| 摘要 | 第1-5页 |
| Abstract | 第5-9页 |
| 1 绪论 | 第9-17页 |
| ·经典分子动力学模拟技术方法 | 第9-11页 |
| ·势参数的确定 | 第9-10页 |
| ·有限差分算法技术 | 第10-11页 |
| ·分子动力学系综分类 | 第11页 |
| ·电离辐射 | 第11-12页 |
| ·电离辐射基本概念 | 第11页 |
| ·电离辐射重要特点 | 第11-12页 |
| ·电离辐射两种分类 | 第12页 |
| ·生物分子受电离辐射作用的影响 | 第12-17页 |
| ·对生物大分子辐照的基本原理 | 第12页 |
| ·电离辐射对DNA的作用 | 第12-13页 |
| ·蛋白质与酶受电离辐射后的影响 | 第13-17页 |
| 2 理论模型 | 第17-27页 |
| ·预备知识 | 第17-19页 |
| ·核酸和碱基 | 第17-18页 |
| ·分子动力学(Molecular Dynamics)模拟方法 | 第18-19页 |
| ·分子动力学模型——半经验势 | 第19-25页 |
| ·相关计算参数 | 第25-27页 |
| ·计算模拟中的相关计算方法——蛙跳法速度校正法 | 第25页 |
| ·速度校正法(rescaling velocity method) | 第25-26页 |
| ·原子的质心动量的干扰 | 第26-27页 |
| 3 计算结果和讨论 | 第27-42页 |
| ·尿嘧啶分子的相关振动性质 | 第28-37页 |
| ·尿嘧啶分子键长,键角的变化 | 第30-31页 |
| ·该分子中原子的受力情况 | 第31-32页 |
| ·该分子中原子的位移情况 | 第32-34页 |
| ·该分子中原子的速度 | 第34-36页 |
| ·该分子中原子的加速度 | 第36-37页 |
| ·尿嘧啶分子空间分布图 | 第37-39页 |
| ·尿嘧啶分子受热辐射的影响 | 第39-42页 |
| 4 结论 | 第42-43页 |
| 参考文献 | 第43-47页 |
| 攻读硕士学位期间发表的论文 | 第47-48页 |
| 致谢 | 第48-50页 |