| 摘要 | 第10-14页 |
| ABSTRACT | 第14-19页 |
| 缩略语中英文对照(Abbrebiation) | 第20-21页 |
| 第一篇 文献综述 | 第21-51页 |
| 第一章 禽类产蛋性能研究现状 | 第21-31页 |
| 1 性成熟家禽卵泡的发育 | 第21-26页 |
| 1.1 家禽卵泡等级发育的特点 | 第21-22页 |
| 1.2 家禽卵泡发育的阶段划分 | 第22-24页 |
| 1.2.1 原始卵泡 | 第23页 |
| 1.2.2 生长卵泡 | 第23页 |
| 1.2.3 成熟卵泡 | 第23-24页 |
| 1.3 家禽卵泡的闭锁 | 第24-26页 |
| 2 卵泡颗粒细胞对卵泡的调控作用 | 第26-27页 |
| 2.1 颗粒细胞在卵泡发育过程中的调控作用 | 第26-27页 |
| 2.2 颗粒细胞与卵母细胞的生长成熟 | 第27页 |
| 3 卵泡膜细胞对卵泡生长发育的调控作用 | 第27-28页 |
| 4 鹅产蛋性能遗传基础研究 | 第28-31页 |
| 第二章 基因组测序技术的发展与应用 | 第31-35页 |
| 1 DNA测序技术的发展 | 第31页 |
| 2 基因组测序技术在动物科学研究上的应用 | 第31-32页 |
| 3 简化基因组测序(RAD-sequencing) | 第32-35页 |
| 第三章 畜禽育种目标与选择技术研究 | 第35-39页 |
| 1 畜禽育种目标的确定 | 第35页 |
| 2 畜禽选择方法 | 第35-36页 |
| 3 分子遗传标记辅助选择 | 第36-39页 |
| 3.1 遗传标记 | 第37页 |
| 3.2 单核苷酸多态性标记(SNP) | 第37页 |
| 3.3 SNP的检测方法 | 第37-39页 |
| 第四章 鹅育种工作存在的问题与现状 | 第39-41页 |
| 1 鹅育种工作存在的问题 | 第39页 |
| 2 鹅育种工作的现状 | 第39-41页 |
| 参考文献 | 第41-51页 |
| 第二篇 实验部分 | 第51-157页 |
| 第一章 运用简化基因组测序技术筛选鹅产蛋性能相关候选SNP | 第51-85页 |
| 1 材料与方法 | 第51-60页 |
| 1.1 实验动物 | 第51页 |
| 1.2 主要试剂和仪器 | 第51-52页 |
| 1.2.1 主要试剂及配制 | 第51-52页 |
| 1.2.2 仪器 | 第52页 |
| 1.3 实验鹅产蛋性能与分组 | 第52-53页 |
| 1.4 RAD文库的准备与测序 | 第53页 |
| 1.5 测序结果的分析与突变位点的鉴定 | 第53-54页 |
| 1.6 候选SNP的群体验证 | 第54-55页 |
| 1.6.1 聚合酶链式反应(PCR) | 第55页 |
| 1.6.2 禽血DNA提取步骤 | 第55页 |
| 1.7 鹅产蛋性能相关基因的鉴定 | 第55-59页 |
| 1.7.1 反向PCR实验步骤 | 第56-58页 |
| 1.7.2 TA克隆及测序 | 第58-59页 |
| 1.8 数据统计与分析 | 第59-60页 |
| 2 实验结果 | 第60-72页 |
| 2.1 简化基因组测序结果 | 第60-61页 |
| 2.2 产蛋相关SNP的挖掘 | 第61-63页 |
| 2.3 候选SNP的群体验证 | 第63-69页 |
| 2.4 产蛋量相关标记的多标记线性回归分析 | 第69-70页 |
| 2.5 产蛋性能相关SNP功能基因的鉴定 | 第70-72页 |
| 3 讨论 | 第72-79页 |
| 3.1 池DNA RAD-sequencing | 第72-74页 |
| 3.2 产蛋量相关SNP的发掘 | 第74页 |
| 3.3 SNP与产蛋量的相关性分析 | 第74-75页 |
| 3.4 鹅产蛋性能相关基因的克隆 | 第75-76页 |
| 3.5 基于高通量测序的基因分型技术 | 第76-79页 |
| 参考文献 | 第79-85页 |
| 第二章 ACSF2基因克隆及基因表达分析 | 第85-115页 |
| 1 材料与方法 | 第85-95页 |
| 1.1 实验动物及样品采集 | 第85-86页 |
| 1.1.1 实验动物 | 第85-86页 |
| 1.1.2 样品采集 | 第86页 |
| 1.2 主要试剂和仪器 | 第86-87页 |
| 1.2.1 主要试剂 | 第86-87页 |
| 1.2.2 主要仪器设备 | 第87页 |
| 1.3 RNA提取和cDNA合成 | 第87-88页 |
| 1.3.1 RNA提取 | 第87页 |
| 1.3.2 cDNA的合成 | 第87-88页 |
| 1.4 ACSF2基因克隆与剪接体的发现 | 第88-90页 |
| 1.4.1 ACSF2基因克隆 | 第88页 |
| 1.4.2 ACSF2剪接体的克隆 | 第88-90页 |
| 1.5 pEGFP-ACSF2表达载体的构建与亚细胞定位 | 第90-92页 |
| 1.5.1 pEGFP-ACSF2表达载体的构建 | 第90-91页 |
| 1.5.2 ACSF2基因的亚细胞定位 | 第91-92页 |
| 1.6 ACSF2基因在组织中的表达 | 第92-93页 |
| 1.6.1 半定量RT-PCR | 第92页 |
| 1.6.2 实时荧光定量PCR | 第92-93页 |
| 1.7 鹅卵泡颗粒细胞的分离、培养及过表达 | 第93-94页 |
| 1.7.1 鹅卵泡颗粒细胞的分离 | 第93页 |
| 1.7.2 鹅卵泡颗粒细胞生长曲线绘制 | 第93页 |
| 1.7.3 ACSF2基因在鹅卵泡颗粒细胞的过表达 | 第93-94页 |
| 1.8 siRNA的准备与转染 | 第94页 |
| 1.9 生物信息学分析 | 第94-95页 |
| 2 实验结果 | 第95-107页 |
| 2.1 ACSF2基因的克隆 | 第95-97页 |
| 2.2 ACSF2氨基酸序列比对及系统发育分析 | 第97-98页 |
| 2.3 鹅ACSF2基因四种剪接体及结构分析 | 第98-100页 |
| 2.4 ACSF2基因四种剪接体蛋白的亚细胞定位 | 第100-101页 |
| 2.5 卵泡的发育 | 第101-102页 |
| 2.6 鹅ACSF2基因在不同组织器官中的表达 | 第102-103页 |
| 2.7 ACSF2基因在高产蛋组和低产蛋组卵巢组织中的差异表达 | 第103-105页 |
| 2.8 ACSF2基因过表达与siRNA干扰 | 第105-107页 |
| 2.8.1 鹅卵泡颗粒细胞的生长曲线 | 第105页 |
| 2.8.2 ACSF2基因对鹅卵泡颗粒细胞中Caspase-3基因表达的影响 | 第105-107页 |
| 3 讨论 | 第107-111页 |
| 参考文献 | 第111-115页 |
| 第三章 MAGI1基因克隆及基因表达分析 | 第115-133页 |
| 1 材料与方法 | 第115-118页 |
| 1.1 主要试剂和仪器 | 第115页 |
| 1.2 实验动物及样品采集 | 第115页 |
| 1.2.1 实验动物 | 第115页 |
| 1.2.2 样品采集 | 第115页 |
| 1.3 RNA提取和cDNA合成 | 第115-116页 |
| 1.4 MAGI1基因克隆与剪接体的发现 | 第116-117页 |
| 1.4.1 MAGI1基因克隆 | 第116页 |
| 1.4.2 MAGI1不同剪接体的克隆 | 第116-117页 |
| 1.5 pEGFP-MAGI1表达载体的构建 | 第117页 |
| 1.6 MAGI1基因在组织中的表达 | 第117页 |
| 1.6.1 半定量RT-PCR | 第117页 |
| 1.6.2 实时荧光定量PCR | 第117页 |
| 1.7 鹅卵泡颗粒细胞的分离、培养及过表达 | 第117页 |
| 1.8 siRNA的准备与转染 | 第117-118页 |
| 1.9 生物信息学分析 | 第118页 |
| 2 实验结果 | 第118-127页 |
| 2.1 MAGI1基因的克隆 | 第118-119页 |
| 2.2 MAGI1基因不同剪接体鉴定 | 第119-122页 |
| 2.3 MAGI1氨基酸序列及系统发育分析 | 第122-123页 |
| 2.4 鹅MAGI1基因在不同组织器官中的表达 | 第123-124页 |
| 2.5 MAGI1基因在高产蛋组和低产蛋组卵巢组织中的差异表达 | 第124-125页 |
| 2.6 MAGI1基因过表达与siRNA干扰 | 第125-127页 |
| 3 讨论 | 第127-131页 |
| 参考文献 | 第131-133页 |
| 第四章 PAPPA基因克隆及基因表达分析 | 第133-149页 |
| 1、材料与方法 | 第133-135页 |
| 1.1 实验动物及样品采集 | 第133页 |
| 1.1.1 实验动物 | 第133页 |
| 1.1.2 样品采集 | 第133页 |
| 1.2 主要试剂和仪器 | 第133页 |
| 1.3 RNA提取和cDNA合成 | 第133页 |
| 1.4 PAPPA基因克隆 | 第133-134页 |
| 1.5 pEGFP-PAPPA表达载体的构建 | 第134-135页 |
| 1.6 PAPPA基因在组织中的表达 | 第135页 |
| 1.7 鹅卵泡颗粒细胞的分离、培养及过表达 | 第135页 |
| 1.8 生物信息学分析 | 第135页 |
| 2 实验结果 | 第135-141页 |
| 2.1 PAPPA基因的克隆 | 第135-136页 |
| 2.2 PAPPA基因氨基酸序列及系统发育分析 | 第136-138页 |
| 2.3 鹅PAPPA基因在不同组织器官中的表达 | 第138-139页 |
| 2.4 PAPPA基因在高产蛋组和低产蛋组卵巢组织中的差异表达 | 第139-140页 |
| 2.5 PAPPA基因过表达对卵泡颗粒细胞的影响 | 第140-141页 |
| 3 讨论 | 第141-145页 |
| 参考文献 | 第145-149页 |
| 第五章 鹅分子标记辅助选择育种 | 第149-157页 |
| 1 材料与方法 | 第149-151页 |
| 1.1 实验动物及样品采集 | 第149页 |
| 1.2 DNA提取 | 第149页 |
| 1.3 AS-PCR基因分型 | 第149-150页 |
| 1.4 选种选育方案 | 第150页 |
| 1.5 数据资料 | 第150-151页 |
| 1.6 数据统计分析 | 第151页 |
| 2 实验结果 | 第151-153页 |
| 2.1 候选SNP第七世代的群体验证 | 第151-152页 |
| 2.2 种鹅的选留 | 第152页 |
| 2.3 第九世代鹅群基因分型结果 | 第152-153页 |
| 2.4 育种核心群组建 | 第153页 |
| 3 讨论 | 第153-155页 |
| 参考文献 | 第155-157页 |
| 全文结论 | 第157-159页 |
| 创新点 | 第159-161页 |
| 致谢 | 第161-163页 |
| 攻读博士学位期间发表的论文 | 第163-165页 |
| 附录 | 第165-170页 |
| 附表一 候选SNP及AS-PCR基因分型引物 | 第165-170页 |
