| 摘要 | 第1-6页 |
| Abstract | 第6-11页 |
| 1 前言 | 第11-23页 |
| ·文献综述 | 第11-16页 |
| ·植物的遗传多样性及其意义 | 第11页 |
| ·橡胶树种质资源的遗传多样性研究 | 第11-13页 |
| ·SSR和EST-SSR | 第13-15页 |
| ·遗传结构分析 | 第15页 |
| ·核心种质构建 | 第15-16页 |
| ·遗传参数统计及原理 | 第16-21页 |
| ·遗传多样性参数 | 第16-18页 |
| ·哈迪-温伯格平衡(Hardy-weinberg Equilibrium,HWE)检验 | 第18页 |
| ·连锁不平衡(Linkage disequilibrium,LD)分析 | 第18-19页 |
| ·基因流分析及遗传分化度量 | 第19-20页 |
| ·固定指数(Fixation index)或F统计(F-statistics) | 第19-20页 |
| ·基因流(gene flow,Nm)分析 | 第20页 |
| ·遗传距离(geneti distance,GD)和遗传一致度(genetic identity,GI) | 第20-21页 |
| ·系统树构建常用的两种方法NJ法和UPGMA法 | 第21页 |
| ·本实验的目的和意义 | 第21-22页 |
| ·本实验的目的 | 第21页 |
| ·本实验的意义 | 第21-22页 |
| ·本实验的技术路线 | 第22-23页 |
| 2 材料与方法 | 第23-29页 |
| ·发掘EST-SSRs的材料与方法 | 第23-26页 |
| ·材料 | 第23-24页 |
| ·植物材料 | 第23页 |
| ·ESTs | 第23-24页 |
| ·方法 | 第24-26页 |
| ·计算机软硬件平台 | 第24页 |
| ·ESTs预处理 | 第24页 |
| ·拼接 | 第24页 |
| ·SSR检索 | 第24页 |
| ·SSR引物的设计 | 第24-25页 |
| ·DNA提取和纯化 | 第25页 |
| ·PCR扩增 | 第25页 |
| ·PAGE及银染检测 | 第25-26页 |
| ·遗传多样性分析的材料与方法 | 第26-29页 |
| ·实验材料 | 第26页 |
| ·实验方法 | 第26页 |
| ·统计分析 | 第26-28页 |
| ·遗传多样性分析 | 第26-27页 |
| ·哈迪-温伯格平衡(Hardy-weinberg Equilibrium,HWE)检验 | 第27页 |
| ·连锁不平衡(Linkage disequilibrium,LD)分析 | 第27页 |
| ·聚类分析 | 第27页 |
| ·遗传分化分析 | 第27页 |
| ·个体水平的群体结构分析 | 第27-28页 |
| ·核心种质构建材料与方法 | 第28-29页 |
| ·核心种质构建材料 | 第28页 |
| ·核心种质的构建方法 | 第28页 |
| ·核心种质的遗传多样性分析 | 第28-29页 |
| 3 结果与分析 | 第29-52页 |
| ·橡胶树EST-SSR标记开发 | 第29-30页 |
| ·遗传多样性结果与分析 | 第30-32页 |
| ·25个EST-SSR位点遗传多样性分析 | 第30-31页 |
| ·不同橡胶树群体的遗传多样性分析 | 第31-32页 |
| ·聚类分析 | 第32-35页 |
| ·橡胶树种质个体间遗传关系的聚类分析 | 第32-34页 |
| ·群体遗传关系聚类分析 | 第34-35页 |
| ·Hardy-Winbery平衡测验 | 第35-38页 |
| ·位点间连锁不平衡(Linkage disequilibrium,LD)分析 | 第38-39页 |
| ·遗传结构结果与分析 | 第39-50页 |
| ·遗传分化度量和基因流分析 | 第39-44页 |
| ·F-统计(F-Statistics) | 第39-42页 |
| ·基因分化系数(Gst) | 第42-43页 |
| ·AMOVA(Analysis of Molecular Variance)分析 | 第43页 |
| ·基因流(Nm)分析 | 第43-44页 |
| ·遗传结构分析 | 第44-50页 |
| ·GENECLASS | 第44页 |
| ·BAPS | 第44-45页 |
| ·STRUCTURE | 第45-50页 |
| ·核心种质 | 第50-52页 |
| ·核心种质的构建 | 第50页 |
| ·核心种质的组成 | 第50-51页 |
| ·核心种质的遗传多样性分析 | 第51页 |
| ·核心种质聚类分析 | 第51-52页 |
| 4 讨论 | 第52-58页 |
| ·橡胶树EST-SSRs发掘 | 第52-53页 |
| ·橡胶树种质遗传多样性 | 第53-54页 |
| ·丰富的稀有等位基因 | 第53页 |
| ·遗传多样性水平 | 第53-54页 |
| ·聚类分析 | 第54-55页 |
| ·Hardy-Winbery平衡测验 | 第55页 |
| ·连锁不平衡分析 | 第55-56页 |
| ·遗传结构分析 | 第56页 |
| ·F统计和基因流分析 | 第56页 |
| ·亚群结构划分 | 第56页 |
| ·核心种质 | 第56-58页 |
| 5 结论 | 第58-60页 |
| 参考文献 | 第60-66页 |
| 致谢 | 第66页 |
