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柑橘低温诱导相关基因的克隆与表达分析

摘要第1-5页
ABSTRACT第5-12页
第一章 前言第12-32页
 1 柑橘抗寒研究现状第12-17页
   ·质膜与抗寒性的研究第12页
   ·活性氧清除系统与抗寒性的研究第12-13页
   ·可溶性蛋白质与抗寒性的研究第13页
   ·渗透调节物质与抗寒性的研究第13-14页
   ·内源激素、生长调节剂与抗寒性的研究第14-15页
   ·多胺与抗寒性的研究第15页
   ·人工锻炼与抗寒性的研究第15页
   ·植物组织形态结构与抗寒性的研究第15-16页
   ·质壁分离与与植物抗寒性的研究第16页
   ·光合能力、呼吸强度与抗寒性的研究第16页
   ·功能基因与抗寒性的研究第16-17页
 2 mRNA水平研究基因的差异表达第17-25页
   ·表达序列标签技术第17-18页
   ·基因表达序列分析第18-19页
   ·cDNA微阵列技术第19页
   ·mRNA差异显示技术第19-20页
   ·代表性差异分析法第20页
   ·抑制差减杂交技术第20-25页
 3 蛋白质水平研究基因的差异表达第25-29页
   ·蛋白质组的概念第26页
   ·蛋白质的分离第26-27页
   ·蛋白质的鉴定第27-28页
   ·蛋白质的信息处理第28-29页
 4 研究的目的意义第29-30页
 5 技术路线第30-32页
第二章 枳和宫本温州蜜柑适宜冷处理温度的摸索第32-42页
 1 材料与方法第32-34页
   ·试验材料第32页
   ·低温处理第32页
   ·抗寒生化物质的测定第32-34页
 2 结果与分析第34-40页
   ·低温处理对根际土壤温度和柑橘根系的影响第34-36页
   ·低温处理后枳和宫本叶片受冻形态观察第36-37页
   ·叶片电解质渗出率与试材抗寒性的关系第37页
   ·CAT和POD活性与试材抗寒性的关系第37-39页
   ·叶片中Pro含量与试材抗寒性的关系第39-40页
 3 讨论第40-41页
 4 小结第41-42页
第三章 应用抑制性差减杂交克隆冷诱导基因第42-58页
 1 材料与方法第42-46页
   ·材料及处理第42-43页
   ·主要试剂和仪器第43页
   ·试验方法第43-46页
     ·总RNA提取第43页
     ·mRNA分离纯化第43-44页
     ·抑制性差减杂交第44页
     ·PCR产物纯化及克隆转化第44页
     ·阳性克隆测序第44页
     ·测序EST的同源性分析第44页
     ·柑橘几丁质酶基因的Northern表达分析第44-46页
     ·序列提交GenBank第46页
 2 结果与分析第46-54页
   ·抑制性差减杂交方法的优化与改进第46-51页
     ·总RNA提取和mRNA分离纯化结果第46-47页
     ·dscDNA合成及其RSAI酶切效率分析第47-48页
     ·接头连接效率分析结果第48-49页
     ·PCR产物检测结果第49-51页
     ·差减效率检测第51页
   ·冷诱导基因的克隆与分析第51-54页
     ·阳性克隆检测结果第51页
     ·测序EST的同源性分析第51-53页
     ·柑橘几丁质酶基因的Northern表达分析第53页
     ·序列提交结果第53-54页
 3 讨论第54-56页
   ·低温锻炼与相关基因的表达第54-56页
   ·SSH方法在柑橘研究上的应用与改进第56页
 4 小结第56-58页
第四章 冷诱导基因Ptcor8全长分析、功能预测和表达分析第58-78页
 第1节 冷诱导基因Ptcor8 cDNA全长分析第58-64页
  1 方法第58-59页
  2 结果与分析第59-63页
   ·序列翻译与ORF预测第59-60页
   ·与同源蛋白质家族的比较第60-63页
  3 讨论第63-64页
 第2节 冷诱导基因Ptcor8的功能预测第64-75页
  1 方法第64页
  2 结果与分析第64-74页
   ·蛋白质理化性质预测分析第64-66页
   ·蛋白质的亚细胞定位第66-69页
   ·蛋白质跨膜结构预测第69-70页
   ·蛋白质二级结构预测第70-71页
   ·蛋白质基序和结构域预测第71-72页
   ·蛋白质磷酸化位点分析第72页
   ·分子系统发育分析第72-74页
  3 讨论第74-75页
 第3节 冷诱导基因Ptcor8表达初步分析第75-77页
  1 材料与方法第75-76页
   ·材料处理第75页
   ·总RNA提取第75页
   ·单链cDNA的合成第75页
   ·半定量内参引物扩增第75-76页
   ·半定量RT-PCR反应第76页
  2 结果与分析第76-77页
  3 讨论第77页
 本章小结第77-78页
第五章 应用蛋白质组方法分离克隆冷诱导基因第78-95页
 第1节 柑橘冷诱导蛋白质的分离与鉴定第78-90页
  1 材料与方法第78-82页
   ·主要仪器和试剂第78-79页
   ·试材的处理第79页
   ·实验方法第79-82页
     ·蛋白质的提取第79页
     ·蛋白质的分离纯化第79-81页
     ·双向凝胶电泳图谱分析第81页
     ·部分差异蛋白质点的质谱鉴定第81-82页
  2 结果与分析第82-89页
   ·蛋白质含量测定第82-83页
   ·SDS-PAGE凝胶浓度的确定第83页
   ·低温胁迫相关蛋白质的检测第83-85页
   ·柑橘低温响应有关蛋白质的质谱鉴定第85-89页
     ·枳叶片低温响应有关蛋白质的质谱鉴定第85-86页
     ·宫本叶片低温响应有关蛋白质的质谱鉴定第86-89页
  3 讨论第89-90页
   ·几个蛋白质的表达与低温响应的关系第89-90页
   ·蛋白质组分析技术在柑橘研究上的思考第90页
 第2节 冷诱导蛋白质Ptcorp编码基因的克隆与表达分析第90-94页
  1 材料与方法第90-92页
   ·材料处理第90-91页
   ·简并引物设计第91页
   ·总DNA提取第91页
   ·兼并引物以总DNA为模版的扩增第91-92页
   ·扩增片段回收、克隆转化及测序第92页
   ·测序片段序列分析及特异引物设计第92页
   ·半定量RT-PCR表达分析第92页
  2 结果与分析第92-94页
   ·简并引物扩增结果第92-93页
   ·克隆测序和同源性比对结果第93页
   ·半定量RT-PCR结果第93-94页
  3 讨论第94页
 本章小结第94-95页
结论及创新之处第95-97页
下一步工作设想第97-98页
参考文献第98-108页
附录第108-124页
 附录A 测序结果第108-113页
 附录B 不同低温处理下枳和宫本叶片蛋白质双向电泳图谱第113-114页
 附录C 部分差异表达蛋白质点肽质量指纹图谱第114-120页
 附录D 抑制性差减杂交接头和引物序列第120-121页
 附录E pGEM-T Easy Vector质粒图和多克隆位点第121-122页
 附录F 缩略词表第122-124页
致谢第124-125页
个人简历第125页
在读期间主持和参加的科研课题第125-126页
在读期间参编的著作和公开发表的学术论文第126页

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