甘蓝型油菜EST-SNP开发及花色性状的QTL定位
| 摘要 | 第1-5页 |
| Abstract | 第5-6页 |
| 目录 | 第6-9页 |
| 第一章 绪论 | 第9-20页 |
| ·引言 | 第9页 |
| ·EST-SNP开发及其在油菜中的研究进展 | 第9-12页 |
| ·SNP简介 | 第9-10页 |
| ·通过生物信息学分析开发EST-SNP的研究 | 第10-11页 |
| ·油菜SNP开发现状 | 第11页 |
| ·多倍体植物中SNP开发的障碍 | 第11-12页 |
| ·SNP的检测研究进展 | 第12-14页 |
| ·SNP的检测方法及其分子机理 | 第12页 |
| ·等位基因特异性引物延伸法检测SNP | 第12-14页 |
| ·甘蓝型油菜花色研究现状 | 第14-18页 |
| ·油菜花色的研究意义 | 第14页 |
| ·油菜花色的种类及其来源 | 第14-16页 |
| ·油菜花色的遗传 | 第16页 |
| ·油菜花色与其他性状的关联 | 第16页 |
| ·油菜花色的观察和记录 | 第16-17页 |
| ·甘蓝型油菜花色的分子生物学研究 | 第17-18页 |
| ·本研究的目的和意义 | 第18-20页 |
| 第二章 基于公共数据库的EST-SNP开发 | 第20-28页 |
| ·数据资源和方法 | 第20-22页 |
| ·EST序列和待屏蔽背景序列的获取 | 第20页 |
| ·EST原始序列的前期处理 | 第20-21页 |
| ·TGICL程序对EST序列的聚类和拼接 | 第21页 |
| ·候选SNP挖掘以及SNP数据库的建立 | 第21页 |
| ·Blat软件比对构建物理图谱框架 | 第21-22页 |
| ·结果与分析 | 第22-26页 |
| ·EST序列预处理关键参数的确定 | 第22-23页 |
| ·甘蓝型油菜EST-SNP挖掘结果对比 | 第23-24页 |
| ·SNP的发生与read数量的关系 | 第24-25页 |
| ·SNP分布统计 | 第25页 |
| ·SNP类型分析 | 第25-26页 |
| ·基因组关联的物理图谱的构建 | 第26页 |
| ·讨论与小结 | 第26-28页 |
| 第三章 等位基因特异性PCR的SNP检测平台 | 第28-38页 |
| ·材料和方法 | 第28-29页 |
| ·材料的选择和制备 | 第28页 |
| ·引物设计与合成 | 第28-29页 |
| ·PCR体系和程序 | 第29页 |
| ·扩增产物检测 | 第29页 |
| ·结果与分析 | 第29-37页 |
| ·不同Taq酶对检测分辨率的影响 | 第29-30页 |
| ·引物特定位点人工错配对检测分辨率的影响 | 第30-31页 |
| ·模板浓度对检测分辨率的影响 | 第31-33页 |
| ·外部引物对内部引物扩增的影响 | 第33-36页 |
| ·基于PASA法的SNP检测策略初探 | 第36-37页 |
| ·讨论与小结 | 第37-38页 |
| 第四章 甘蓝型油菜白花性状的QTL定位 | 第38-49页 |
| ·材料和方法 | 第38-40页 |
| ·甘蓝型油菜白花性状作图群体的构建 | 第38页 |
| ·花色性状采集 | 第38页 |
| ·油菜总DNA提取与检测 | 第38-39页 |
| ·SSR标记引物的选择 | 第39页 |
| ·极端性状DNA池的构建 | 第39页 |
| ·多态性分析 | 第39页 |
| ·遗传分析和QTL检测 | 第39-40页 |
| ·结果与分析 | 第40-47页 |
| ·花瓣色素萃取液吸光值测定波长的确定 | 第40-41页 |
| ·试验材料性状与油菜呈色表现 | 第41-43页 |
| ·甘蓝型油菜花色性状的遗传分析 | 第43-46页 |
| ·遗传连锁图谱的构建 | 第46页 |
| ·白花性状控制基因的QTL检测 | 第46-47页 |
| ·白花性状与油菜重要性状的相关分析 | 第47页 |
| ·讨论与小结 | 第47-49页 |
| 第五章 总结和展望 | 第49-51页 |
| 参考文献 | 第51-60页 |
| 致谢 | 第60-61页 |
| 附录 | 第61-70页 |
