| 中文摘要 | 第1-12页 |
| ABSTRACT | 第12-16页 |
| 引言 | 第16-18页 |
| 上篇 文献综述 | 第18-54页 |
| 第一章 稻瘟病菌的群体遗传结构研究进展 | 第19-25页 |
| 1 水稻稻瘟病及稻瘟病菌的研究概况 | 第19-20页 |
| 2 稻瘟病菌的群体遗传学研究 | 第20-22页 |
| 2．1 稻瘟病菌致病型(生理小种)及群体结构的研究 | 第20-21页 |
| 2．2 稻瘟病菌生理小种分布及变化 | 第21页 |
| 2．3 稻瘟病菌致病型与遗传谱系间关系的研究 | 第21-22页 |
| 3 稻瘟病菌有性世代的研究 | 第22-25页 |
| 3．1 稻瘟病菌有性态形成能力 | 第22-23页 |
| 3．2 稻瘟病菌交配型及其分布 | 第23-25页 |
| 第二章 稻瘟病菌分子遗传学研究进展 | 第25-35页 |
| 1 分子生物学技术在稻瘟病菌群体遗传结构研究中的应用 | 第25-29页 |
| 1．1 重复DNA序列应用于稻瘟病菌群体遗传学研究 | 第25-26页 |
| 1．2 稻瘟病菌的DNA指纹分析 | 第26-29页 |
| 2 稻瘟病菌遗传图谱、物理图谱的构建和基因定位、克隆 | 第29-32页 |
| 2．1 稻瘟病菌遗传图谱的构建 | 第29-30页 |
| 2．2 稻瘟病菌物理图谱的构建 | 第30-32页 |
| 2．3 稻瘟病菌相关基因的定位与克隆 | 第32页 |
| 3 稻瘟病菌遗传转化体系的建立 | 第32-33页 |
| 4 稻瘟病菌全基因组测序 | 第33-35页 |
| 4．1 稻瘟病菌的基因组结构 | 第33页 |
| 4．2 稻瘟病菌的全基因组测序 | 第33-35页 |
| 第三章 稻瘟病菌无毒基因的研究进展 | 第35-43页 |
| 1 稻瘟病菌无毒基因的遗传分析 | 第35-38页 |
| 2 稻瘟病菌无毒基因的分子标记与定位 | 第38-39页 |
| 3 稻瘟病菌无毒基因的克隆 | 第39-40页 |
| 4 稻瘟病菌无毒基因的功能 | 第40-43页 |
| 参考文献 | 第43-54页 |
| 下篇 研究内容 | 第54-135页 |
| 第一章 中国稻瘟病菌群体遗传结构的研究 | 第55-74页 |
| 1 材料与方法 | 第56-60页 |
| 1．1 供试菌株的采集、培养与保存 | 第56-58页 |
| 1．2 稻瘟病菌株的致病性测定 | 第58-59页 |
| 1．3 稻瘟病菌基因组DNA的提取 | 第59页 |
| 1．4 稻瘟病菌DNA指纹分析 | 第59-60页 |
| 1．5 数据统计与分析 | 第60页 |
| 2 结果与分析 | 第60-69页 |
| 2．1 中国稻瘟病菌rep-PCR扩增结果与群体结构 | 第60-62页 |
| 2．2 不同稻区稻瘟病菌的群体遗传多样性 | 第62-65页 |
| 2．3 不同年份稻瘟病菌的群体结构及演变 | 第65页 |
| 2．4 稻瘟病菌的群体遗传与生理小种(致病型)的关系 | 第65-68页 |
| 2．5 中国稻瘟病菌群体毒力结构分析 | 第68-69页 |
| 3 结论与讨论 | 第69-74页 |
| 第二章 中国主要稻区稻瘟病菌交配型分布及其育性能力的差异 | 第74-84页 |
| 1 材料与方法 | 第75-77页 |
| 1．1 供试菌株 | 第75页 |
| 1．2 交配型及有性态的形成 | 第75-76页 |
| 1．3 交配型的分子测定 | 第76-77页 |
| 2 结果与分析 | 第77-81页 |
| 2．1 稻瘟病菌的交配型及其育性的地理分布 | 第77-78页 |
| 2．2 稻瘟病菌有性世代形成能力 | 第78-79页 |
| 2．3 稻瘟病菌交配型的分子测定 | 第79-81页 |
| 3 结论与讨论 | 第81-84页 |
| 第三章 稻瘟病菌无毒基因Avr-Pia和Avr-Pit的遗传分析与分子标记定位 | 第84-105页 |
| 1 材料与方法 | 第86-90页 |
| 1．1 供试菌株 | 第86页 |
| 1．2 供试水稻品种 | 第86页 |
| 1．3 无毒基因定位群体的构建与遗传分析 | 第86-87页 |
| 1．4 稻瘟菌基因组DNA的提取 | 第87页 |
| 1．5 SSR分析 | 第87-88页 |
| 1．6 SCAR分析 | 第88页 |
| 1．7 rep-PCR分析 | 第88-89页 |
| 1．8 RAPD-BSA分析 | 第89-90页 |
| 1．9 连锁遗传分析 | 第90页 |
| 2 结果与分析 | 第90-99页 |
| 2．1 无毒基因Avr-Pia和Avr-Pit的遗传分析与鉴定 | 第90-93页 |
| 2．1．1 稻瘟病菌亲本菌株在供试水稻品种上的致病性测定 | 第90页 |
| 2．1．2 无毒基因的鉴定与遗传分析 | 第90-92页 |
| 2．1．3 群体F2代杂交及回交后代的遗传分析 | 第92-93页 |
| 2．1．4 无毒基因Avr-Pia和Avr-Pit的鉴定 | 第93页 |
| 2．2 无毒基因Avr-Pia和Avr-Pit的分子定位 | 第93-99页 |
| 2．2．1 无毒基因Avr-Pia和Avr-Pit在染色体上的初步定位 | 第93-94页 |
| 2．2．2 无毒基因Avr-Pia和Avr-Pit在染色体上的进一步定位 | 第94-99页 |
| 3 结论与讨论 | 第99-105页 |
| 第四章 稻瘟病菌无毒基因Avr-Pia和Avr-Pit的SCAR分子标记及物理图谱的初步构建 | 第105-118页 |
| 1 材料与方法 | 第107-110页 |
| 1．1 材料 | 第107-108页 |
| 1．2 方法 | 第108-110页 |
| 1．2．1 稻瘟病菌基因组DNA的提取 | 第108页 |
| 1．2．2 RAPD扩增 | 第108页 |
| 1．2．3 与无毒基因Avr-Pia和Avr-Pit连锁片段的克隆与测序 | 第108-110页 |
| 1．2．4 SCAR引物的设计和PCR扩增 | 第110页 |
| 1．2．5 标记的定位与物理图谱的初步构建 | 第110页 |
| 2 结果与分析 | 第110-114页 |
| 2．1 RAPD标记片段的回收、克隆与测序 | 第110页 |
| 2．2 SCAR标记的鉴定 | 第110-112页 |
| 2．3 RAPD标记在染色体上的定位 | 第112-113页 |
| 2．4 无毒基因物理图谱的初步构建 | 第113-114页 |
| 3 结论与讨论 | 第114-118页 |
| 第五章 稻瘟病菌种特异性无毒基因PRE1的鉴定、遗传分析与标记定位 | 第118-135页 |
| 1 材料与方法 | 第120-122页 |
| 1．1 供试菌株 | 第120页 |
| 1．2 供试水稻品种及杂草 | 第120页 |
| 1．3 无毒基因定位群体的构建与遗传分析 | 第120-121页 |
| 1．4 稻瘟菌基因组DNA的提取 | 第121页 |
| 1．5 SSR分析 | 第121页 |
| 1．6 SCAR分析 | 第121页 |
| 1．7 rep-PCR分析 | 第121页 |
| 1．8 RAPD-BSA分析 | 第121-122页 |
| 1．8．1 无毒池与毒性池的构建 | 第121页 |
| 1．8．2 RAPD随机引物的筛选 | 第121页 |
| 1．8．3 PCR扩增及检测 | 第121-122页 |
| 1．9 连锁遗传分析 | 第122页 |
| 2 结果与分析 | 第122-128页 |
| 2．1 无毒基因PRE1的遗传分析与鉴定 | 第122-125页 |
| 2．1．1 稻瘟病菌亲本菌株在供试水稻品种上的致病性 | 第122页 |
| 2．1．2 亲本菌株6023的寄主范围测定 | 第122-123页 |
| 2．1．3 两亲本菌株DNA指纹图谱的差异 | 第123页 |
| 2．1．4 无毒基因PRE1的鉴定与遗传分析 | 第123-124页 |
| 2．1．5 无毒基因PRE1的鉴定 | 第124-125页 |
| 2．2 无毒基因PRE1的分子定位 | 第125-128页 |
| 2．2．1 无毒基因PRE1在染色体上的初步定位 | 第125页 |
| 2．2．2 无毒基因PRE1在染色体上的进一步定位 | 第125-128页 |
| 3 结论与讨论 | 第128-135页 |
| 附录 | 第135-152页 |
| 附录一 福建省大豆疫病病原鉴定及其核糖体DNA-ITS序列的分析 | 第137-146页 |
| 附录二 SSR引物及SCAR引物序列表 | 第146-152页 |
| 攻读博士学位期间发表的研究论文 | 第152-153页 |
| 致谢 | 第153页 |
