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虎耳草科的分子系统发育、时间分化及其生物地理学研究

摘要第1-7页
ABSTRACT第7-11页
第一章 进化生物学及生物地理学研究概况第11-19页
 1 进化生物学研究概况第11-15页
   ·进化生物学第11-13页
   ·分子系统学和植物分子系统学研究现状第13-15页
 2 生物地理学研究现状第15-18页
 3 小结第18-19页
第二章 虎耳草科的研究背景与研究概况第19-31页
 1 虎耳草科的研究背景第19-20页
   ·虎耳草科的概况第19页
   ·虎耳草科的描述第19-20页
 2 虎耳草科研究概况第20-28页
   ·虎耳草科系统的研究历史第20-22页
   ·形态及解剖学研究第22-24页
   ·核型研究第24页
   ·传粉学研究第24-25页
   ·化学分类研究第25页
   ·分子系统学研究第25-28页
   ·虎耳草科的分化、起源及生物地理学研究第28页
 3 立题依据第28-29页
 4 本研究的内容与目的意义第29-31页
第三章 虎耳草科分子系统发育研究第31-83页
 1 材料与方法第31-67页
   ·研究样本第31页
   ·数据来源第31-67页
     ·GenBank数据第31-32页
     ·One KP数据第32-61页
     ·本研究新扩增序列数据第61-67页
 2 数据矩阵构建第67-68页
   ·序列比对及手工校正第67页
   ·联合矩阵构建第67-68页
 3 系统进化树的构建第68-69页
   ·矩阵模型分析第68页
   ·贝叶斯推论分析第68-69页
   ·最大似然分析第69页
 4 结果分析第69-77页
   ·基于nrDNA的系统进化树分析第69-70页
   ·基于cpDNA的系统进化树分析第70页
   ·基于cpDNA+nrDNA矩阵的系统发育关系第70-77页
 5 讨论第77-83页
   ·命名检查第77页
   ·主要类群的拓扑结构比较第77-80页
   ·主要类群之间的系统关系第80-81页
   ·变豆叶草属在虎耳草科中的系统位置第81-83页
第四章 虎耳草科的时间分化和生物地理学研究第83-95页
 1 材料与方法第83-84页
   ·数据矩阵选择第83-84页
   ·BEAST分析的参数及核酸替代模型选择第84页
 2 分化时间分析第84-85页
   ·化石信息第84-85页
   ·化石标定点及其相关参数第85页
 3 生物地理分析第85-87页
   ·拓扑结构选择及其可行性第85-86页
   ·虎耳草科的地理分布划分标准第86页
   ·祖先地理构建(AAR)第86-87页
 4 结果与分析第87-92页
   ·分化时间推算第87-89页
   ·祖先地理分布重建第89-92页
 5 讨论第92-95页
   ·Cascadia类群和Heuchera类群对分析的影响第92页
   ·虎耳草科的起源、分化及经白令路桥的长距离传播第92-94页
   ·涧边草类群与日本海的关系第94-95页
结论与展望第95-97页
 1 结论第95-96页
 2 展望第96-97页
参考文献第97-108页
致谢第108-110页
在读期间科研成果第110-113页
附图第113-116页

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