| 摘要 | 第1-9页 |
| Abstract | 第9-12页 |
| 本论文主要创新点 | 第12-13页 |
| 第一章 文献综述 | 第13-32页 |
| §1.1 溶液中从头算电子结构理论的最新进展 | 第13-17页 |
| ·引文 | 第13-14页 |
| ·完全极化介质模型 | 第14-15页 |
| ·完全极化连续介质模型同其它SCRF模型的比较 | 第15-17页 |
| §1.2 磷酸二酯酶的结构 | 第17-23页 |
| ·引文 | 第17-18页 |
| ·PDEs催化区的基本结构 | 第18-19页 |
| ·核苷酸选择性的谷氨酰胺开关机理 | 第19-21页 |
| ·关于PDEs抑制剂的理论研究进展 | 第21-22页 |
| ·有待解决的问题 | 第22-23页 |
| §1.3 论文的设计思想与预期目标 | 第23-24页 |
| 参考文献 | 第24-32页 |
| 第二章 水溶液中生物小分子的结构和pK_a计算的从头算研究 | 第32-67页 |
| §2.1 水溶液中尼古丁、可卡因、神经递质、苯胺等生物小分子pK_a值的第一原理电子结构计算 | 第33-45页 |
| ·引文 | 第33-34页 |
| ·计算方法 | 第34-37页 |
| ·结果讨论 | 第37-39页 |
| ·结论 | 第39-45页 |
| §2.2 一价和二价组胺阳离子在水溶液中结构的从头算研究 | 第45-59页 |
| ·引文 | 第45-46页 |
| ·计算方法 | 第46-47页 |
| ·结果和讨论 | 第47-58页 |
| ·结论 | 第58-59页 |
| §2.3 本章小结 | 第59-60页 |
| 参考文献 | 第60-67页 |
| 第三章 磷酸二酯酶PDE5活性中心的结构以及PDE5酶抑制剂环鸟嘌呤衍生物结构-活性和结构-选择性相关性的研究 | 第67-93页 |
| §3.1 引文 | 第67-70页 |
| ·杂化的量子力学/分子力学计算方法 | 第67-68页 |
| ·分子动力学方法 | 第68-69页 |
| ·AutoDock分子对接方法 | 第69-70页 |
| ·QSAR和QSSR方法 | 第70页 |
| §3.2 结合分子动力学模拟、杂化的量子力学/分子力学计算磷酸二酯酶-5的活性中心结构 | 第70-80页 |
| ·计算方法 | 第70-72页 |
| ·结果和讨论 | 第72-79页 |
| ·结论 | 第79-80页 |
| §3.3 通过分子对接、CoMFA和CoMSIA分析来进行PDE5酶抑制剂环鸟嘌呤衍生物结构-活性和结构-选择性相关性的研究 | 第80-86页 |
| ·计算细节 | 第80-81页 |
| ·结果和讨论 | 第81-86页 |
| ·结论 | 第86页 |
| §3.4 本章小结 | 第86-88页 |
| 参考文献 | 第88-93页 |
| 全文总结 | 第93-95页 |
| 攻读学位期间发表的文章 | 第95-96页 |
| 致谢 | 第96页 |
