| 摘要 | 第1-8页 |
| ABSTRACT | 第8-10页 |
| 缩略语 | 第10-11页 |
| 第一章 文献综述 | 第11-25页 |
| 1 前言 | 第11-12页 |
| 2 牛分枝杆菌基因组学 | 第12-15页 |
| ·牛分枝杆菌与结核分枝杆菌的单核苷酸多态性序列的比较(Single Nucleotide Polymorphisms SNP) | 第12页 |
| ·牛分枝杆菌细胞膜和蛋白抗原的分析 | 第12-14页 |
| ·牛分枝杆菌的基因调控 | 第14-15页 |
| ·牛分枝杆菌基础代谢的研究 | 第15页 |
| 3 牛分枝杆菌在结核分枝杆菌复合群系统进化中的位置 | 第15-17页 |
| 4 牛分枝杆菌感染巨噬细胞的研究 | 第17-19页 |
| 5 分枝杆菌的基因分型及分子流行病学 | 第19-22页 |
| 参考文献 | 第22-25页 |
| 第二章 牛分枝杆菌感染巨噬细胞THP-1全基因表达谱变化的研究 | 第25-43页 |
| 1 引言 | 第25页 |
| 2 材料与方法 | 第25-32页 |
| ·材料 | 第25-28页 |
| ·方法 | 第28-32页 |
| ·菌株和培养 | 第28-29页 |
| ·细胞株及感染实验 | 第29页 |
| ·Zihel-Neelsen(Z-N)染色 | 第29页 |
| ·THP-1细胞RNA的提取 | 第29-30页 |
| ·甲醛变性胶电泳检测 | 第30页 |
| ·对样品RNA进行荧光标记 | 第30-31页 |
| ·反转录合成1st-strand cDNA | 第30页 |
| ·合成2nd-strand cDNA | 第30页 |
| ·体外转录合成cRNA | 第30页 |
| ·随机引物反转录 | 第30页 |
| ·cDNA用KLENOW酶标记 | 第30-31页 |
| ·DNA芯片的构建 | 第31页 |
| ·杂交与清洗 | 第31页 |
| ·芯片图像的采集与数据分析 | 第31-32页 |
| ·采用LuxScan3.0图像分析软件(Capitalbio公司)对芯片图像进行分 析 | 第31页 |
| ·差异表达基因筛选 | 第31-32页 |
| 3 结果 | 第32-39页 |
| ·牛分枝杆菌菌落空斑形成单位计数 | 第32页 |
| ·Ziehl-Neelsen(Z-N)染色 | 第32页 |
| ·提取THP-1细胞系总RNA的结果 | 第32-33页 |
| ·利用LuxScan 10K/A双通道激光扫描仪(CapitalBio公司)进行芯片扫描 | 第33-34页 |
| ·THP-1细胞对结核分枝杆菌和牛分枝杆菌入侵产生的表达谱差异 | 第34-39页 |
| 4 讨论 | 第39-42页 |
| 参考文献 | 第42-43页 |
| 第三章 北京市昌平区结核分枝杆菌基因分型 | 第43-53页 |
| 1 材料和方法 | 第43-47页 |
| ·材料 | 第43-44页 |
| ·方法 | 第44-47页 |
| 2 结果 | 第47-50页 |
| ·结核分枝杆菌Spoligotyping的分型结果 | 第47-48页 |
| ·Real-time PCR基因分型的结果 | 第48-50页 |
| 3 讨论 | 第50-52页 |
| 参考文献 | 第52-53页 |
| 全文总结 | 第53-55页 |
| 致谢 | 第55-57页 |
| 攻读硕士学位期间发表的学术论文 | 第57-59页 |
| 附录 | 第59-75页 |
