微生物必需基因数据的分析
摘要 | 第1-4页 |
ABSTRACT | 第4-10页 |
第一章 绪论 | 第10-18页 |
·生物信息学的主要内容 | 第10-12页 |
·微生物的多样性与微生物基因组 | 第12-13页 |
·必需基因的发展 | 第13-18页 |
·必需基因与最小基因集合 | 第13-14页 |
·比较基因组学方法 | 第14-16页 |
·实验方法 | 第16-18页 |
第二章 必需基因的收集与DEG 数据库 | 第18-26页 |
·引言 | 第18-19页 |
·数据库更新概要 | 第19-22页 |
·数据库的描述 | 第22-25页 |
·原核生物的必需基因 | 第22-23页 |
·真核生物的必需基因 | 第23-24页 |
·用户界面和数据访问 | 第24-25页 |
·结论与展望 | 第25-26页 |
第三章 微生物必需基因的组成与分布 | 第26-49页 |
·引言 | 第26-27页 |
·序列长度 | 第27页 |
·GC 含量 | 第27-28页 |
·核苷酸组成 | 第28-30页 |
·氨基酸含量 | 第30-44页 |
·在COG 中的分布 | 第44-49页 |
第四章 必需基因的功能性与基因分布的链偏差 | 第49-63页 |
·引言 | 第49-50页 |
·材料与方法 | 第50-53页 |
·数据集 | 第50-51页 |
·DNA 双链的确定 | 第51页 |
·统计分析 | 第51-53页 |
·结果与讨论 | 第53-61页 |
·必需基因的链偏差取决于功能 | 第53-60页 |
·功能性驱动链偏差的生物学意义 | 第60-61页 |
·LS-DEG 数据库 | 第61页 |
·结论 | 第61-63页 |
参考文献 | 第63-72页 |
发表论文和参加科研情况说明 | 第72-73页 |
附录 | 第73-82页 |
致谢 | 第82页 |