| 摘要 | 第1-5页 |
| Abstract | 第5-6页 |
| 综述一 植物适应非生物胁迫的分子机制 | 第6-23页 |
| 1. 信号转导通路 | 第6-11页 |
| ·信号分子 | 第6-8页 |
| ·CIPK-CBL (SOS) pathways | 第8-9页 |
| ·MAPK pathway | 第9-10页 |
| ·CDPK pathway | 第10-11页 |
| 2. 转录调节通路 | 第11-17页 |
| ·DREB/CBF 转录调节通路 | 第11-14页 |
| ·ABA 介导的转录调控通路 | 第14-16页 |
| ·NAC 以及其它通路 | 第16-17页 |
| 3. 转录后调控 | 第17-18页 |
| ·mi RNA 以及siRNA | 第17-18页 |
| ·RNA 的转录后加工 | 第18页 |
| 4. 终端功能基因/蛋白 | 第18-22页 |
| ·解除ROS 等毒性分子相关基因 | 第19页 |
| ·运输蛋白相关基因 | 第19-20页 |
| ·胁迫保护物质及代谢相关基因 | 第20-22页 |
| ·生长调节相关基因 | 第22页 |
| 5. 作物耐逆基因工程及研究展望 | 第22-23页 |
| 综述二 基因芯片/微阵列在植物功能基因组研究中的应用 | 第23-28页 |
| 1. 功能基因的鉴定 | 第23-24页 |
| 2. 表达谱分析 | 第24-25页 |
| 3. 转录调控网络以及转录调节子的鉴定 | 第25-26页 |
| 4. 基因芯片在功能基因组中其它方面的应用 | 第26-28页 |
| 第一章 耐盐水稻品种高盐胁迫下的转录谱及其与感盐品种的比较 | 第28-60页 |
| 引言 | 第28-30页 |
| 材料和方法 | 第30-41页 |
| 1. 材料 | 第30页 |
| 2. 方法 | 第30-41页 |
| 结果 | 第41-54页 |
| 1. 微阵列杂交的可重复性 | 第41页 |
| 2. 耐盐品种Nona 中高盐响应基因的鉴定 | 第41-42页 |
| 3. Northern 杂交以及RT-PCR 验证微阵列结果 | 第42-44页 |
| 4. Nona 中盐响应基因的层级聚类以及功能分类 | 第44-46页 |
| 5. 瞬间上调组基因(Group I) | 第46页 |
| 6. 中期上调组(Group II)和长期上调组基因(Group III) | 第46-49页 |
| 7. 中期下调组（Group IV）以及长期下调组（Group V） | 第49页 |
| 8. 抗盐品种Nona 以感盐品种IR28 之间盐响应基因转录调节的比较 | 第49-54页 |
| 讨论 | 第54-60页 |
| 1. 本实验的微阵列可以可靠地检测差异调节基因 | 第54页 |
| 2. 本实验鉴定了大量盐胁迫响新应基因 | 第54-55页 |
| 3. 新鉴定的响应基因可以作为耐盐基因工程的候选基因 | 第55-56页 |
| 4. 一些盐胁迫相关基因有可能在Nona 中是组成性表达的 | 第56页 |
| 5. 盐胁迫下可能存在多种转录调节通路 | 第56-57页 |
| 6. 大部分耐盐性相关基因在Nona 中可以迅速被诱导出来 | 第57-58页 |
| 7. 盐胁迫和衰老、生物胁迫信号通路之间相互交叉（cross-talk） | 第58页 |
| 8. 盐胁迫下转录谱的差异是Nona 和IR28 抗感差异的重要原因 | 第58-60页 |
| 第二章：钙离子在盐响应基因调节过程中的作用 | 第60-72页 |
| 前言 | 第60-61页 |
| 材料和方法 | 第61-63页 |
| 1. 材料 | 第61页 |
| 2. 方法 | 第61-63页 |
| 结果 | 第63-70页 |
| 1. EGTA 预处理12 小时抑制了盐处理导致的气孔关闭 | 第63页 |
| 2. EGTA 预处理12 小时使水稻Nona 的转录谱发生重大变化 | 第63-65页 |
| 3. 共处理水稻幼苗20 分钟至6 小时后和盐处理对照的转录谱无显著差异 | 第65页 |
| 4. EGTA 抑制了24 小时处的盐胁迫响应基因的调节 | 第65-67页 |
| 5. EGTA 的预处理可以提高水稻的耐盐性 | 第67-70页 |
| 讨论 | 第70-72页 |
| 第三章：水稻海藻糖-6-磷酸磷酸酶1（OsTPP1）在水稻逆境胁迫中的作用 | 第72-87页 |
| 前言 | 第72-74页 |
| 材料和方法 | 第74-80页 |
| 1. 材料 | 第74页 |
| 2. 方法 | 第74-80页 |
| 结果 | 第80-84页 |
| 1. OsTPP1 的序列分析与克隆 | 第80-81页 |
| 2. OsTPP1 在盐旱胁迫下的表达谱 | 第81-82页 |
| 3. OsTPP1 在水稻中的超表达 | 第82-83页 |
| 4. OsTPP1 的超表达显著提高了水稻的耐盐性 | 第83-84页 |
| 讨论 | 第84-87页 |
| 参考文献 | 第87-103页 |
| 附录 | 第103-106页 |
| 附录1.培养基以及营养液配方 | 第103-106页 |
| 致谢 | 第106-107页 |
| 发表论文及专利列表 | 第107页 |
