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酸酐类双功能试剂修饰辅助的蛋白质组研究新方法及其应用

中文摘要第1-7页
Abstract第7-15页
引言第15-24页
第一章 酸酐类双功能试剂螯合稀土金属元素标记结合生物质谱的检测定量蛋白质组新方法第24-42页
 1 材料与方法第25-28页
   ·材料第25页
   ·方法第25-26页
     ·双酸酐标记反应条件优化第25-26页
     ·肌红蛋白的酶切第26页
     ·胰岛素的酶切第26页
     ·标准蛋白混合物体系的制备和酶切第26页
     ·双酸酐试剂标记和螯合反应条件优化第26页
   ·生物质谱分析方法和数据库检索第26-28页
     ·分析样本准备第26-27页
     ·LC-Q-TOF MS/MS分析条件第27页
     ·LC-MALDI TOF/TOF分析条件第27-28页
     ·数据库检索第28页
 2 结果与讨论第28-40页
   ·方法原理第28-29页
   ·双功能试剂DTPA标记反应条件优化第29-31页
   ·伯氨基标记反应特异性考查第31-34页
   ·标记肽段的稳定性考查第34-35页
   ·标记肽段的色谱行为与质谱裂解行为考查 #2l第35-36页
   ·离子抑制现象第36-37页
   ·方法的动态范围第37页
   ·方法实用性的考查第37-38页
   ·小结第38-40页
 参考文献第40-42页
第二章 酸酐类双功能试剂修饰辅助的~(18)O标记结合生物质谱检测的蛋白质组双重定量新策略第42-56页
 1 材料与方法第43-45页
   ·材料第43页
   ·方法第43-45页
     ·六种标准蛋白混合物的配置与酶切第43-44页
     ·蛋白质肽段的两种~(18)O标记方法第44页
     ·色谱分离与在线点靶第44页
     ·质谱分析第44-45页
 2 结果与讨论第45-51页
   ·方法原理第45-46页
   ·双功能试剂与肽段氨基的标记特异性第46页
   ·肌红蛋白肽段的~(18)O标记效率第46-47页
   ·肽段C端~(18)O标记时间考查第47-48页
   ·~(18)O标记肽段的稳定性第48-49页
   ·标记肽段的质谱裂解行为的考查第49页
   ·方法的动态范围第49-50页
   ·定量软件第50-51页
   ·方法实用性的考查第51页
 3 小结第51-55页
 参考文献第55-56页
第三章 酸酐类双功能试剂修饰辅助的~(18)O双重定量策略在YHB1基因敲除的酵母差异蛋白质组研究中的应用第56-76页
 1 材料与方法第57-63页
   ·材料第57页
     ·试剂第57页
     ·酵母及其培养基第57页
     ·主要仪器设备第57页
   ·方法第57-63页
     ·酵母YHB1基因敲除株的PCR实验确证第57-59页
       ·引物的设计与合成第57-58页
       ·YHB1 cDNA的扩增第58-59页
       ·T载体的测序第59页
     ·酿酒酵母菌株的培养第59页
     ·酵母细胞蛋白质的提取第59-60页
     ·提取蛋白质的浓度测定第60页
     ·一维聚丙烯酰胺凝胶电泳(SDS-PAGE)第60页
     ·酵母细胞提取溶液蛋白质的酶切第60-61页
     ·酶切肽段的双酸酐试剂DTPA修饰的与~(18)O标记第61页
     ·强离子交换色谱分离第61页
     ·LC-LTQ-FT分析条件第61-62页
       ·LC-LTQ-FT反相色谱条件第61-62页
       ·LC-LTQ-FT质谱分析条件第62页
     ·数据检索第62-63页
     ·蛋白质定量结果计算第63页
     ·生物信息学分析第63页
     ·酵母差异蛋白质组数据的功能意义分析第63页
 2 结果与讨论第63-69页
   ·酵母YHB1基因敲除的酵母菌株PCR实验确证第63-64页
   ·酵母蛋白质提取方法第64-66页
   ·LC-LTQ-FT质谱分析第66-67页
   ·~(18)O双重定量策略定量准确性考查第67-68页
   ·酵母CG1945与△YHB1_CG1945的差异蛋白质组研究第68-69页
     ·强离子交换色谱分离实验第68页
     ·定量结果计算第68-69页
     ·差异蛋白质功能的初步分析第69页
 3 小结第69-73页
 参考文献第73-76页
第四章 酸酐类双功能试剂修饰辅助的~(18)O双重定量策略在NO刺激相关的△YHB1酵母差异蛋白质组研究中的应用第76-91页
 1 材料与方法第77-79页
   ·材料第77页
     ·试剂第77页
     ·酵母及其培养基第77页
     ·主要仪器设备第77页
   ·方法第77-79页
     ·酿酒酵母菌株的培养第77-78页
     ·酵母细胞的提取第78页
     ·提取蛋白质的浓度测定第78页
     ·酵母细胞提取溶液的酶切第78页
     ·酶切肽段的双酸酐试剂DTPA化学修饰的~(18)O标记第78页
     ·强离子交换色谱分离实验条件第78-79页
     ·LTQ-FT分析条件第79页
     ·数据检索第79页
     ·蛋白质定量结果计算第79页
     ·生物信息学分析第79页
     ·酵母差异蛋白质组数据的功能意义分析第79页
 2 结果与讨论第79-84页
   ·基于LC-LTQ-FT的差异蛋白定量结果第79-80页
   ·△YHB1酵母在NO刺激与不刺激条件下的差异蛋白质分类第80-81页
   ·差异蛋白质的功能与NO相关的信号转导通路的初步讨论第81-84页
 3 小结第84-88页
 参考文献第88-91页
第五章 酸酐类双功能试剂修饰辅助的蛋白质N端肽的富集测定新方法初步研究第91-102页
 1 材料与方法第92-94页
   ·材料第92页
   ·方法第92-94页
     ·蛋白质N端的DTPA双酸酐试剂标记第92页
     ·肽段混合物阳离子交换色谱实验条件和Zip Tip脱盐点靶第92-93页
     ·质谱分析第93页
     ·数据处理第93-94页
 2 结果与讨论第94-98页
   ·方法的原理第94-95页
   ·肌红蛋白N端肽的双功能试剂DTPA标记第95-96页
   ·双功能试剂DTPA标记的肌红蛋白N端的酶切肽段色谱分离与质谱鉴定第96-98页
 3 小结第98-99页
 参考文献第99-102页
结语第102-104页
攻读学位期间的研究成果第104-106页
致谢第106-108页
文献综述第108-113页
发表文章第113-120页

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