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角叉菜属分子分类、系统发育及居群遗传多样性研究

摘要第1-6页
Abstract第6-13页
第一章 文献综述第13-40页
 前言第13页
 1 红藻系统发育的研究现状第13-19页
   ·红藻系统发育研究的意义第13页
   ·DNA分子的特性第13-14页
   ·红藻系统发育研究的主要分子生物学方法第14-19页
   ·红藻系统发育研究中存在的问题第19页
 2 分子系统地理学在藻类研究中的应用第19-39页
   ·系统地理学概述第19-20页
   ·分子系统地理学的研究进展第20-22页
   ·跨越北极互换:海洋生物地理学研究的一个模式系统第22-26页
     ·北半球海洋中的一个关键事件——跨越北极互换的地质背景第22-23页
     ·西北大西洋的冰期与灭绝第23页
     ·太平洋——大西洋遗传分化:第Ⅰ类和第Ⅱ类第23-24页
     ·太平洋——大西洋小遗传分化:第Ⅲ类和第Ⅳ类第24-26页
   ·藻类分子系统地理学的研究进展第26-39页
     ·藻类的居群动态历史研究第26-32页
     ·入侵海藻的分子系统地理学研究第32-39页
 3 本论文的研究目的及意义第39-40页
第二章 角叉菜属的分子分类和系统发育研究Ⅰ:核糖体18s rRNA基因数据分析第40-58页
 第一节 角叉菜属新种识别与系统发育的研究第40-51页
  前言第40-41页
  1 材料与方法第41-46页
   ·材料采集第41页
   ·基因组DNA提取第41-43页
   ·核糖体18S rRNA基因扩增与测序第43-44页
   ·序列比对与系统发育分析第44-46页
  2 结果第46-48页
  3 讨论第48-51页
   ·角叉菜的分子分类学第48-50页
   ·角叉菜属的系统发育与C.crispus的北太平洋起源第50-51页
 第二节 运用核糖体18S rRNA基因序列鉴别两种红藻C.crispus和Mastocarpus stellatus第51-58页
  前言第51-52页
  1 材料与方法第52-54页
   ·材料第52页
   ·方法第52-54页
  2 结果第54-55页
   ·C.crispus和M.stellatus的18S rRNA基因序列分析第54-55页
   ·分子系统树的构建第55页
  3 讨论第55-58页
   ·18S rRNA基因序列分析第55-56页
   ·18S rRNA基因探针及应用前景第56-57页
   ·红藻分类学中的形态学特征和分子证据第57-58页
第三章 角叉菜属的分子分类和系统发育研究Ⅱ:核糖体内转录间隔区(TTS)数据分析第58-69页
 前言第58页
 1 材料与方法第58-62页
   ·材料采集第58-61页
   ·nrDNA ITS扩增及测序第61页
   ·序列分析及系统进化树的构建第61-62页
 2 结果第62-65页
   ·ITs区长度、GC含量和序列差异第62-63页
   ·分子系统发育分析第63-65页
 3 讨论第65-69页
   ·中国沿海角叉菜的分子描述和分类第65-67页
   ·北大西洋C.crispua的起源与地理隔离第67-69页
第四章 北大西洋皱波角叉菜(C.crispus Stackhouse)的分子系统地理学研究第69-83页
 前言第69-70页
 1 材料与方法第70-73页
   ·材料采集第70-71页
   ·基因组DNA提取、nrDNA ITS扩增及测序第71-73页
   ·系统发育分析第73页
 2 结果第73-75页
   ·ITS序列数据第73-75页
   ·系统发育分析第75页
 3 讨论第75-83页
   ·ITS数据和系统发育第75-80页
   ·生物地理学第80-83页
第五章 北大西洋皱波角叉菜(C.crispus Stackhouse)居群遗传多样性的ISSR分析第83-92页
 前言第83页
 1 材料与方法第83-88页
   ·材料第83页
   ·基因组DNA提取与引物筛选第83-84页
   ·ISSR-PCR扩增第84-85页
   ·数据统计与分析第85-88页
 2 结果第88-90页
   ·C.crispus居群的ISSR遗传多样性第88-89页
   ·C.crispus居群的遗传分化第89-90页
 3 讨论第90-92页
第六章 角叉菜属在红藻中的系统进化地位研究第92-107页
 第一节 来自nrDNA ITS序列的证据第92-99页
  前言第92页
  1 材料与方法第92-94页
   ·材料第92页
   ·基因组DNA提取、nrDNA ITS扩增及产物纯化与测序第92-94页
   ·序列分析和系统进化树的构建第94页
  2 结果第94-97页
   ·角叉菜属nrDNA ITS序列分析第94-96页
   ·角叉菜属和红藻门的系统学分析第96-97页
  3 讨论第97-99页
 第二节来 自mtDNA cox2-3基因间序列的证据第99-107页
  前言第99页
  1 材料与方法第99-101页
   ·材料第99页
   ·基因组DNA的提取第99页
   ·mtDNA cox2-3基因间序列的扩增和测定第99-100页
   ·序列分析和系统进化树的构建第100-101页
  2 结果第101-106页
   ·红藻线粒体细胞色素氧化酶基因间区域(cox2-3)序列特征第102页
   ·红藻门不同属的属间系统进化关系第102-105页
   ·角叉菜属内的系统进化关系第105-106页
  3 讨论第106-107页
总结第107-109页
参考文献第109-129页
致谢第129-131页
在学期间发表的论文第131页

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