基于图的蛋白质相互作用网络比对方法
| 摘要 | 第1-4页 |
| Abstract | 第4-7页 |
| 第一章 绪论 | 第7-13页 |
| ·本课题的背景及其研究意义 | 第7-9页 |
| ·国内外研究现状 | 第9-11页 |
| ·本文的工作以及组织结构 | 第11-13页 |
| 第二章 网络比对的相关问题 | 第13-25页 |
| ·图论与蛋白质相互作用网络 | 第13-15页 |
| ·图的相关理论 | 第13-14页 |
| ·蛋白质相互作用网络 | 第14-15页 |
| ·网络比对概述 | 第15-18页 |
| ·网络比对的定义 | 第15-16页 |
| ·网络比对的特点 | 第16-17页 |
| ·网络比对的分类 | 第17-18页 |
| ·几种常见的网络比对算法 | 第18-23页 |
| ·MaWISH 比对方法 | 第18-20页 |
| ·NetworkBLAST 比对方法 | 第20-21页 |
| ·Gr mlin 比对方法 | 第21-22页 |
| ·Match-and-Split 比对方法 | 第22-23页 |
| ·网络比对的应用 | 第23-25页 |
| ·结构预测 | 第23页 |
| ·功能预测 | 第23-24页 |
| ·系统发生分析 | 第24-25页 |
| 第三章 蛋白质相似性分析 | 第25-33页 |
| ·蛋白质相似性 | 第25-28页 |
| ·蛋白质序列数据 | 第25-26页 |
| ·蛋白质相似性定义 | 第26-27页 |
| ·蛋白质序列比对 | 第27-28页 |
| ·基于图的蛋白质相似性 | 第28-33页 |
| ·相关定义 | 第28页 |
| ·算法的基本思想 | 第28-30页 |
| ·实验结果 | 第30-33页 |
| 第四章 基于图的蛋白质网络比对 | 第33-41页 |
| ·算法的基本思想 | 第33页 |
| ·算法的步骤 | 第33-36页 |
| ·比对问题建模 | 第33-35页 |
| ·相似性计算 | 第35页 |
| ·映射关系提取 | 第35页 |
| ·保守模块搜索 | 第35-36页 |
| ·算法的改进 | 第36-37页 |
| ·实验结果及分析 | 第37-41页 |
| ·合成数据实验 | 第37页 |
| ·真实数据实验 | 第37-41页 |
| 第五章 总结与展望 | 第41-43页 |
| 致谢 | 第43-45页 |
| 参考文献 | 第45-49页 |
| 研究成果 | 第49-50页 |
