2.1 实验材料第20-26页
        2.1.1 菌株第20页
        2.1.2 质粒及特点第20-21页
        2.1.3 引物第21-23页
        2.1.4 实验试剂第23-24页
        2.1.5 实验设备与仪器第24-25页
        2.1.6 主要溶液与缓冲液第25-26页
        2.1.7 培养基第26页
    2.2 实验方法第26-34页
        2.2.1 菌种培养及保藏第26-27页
        2.2.2 细菌DNA的小量提取第27-28页
        2.2.3 DNA片段切胶回收第28页
        2.2.4 大肠杆菌感受态细胞的制备第28-29页
        2.2.5 PCR筛选S.ficellus NRRL8067基因文库第29页
        2.2.6 S.ficellus NRRL8067对两种抗生素的抗性考察第29页
        2.2.7 阻断nrps1的重组质粒的构建第29-31页
        2.2.8 其它重组质粒的构建第31页
        2.2.9 大肠杆菌ET12567与S.ficellus NRRL8067结合转移第31-33页
        2.2.10 双交换阻断株的筛选第33页
        2.2.11 回补菌株的构建第33页
        2.2.12 链霉菌的发酵培养第33页
        2.2.13 以草酸青霉菌为指示菌对发酵液中非昔罗霉素活性的检测第33-34页
        2.2.14 MS/MS和LC-MS检测发酵液第34页
        2.2.15 对非昔罗霉素的生物合成基因簇进行生物信息学分析第34页
    2.3 核苷酸序列登录号第34-35页
3 结果与讨论第35-60页
    3.1 对S.ficellus NRRL8067基因文库的筛选第35-36页
        3.1.1 PCR筛选含nrps基因序列的阳性克隆第35页
        3.1.2 测序结果的序列分析第35-36页
    3.2 非昔罗霉素生物合成基因簇的鉴定第36-53页
        3.2.1 S.ficellus NRRL8067对两种抗生素的抗性考察第36页
        3.2.2 nrps基因的阻断实验第36-45页
        3.2.3 S.ficellusNRRL8067及阻断菌株发酵产物中非昔罗霉素的检测第45-47页
        3.2.4 nrps1阻断菌株的回补实验第47-48页
        3.2.5 染色体步移法寻找nrps1两侧基因第48-49页
        3.2.6 非昔罗霉素生物合成基因簇的序列分析第49-53页
    3.3 非昔罗霉素生物合成基因簇中相关基因的功能分析第53-56页
    3.4 非昔罗霉素的生物合成途径的研究第56-60页
4 结论第60-61页
5 展望第61-62页
6 参考文献第62-68页
7 攻读硕士期间发表论文情况第68-69页
8 致谢第69页

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