基于Hi-C数据特征的染色体3D结构建模

目录	第1-5页
摘要	第5-6页
Abstract	第6-7页
缩略语表	第7-8页
1 前言	第8-18页
·研究问题的由来	第8-10页
·文献综述	第10-16页
·3D基因组研究方法	第10-12页
·3D基因组结构剖析	第12-15页
·3D基因组建模方法	第15-16页
·研究目的	第16-18页
2 材料与方法	第18-32页
·数据来源	第18页
·数据预处理	第18-20页
·AutoChrom3D实现方法	第20-27页
·染色质粗粒化	第20页
·结构参数的确定	第20-21页
·数据评估和过滤	第21-22页
·交互强度的修正	第22-23页
·空间距离的转化与标准化	第23-27页
·3D染色质结构预测	第27页
·ENCODE数据处理	第27-29页
·选取的ENCODE数据介绍	第27-28页
·ENCODE数据处理与归一化	第28-29页
·建模区域的选择与比较	第29-32页
3 结果与分析	第32-46页
·测序深度对Hi-C数据的影响	第32-37页
·选择不同结构参数对染色质结构建模的影响	第37页
·AutoChrom3D流程总结	第37-39页
·建模结果的应用	第39-46页
4 结论	第46-48页
参考文献	第48-53页
附录	第53-54页
致谢	第54页