| 摘要 | 第1-8页 |
| Abstract | 第8-11页 |
| 第1章 文献综述 | 第11-29页 |
| 引言 | 第11-12页 |
| ·EST的定义和特点 | 第12页 |
| ·EST的数据库 | 第12-14页 |
| ·EST的应用现状 | 第14-20页 |
| ·EST与新基因的发现 | 第14-15页 |
| ·EST与SNPs | 第15-16页 |
| ·EST在检测选择性剪接中的应用 | 第16-19页 |
| ·EST与基因表达水平的分析 | 第19-20页 |
| ·EST研究展望 | 第20-21页 |
| ·参考文献 | 第21-29页 |
| 第2章 泌乳前后家猪乳腺基因表达谱的构建以及不同猪种和不同发育时期差异表达基因的确定 | 第29-48页 |
| ·摘要 | 第29页 |
| ·引言 | 第29-30页 |
| ·材料和方法 | 第30-33页 |
| ·文库构建 | 第30-31页 |
| ·EST测序和序列预处理 | 第31-32页 |
| ·高质量EST序列的拼接与注释 | 第32页 |
| ·基因的功能分类、表达谱构建及基因表达差异分析 | 第32-33页 |
| ·结果 | 第33-38页 |
| ·EST序列的产生和拼接 | 第33页 |
| ·EST注释、功能分类和表达谱构建 | 第33-35页 |
| ·"二花脸"猪和"杜长大"猪泌乳期乳腺中差异表达基因的确定 | 第35-38页 |
| ·"杜长大"母猪不同发育时期乳腺中差异表达基因的确定 | 第38页 |
| ·讨论 | 第38-44页 |
| ·参考文献 | 第44-48页 |
| 第3章 基因复制后选择性剪接的进化 | 第48-70页 |
| ·摘要 | 第48页 |
| ·引言 | 第48-49页 |
| ·材料与方法 | 第49-51页 |
| ·序列数据 | 第49-50页 |
| ·复制基因的鉴定 | 第50页 |
| ·基因家族大小及人小鼠物种分化后的复制基因的确定 | 第50-51页 |
| ·选择性剪接形式的确定 | 第51页 |
| ·结果 | 第51-63页 |
| ·人基因的选择性剪接形式检测 | 第51-53页 |
| ·复制基因可能比单拷贝基因具有较少的选择性剪接形式 | 第53-54页 |
| ·大的基因家族倾向于含有较少得选择性剪接形式 | 第54页 |
| ·选择性剪接的过程可能只发生在基因复制后很短的时间内 | 第54-56页 |
| ·其它模式生物中基因复制对选择性剪接的影响 | 第56-58页 |
| ·人—小鼠物种分化后的复制基因的选择性剪接 | 第58页 |
| ·检验基因复制后选择性剪接的非对称进化 | 第58-62页 |
| ·EST覆盖度和基因表达水平的影响 | 第62-63页 |
| ·讨论 | 第63-65页 |
| ·结论 | 第65页 |
| ·参考文献 | 第65-70页 |
| 第4章 基于EST数量的基因表达进化分析 | 第70-91页 |
| ·摘要 | 第70页 |
| ·引言 | 第70-72页 |
| ·材料和方法 | 第72-75页 |
| ·人基因组内复制基因对的确定 | 第72页 |
| ·Unigene表达谱数据 | 第72-73页 |
| ·人复制基因对基因表达谱分化距离的度量 | 第73-74页 |
| ·人—小鼠直系同源基因对的确定及基因对间表达谱分化距离的计算 | 第74-75页 |
| ·组织间表达谱分化距离的计算及组织表达谱系统树图的绘制 | 第75页 |
| ·结果与讨论 | 第75-86页 |
| ·基因复制后基因表达谱的分化 | 第75-78页 |
| ·人和小鼠物种分化后基因表达谱分化 | 第78-81页 |
| ·基因表达量与基因编码序列进化及基因表达进化的关系 | 第81-83页 |
| ·组织间基因表达谱的比较 | 第83-86页 |
| ·参考文献 | 第86-91页 |
| 致谢 | 第91-92页 |
| 附录1.利用EST丰度度量表达分化的统计学模型 | 第92-95页 |
| 附录2.附表3-1 | 第95-100页 |
| 附录3.附图3-1 | 第100-101页 |
| 附录4.附图3-2 | 第101-102页 |
| 附录5.附图3-3 | 第102-103页 |
| 附录6.附图3-4 | 第103-104页 |
| 附录7.附图3-5 | 第104-106页 |
| 附录8.附图3-6 | 第106-107页 |
| 附录9.发表论文 | 第107页 |
