| 摘要 | 第1-9页 |
| Abstract | 第9-10页 |
| 图表清单 | 第10-11页 |
| 缩略词表 | 第11-12页 |
| 前言 | 第12-13页 |
| 1. 文献综述 | 第13-28页 |
| ·稻田资源概况 | 第13页 |
| ·生物固氮与生物固氮的研究意义 | 第13-15页 |
| ·生物固氮作用机理的研究概况 | 第14-15页 |
| ·固氮细菌 | 第15-17页 |
| ·自生固氮细菌 | 第15页 |
| ·好氧性细菌 | 第15页 |
| ·兼性厌氧细菌 | 第15页 |
| ·专性厌氧性细菌 | 第15页 |
| ·共生固氮细菌 | 第15-16页 |
| ·与豆科植物互利共生的根瘤茵 | 第15-16页 |
| ·与非豆科植物共生的固氮细菌 | 第16页 |
| ·联合固氮细菌 | 第16-17页 |
| ·固氮细菌鉴定 | 第17-18页 |
| ·16SrDNA序列分析 | 第17-18页 |
| ·nifH基因序列分析 | 第18页 |
| ·微生物群落结构研究方法进展 | 第18-22页 |
| ·生物标志物法(Biomarker) | 第18页 |
| ·BIOLOG微平板研究单一碳源底物利用能力(SCSU) | 第18-19页 |
| ·以PCR为基础的rDNA分析方法 | 第19-22页 |
| ·DGGE和TGGE | 第19页 |
| ·ARDRA | 第19页 |
| ·T-RFLP | 第19-20页 |
| ·SSCP | 第20-21页 |
| ·随机扩增多态性DNA(RAPD)分析 | 第21页 |
| ·ERIC-PCR图谱分析 | 第21-22页 |
| ·DGGE综述 | 第22-25页 |
| ·DGGE的原理及应用前景 | 第22-23页 |
| ·DGGE技术的关键环节及系统优化 | 第23-25页 |
| ·PCR扩增的影响 | 第24页 |
| ·最佳变性剂梯度的选择 | 第24页 |
| ·最佳电泳时间和温度的确定 | 第24页 |
| ·染色和测序 | 第24-25页 |
| ·展望 | 第25页 |
| ·生物降解研究进展 | 第25-28页 |
| ·酚类化合物生物降解基因 | 第26-27页 |
| ·固氮细菌在生物降解中的应用前景 | 第27-28页 |
| ·本试验的研究目的和意义 | 第28页 |
| 2. 材料和方法 | 第28-33页 |
| ·材料 | 第28-29页 |
| ·实验材料 | 第28页 |
| ·试验相关的菌种与载体 | 第28页 |
| ·试剂 | 第28-29页 |
| ·方法 | 第29-33页 |
| ·固氮细菌总DNA的提取 | 第29页 |
| ·细菌分离物16S rDNA的扩增 | 第29-30页 |
| ·PCR产物的变性梯度凝胶电泳(DGGE)分析 | 第30-31页 |
| ·不同的变性剂梯度对电泳效果的影响 | 第30页 |
| ·DGGE电泳条带的纯化 | 第30页 |
| ·DGGE条带的测序 | 第30-31页 |
| ·利用选择性培养基对有降解潜能的细菌筛选和纯化 | 第31页 |
| ·苯酚羟化酶基因的PCR扩增及克隆 | 第31-33页 |
| ·PCR扩增 | 第31页 |
| ·PCR产物的TA克隆 | 第31-33页 |
| ·PCR产物的胶回收纯化 | 第31-32页 |
| ·感受态细胞的制备 | 第32页 |
| ·PCR产物的连接、转化 | 第32页 |
| ·克隆检测 | 第32-33页 |
| ·分离菌株鉴定 | 第33页 |
| ·16S rDNA全长序列的扩增 | 第33页 |
| ·16S rDNA全长序列的克隆及同源性分析 | 第33页 |
| ·分离菌株的生理生化鉴定 | 第33页 |
| ·降解特性分析 | 第33页 |
| 3. 结果与分析 | 第33-44页 |
| ·固氮细菌分离物的基本特征 | 第33-34页 |
| ·固氮细菌分离物的16S rDNA扩增结果 | 第34-35页 |
| ·变形梯度凝胶电泳(DGGE)分析结果 | 第35-36页 |
| ·苯酚羟化酶基因的PCR检测及分析 | 第36-38页 |
| ·分离菌株的鉴定 | 第38-42页 |
| ·分离菌株的16S rDNA全长序列的PCR扩增 | 第38-39页 |
| ·测序比对结果 | 第39-40页 |
| ·BC2008系统发育位置 | 第40-41页 |
| ·BC2008的理化鉴定 | 第41-42页 |
| ·BC2008生长特性分析 | 第42-44页 |
| ·底物浓度对细菌生长的影响 | 第42-43页 |
| ·pH值对细菌生长的影响 | 第43页 |
| ·温度对细菌生长的影响 | 第43-44页 |
| 4. 讨论 | 第44-46页 |
| ·DGGE技术用于菌种分离纯化鉴定的可靠性评价 | 第44页 |
| ·影响DGGE检测效果的几个因素 | 第44-45页 |
| ·降解苯酚功能基因的挖掘与菌株筛选 | 第45-46页 |
| 5. 结论 | 第46-47页 |
| 参考文献 | 第47-53页 |
| 附录 | 第53-56页 |
| 致谢 | 第56页 |