生物病毒复杂系统定性仿真研究
| 摘要 | 第1-7页 |
| ABSTRACT | 第7-13页 |
| 第一章 绪论 | 第13-27页 |
| ·课题背景-人工生命简介 | 第13-18页 |
| ·科学研究方法的革命-计算机仿真实验 | 第13-14页 |
| ·人工生命的诞生 | 第14-15页 |
| ·人工生命研究内容 | 第15-17页 |
| ·人工生命研究意义 | 第17-18页 |
| ·计算机仿真简介 | 第18-23页 |
| ·计算机仿真概述 | 第18页 |
| ·计算机仿真定义 | 第18-20页 |
| ·计算机仿真发展 | 第20页 |
| ·定性仿真的引入 | 第20-23页 |
| ·本文主要研究内容 | 第23-25页 |
| ·本章小结 | 第25页 |
| 参考文献 | 第25-27页 |
| 第二章 基本概念和方法介绍 | 第27-51页 |
| ·定性仿真理论 | 第27-39页 |
| ·定性仿真的理论研究状况 | 第28-31页 |
| ·定性仿真的应用研究 | 第31-38页 |
| ·定性仿真发展方向 | 第38-39页 |
| ·元胞自动机理论 | 第39-44页 |
| ·元胞自动机简介 | 第39-40页 |
| ·细胞自动机定义 | 第40-42页 |
| ·元胞自动机应用 | 第42-44页 |
| ·生物病毒背景知识 | 第44-46页 |
| ·病毒的定义 | 第44页 |
| ·病毒的粒子结构组成 | 第44-45页 |
| ·病毒的吸附、侵入和脱壳 | 第45-46页 |
| ·本章小结 | 第46页 |
| 参考文献 | 第46-51页 |
| 第三章 QSIM理论若干问题研究 | 第51-65页 |
| ·基本概念 | 第52-54页 |
| ·定性表示 | 第52-53页 |
| ·代数约束 | 第53-54页 |
| ·定性约束 | 第54页 |
| ·QSIM仿真过程 | 第54-57页 |
| ·QSIM算法 | 第54-56页 |
| ·QSIM算法充分不完备性 | 第56-57页 |
| ·QSIM理论中若干问题讨论 | 第57-63页 |
| ·量空间的讨论 | 第57-58页 |
| ·变量重复出现问题讨论 | 第58-60页 |
| ·定性关系讨论 | 第60-61页 |
| ·定性符号讨论 | 第61-63页 |
| ·本章小结 | 第63页 |
| 参考文献 | 第63-65页 |
| 第四章 基于定性动力学的病毒感染过程研究 | 第65-89页 |
| ·相关概念 | 第66-69页 |
| ·基本定义 | 第66-67页 |
| ·定性空间的集合 | 第67-68页 |
| ·域邻居 | 第68页 |
| ·转移规则 | 第68-69页 |
| ·定性动力学分析方法 | 第69-79页 |
| ·定性描述特点分析 | 第69-70页 |
| ·低维数定义 | 第70-75页 |
| ·定性状态的图形表示 | 第75页 |
| ·状态生成算法 | 第75-77页 |
| ·状态转移推理算法 | 第77-79页 |
| ·病毒感染模型的定性动力学行为分析 | 第79-84页 |
| ·病毒感染模型 | 第79-80页 |
| ·定性分析过程 | 第80-84页 |
| ·模型评估讨论 | 第84-85页 |
| ·本章小结 | 第85-86页 |
| 参考文献 | 第86-89页 |
| 第五章 基于元胞自动机的传染病流行研究 | 第89-113页 |
| ·传染病流行概况 | 第89-90页 |
| ·传染病研究的背景和意义 | 第89-90页 |
| ·传染病流行研究概述 | 第90页 |
| ·传染病流行研究状况 | 第90-94页 |
| ·微分方程模型 | 第90-93页 |
| ·确定性模型SIT以及相关研究 | 第93页 |
| ·统计模型 | 第93-94页 |
| ·其他模型 | 第94页 |
| ·基于元胞自动机的传染病流行模型研究 | 第94-102页 |
| ·CAED的设计 | 第94-96页 |
| ·状态分析与假设 | 第96-97页 |
| ·状态属性描述 | 第97-99页 |
| ·状态更新规则 | 第99-100页 |
| ·影响参数的设定 | 第100-102页 |
| ·系统仿真和结果 | 第102-109页 |
| ·元胞空间设定 | 第102页 |
| ·参数设定 | 第102-103页 |
| ·仿真步骤 | 第103页 |
| ·仿真结果 | 第103-105页 |
| ·与其他方法比较 | 第105-106页 |
| ·参数影响 | 第106-109页 |
| ·本章小结 | 第109-110页 |
| 参考文献 | 第110-113页 |
| 第六章 基于元胞自动机的病毒感染研究 | 第113-131页 |
| ·HIV生物背景 | 第113-115页 |
| ·人体免疫缺陷病毒HIV | 第113-114页 |
| ·HIV导致疾病的过程 | 第114-115页 |
| ·HIV致病的原因 | 第115页 |
| ·HIV病毒感染研究现状 | 第115-118页 |
| ·病毒感染的基础模型 | 第116-117页 |
| ·THC感染模型 | 第117页 |
| ·具 CTL反应的感染模型 | 第117-118页 |
| ·Multi-Agent方法 | 第118页 |
| ·基于元胞自动机的病毒感染建模 | 第118-121页 |
| ·分析与假设 | 第118-119页 |
| ·状态更新规则 | 第119-120页 |
| ·仿真流程 | 第120-121页 |
| ·仿真结果及分析 | 第121-127页 |
| ·实验数据 | 第121页 |
| ·结果分析 | 第121-124页 |
| ·参数影响 | 第124-126页 |
| ·感染速度分析 | 第126-127页 |
| ·与其他方法比较 | 第127页 |
| ·本章小结 | 第127-128页 |
| 参考文献 | 第128-131页 |
| 第七章 基于定性关系描述的病毒感染过程研究 | 第131-143页 |
| ·病毒感染过程中病毒行为的框架模型 | 第131-133页 |
| ·影响病毒行为的因素描述 | 第132页 |
| ·病毒行为理论框架模型 | 第132-133页 |
| ·病毒感染过程理论框架模型评估 | 第133-137页 |
| ·建立层次结构模型 | 第134页 |
| ·构造评价矩阵 | 第134-135页 |
| ·计算层次单排序的权向量和一致性检验 | 第135-137页 |
| ·计算层次总排序权值和一致性检验 | 第137页 |
| ·病毒感染的模型定性定量分析 | 第137-141页 |
| ·病毒感染的定性交互作用模型 | 第138-139页 |
| ·定性定量评估 | 第139-141页 |
| ·本章小结 | 第141页 |
| 参考文献 | 第141-143页 |
| 第八章 基于定性过程理论的酶动力学研究 | 第143-157页 |
| ·酶动力学 | 第143-147页 |
| ·酶动力学研究 | 第143-145页 |
| ·酶参与下的化学反应 | 第145-147页 |
| ·基于定性过程理论的酶反应研究 | 第147-155页 |
| ·建模原语定义 | 第147-149页 |
| ·量的构成 | 第149-150页 |
| ·个体视图 | 第150-151页 |
| ·过程库 | 第151-153页 |
| ·推理过程 | 第153页 |
| ·状态转变 | 第153-155页 |
| ·本章小结 | 第155页 |
| 参考文献 | 第155-157页 |
| 第九章 结束语 | 第157-161页 |
| ·本文的主要工作和贡献 | 第157-159页 |
| ·存在的问题和今后研究方向 | 第159-161页 |
| 致谢 | 第161-163页 |
| 攻读博士学位期间完成的论文 | 第163页 |
