| 摘要 | 第1-12页 |
| ABSTRACT | 第12-17页 |
| 英文缩略语 | 第17-18页 |
| 第一章 文献综述 | 第18-40页 |
| ·大豆异黄酮研究进展 | 第18-25页 |
| ·大豆异黄酮概述 | 第18-19页 |
| ·异黄酮对人体的保健功能 | 第19-21页 |
| ·异黄酮在植物中的生理功能 | 第21-22页 |
| ·大豆异黄酮遗传改良研究进展 | 第22-25页 |
| ·SNPs研究进展 | 第25-28页 |
| ·SNPs的频率、分布与特征 | 第25-26页 |
| ·SNPs的筛选及检测 | 第26-28页 |
| ·大豆SNPs研究进展 | 第28页 |
| ·关联分析 | 第28-34页 |
| ·关联分析概念 | 第28-29页 |
| ·连锁不平衡 | 第29-32页 |
| ·关联分析与连锁不平衡结构 | 第32页 |
| ·关联分析与群体结构 | 第32-33页 |
| ·关联分析中的统计方法 | 第33页 |
| ·关联分析的优点 | 第33-34页 |
| ·DNA水平自然选择作用的检测 | 第34-38页 |
| ·基于种内多态性的中性检验 | 第34-37页 |
| ·基于种间差异数据的中性检验 | 第37-38页 |
| ·本研究的目的和意义 | 第38-39页 |
| ·通过核苷酸多态性的研究了解基因的分子进化 | 第38页 |
| ·功能分子标记的开发 | 第38-39页 |
| ·技术路线图 | 第39-40页 |
| 第二章 群体遗传多样性及群体结构分析 | 第40-49页 |
| ·材料与方法 | 第40-44页 |
| ·大豆材料的选取 | 第40页 |
| ·大豆材料的播种 | 第40页 |
| ·大豆总DNA的提取 | 第40-42页 |
| ·SSR标记的选取与合成 | 第42-43页 |
| ·利用SSR引物对大豆材料进行基因型鉴定 | 第43页 |
| ·遗传多样性分析 | 第43-44页 |
| ·群体结构分析 | 第44页 |
| ·结果与分析 | 第44-47页 |
| ·基因型数据的获得 | 第44页 |
| ·遗传多样性分析结果 | 第44-46页 |
| ·群体结构分析结果 | 第46-47页 |
| ·讨论 | 第47-49页 |
| ·基因多态性研究表明所选群体适合进行初步的关联分析 | 第47-48页 |
| ·群体结构分析为后续关联分析奠定基础 | 第48-49页 |
| 第三章 大豆IFS、F3H基因的SNPs、LD分析及其DNA水平自然选择作用的检测 | 第49-73页 |
| ·材料与方法 | 第49-54页 |
| ·实验材料 | 第49页 |
| ·克隆与测序 | 第49-52页 |
| ·序列分析 | 第52-54页 |
| ·结果与分析 | 第54-71页 |
| ·序列比对与单倍型 | 第54-56页 |
| ·核苷酸多态性 | 第56-59页 |
| ·连锁不平衡与重组情况 | 第59-64页 |
| ·中性检验 | 第64-69页 |
| ·系统发育分析 | 第69-71页 |
| ·讨论 | 第71-73页 |
| ·两类IFS基因功能互补 | 第71页 |
| ·IFS基因在进化上比F3H基因更保守 | 第71页 |
| ·高密度的SNPs为关联分析提供足够的遗传分辨率 | 第71-73页 |
| 第四章 大豆IFS1,IFS2和F3H基因SNPs与种子异黄酮含量的关联分析 | 第73-81页 |
| ·材料与方法 | 第73-74页 |
| ·实验材料 | 第73页 |
| ·大豆种子异黄酮提取及测量 | 第73-74页 |
| ·关联分析 | 第74页 |
| ·结果与分析 | 第74-79页 |
| ·种子异黄酮含量 | 第74-76页 |
| ·IFS和F3H基因的SNPs与大豆种子异黄酮含量相关 | 第76-79页 |
| ·讨论 | 第79-81页 |
| ·群体结构的影响 | 第79-80页 |
| ·大豆种子异黄酮含量相关SNPs的发现 | 第80页 |
| ·开发大豆种子异黄酮含量的分子标记 | 第80-81页 |
| 第五章 大豆IFS1,IFS2和F3H基因SNPs与大豆抗生物胁迫(花叶病毒)及非生物胁迫(铝毒,低磷)的关联分析 | 第81-91页 |
| ·材料与方法 | 第81-83页 |
| ·实验材料 | 第81页 |
| ·大豆材料抗花叶病毒(Soybean Mosaic Virus,SMV)鉴定 | 第81-82页 |
| ·大豆材料耐铝毒鉴定 | 第82页 |
| ·大豆材料耐低磷鉴定 | 第82页 |
| ·关联分析 | 第82-83页 |
| ·结果与分析 | 第83-89页 |
| ·表型鉴定结果 | 第83-85页 |
| ·三种抗逆性状与大豆异黄酮含量间的相关性 | 第85页 |
| ·IFS和F3H基因的SNPs与大豆对花叶病毒抗性的关联分析 | 第85-87页 |
| ·IFS和F3H基因的SNPs与大豆耐铝毒性状的关联分析 | 第87-88页 |
| ·IFS基因的SNPs与大豆耐低磷性状的关联分析 | 第88-89页 |
| ·大豆对花叶病毒Sc-7抗性和耐铝毒性状具有重合的显著相关位点 | 第89页 |
| ·讨论 | 第89-91页 |
| ·IFS和F3H基因的SNPs与大豆抗逆性相关 | 第89-90页 |
| ·抗花叶病毒相关SNPs标记的开发 | 第90-91页 |
| 第六章 全文结论 | 第91-93页 |
| ·所选群体适合进行初步的关联分析 | 第91页 |
| ·所选的基因适合进行候选基因关联分析 | 第91页 |
| ·IFS基因在进化上比F3H基因更保守 | 第91页 |
| ·IFS和F3H基因的SNPs与大豆种子异黄酮含量相关 | 第91-92页 |
| ·IFS和F3H基因的SNPs与大豆抗逆性相关 | 第92-93页 |
| 参考文献 | 第93-102页 |
| 致谢 | 第102-104页 |
| 攻读博士学位期间发表及待发表的论文 | 第104页 |
