| 摘要 | 第5-6页 |
| Abstract | 第6页 |
| 第一章 前言 | 第10-19页 |
| 1.1 黄曲霉(Aspergillus flavus)概述 | 第10-14页 |
| 1.1.1 黄曲霉菌 | 第10页 |
| 1.1.2 黄曲霉毒素 | 第10-14页 |
| 1.2 槲皮素控制黄曲霉菌及毒素 | 第14-15页 |
| 1.2.1 槲皮素 | 第14-15页 |
| 1.2.2 槲皮素控制黄曲霉及毒素的机制 | 第15页 |
| 1.3 转录组技术及应用 | 第15-18页 |
| 1.3.1 转录组学概述 | 第15-17页 |
| 1.3.2 RNA-seq技术在黄曲霉测序中的应用 | 第17-18页 |
| 1.4 研究的目的及意义 | 第18页 |
| 1.5 研究内容 | 第18-19页 |
| 第二章 槲皮素抑制黄曲霉生长及毒素合成 | 第19-23页 |
| 2.1 引言 | 第19页 |
| 2.2 材料与试剂 | 第19-20页 |
| 2.2.1 菌株 | 第19页 |
| 2.2.2 试剂 | 第19页 |
| 2.2.3 培养基 | 第19-20页 |
| 2.3 实验方法 | 第20页 |
| 2.3.1 MTT法检测槲皮素抑制黄曲霉菌生长 | 第20页 |
| 2.3.2 AFB1提取及含量测定 | 第20页 |
| 2.4 结果与分析 | 第20-22页 |
| 2.4.1 槲皮素抑制黄曲霉菌生长 | 第20-21页 |
| 2.4.2 槲皮素抑制黄曲霉毒素合成 | 第21-22页 |
| 2.5 本章小结 | 第22-23页 |
| 第三章 黄曲霉菌转录组样本的制备及上机测序 | 第23-29页 |
| 3.1 引言 | 第23页 |
| 3.2 材料与试剂 | 第23-24页 |
| 3.2.1 菌株 | 第23页 |
| 3.2.2 试剂 | 第23页 |
| 3.2.3 培养基 | 第23-24页 |
| 3.3 实验方法 | 第24-26页 |
| 3.3.1 Total RNA的提取 | 第24页 |
| 3.3.2 RNA样品质量检测 | 第24-25页 |
| 3.3.3 文库构建及上机测序 | 第25-26页 |
| 3.4 结果与分析 | 第26-28页 |
| 3.4.1 黄曲霉RNA样品制备 | 第26-27页 |
| 3.4.2 NanoDrop 1000核酸定量仪检测样品质量 | 第27页 |
| 3.4.3 Agilent Technologies 2100 Bioanalyzer分析黄曲霉RNA样品完整性 | 第27-28页 |
| 3.4.4 RNA-seq文库制备及测序 | 第28页 |
| 3.5 本章小结 | 第28-29页 |
| 第四章 基于RNA-seq技术揭示槲皮素抑制黄曲霉生长及AF合成机制 | 第29-50页 |
| 4.1 引言 | 第29页 |
| 4.2 数据来源 | 第29页 |
| 4.3 RNA-seq测序数据分析 | 第29-33页 |
| 4.3.1 数据分析流程 | 第29-30页 |
| 4.3.2 转录组原始数据的质控 | 第30页 |
| 4.3.3 A/T/G/C含量分布检查 | 第30页 |
| 4.3.4 参考序列比对分析 | 第30页 |
| 4.3.5 转录本表达水平统计及定量分析 | 第30-31页 |
| 4.3.6 转录本表达估计质量控制 | 第31页 |
| 4.3.7 基因差异表达分析 | 第31-32页 |
| 4.3.8 实时荧光定量PCR(qPCR)检测 | 第32-33页 |
| 4.4 结果与分析 | 第33-50页 |
| 4.4.1 数据概况 | 第33-35页 |
| 4.4.2 参考序列比对分析 | 第35-37页 |
| 4.4.3 基因表达水平分析 | 第37-40页 |
| 4.4.4 基因差异表达分析 | 第40-47页 |
| 4.4.5 槲皮素抑制黄曲霉生长的调控机制 | 第47-48页 |
| 4.4.6 槲皮素抑制黄曲霉AF合成的调控机制 | 第48-50页 |
| 结论 | 第50-51页 |
| 参考文献 | 第51-55页 |
| 致谢 | 第55-56页 |
| 个人简历 | 第56-57页 |
