| 致谢 | 第1-5页 |
| 摘要 | 第5-11页 |
| 第一部分 文献综述 | 第11-75页 |
| 第一章 家蚕基因组研究及其生物信息资源的利用 | 第12-41页 |
| 1 家蚕分子遗传图谱 | 第12-18页 |
| ·RFLP分析 | 第13-14页 |
| ·RAPD分析 | 第14-16页 |
| ·AFLP分析 | 第16-17页 |
| ·SSR-PCR分析 | 第17页 |
| ·家蚕数量性状基因位点(Quantitative Trait Locus，QTL)定位 | 第17-18页 |
| 2 家蚕基因组测序 | 第18-20页 |
| 3 家蚕功能基因研究 | 第20-27页 |
| ·家蚕EST | 第21-23页 |
| ·RNA干涉 | 第23-25页 |
| ·家蚕蛋白质组研究 | 第25-27页 |
| 4 家蚕分子生物学数据库资源的利用 | 第27-41页 |
| ·公共数据库 | 第27-30页 |
| ·家蚕生物信息学专业数据库 | 第30-41页 |
| 第二章 家蚕性别决定 | 第41-56页 |
| 1 果蝇的性别决定机理 | 第42-45页 |
| ·果蝇的体细胞性别分化阶梯 | 第43-44页 |
| ·剂量补偿 | 第44-45页 |
| ·生殖细胞分化 | 第45页 |
| 2 家蚕的性别决定机理 | 第45-56页 |
| ·家蚕的性染色体 | 第46-47页 |
| ·家蚕的性别决定 | 第47-56页 |
| 第三章 实时定量PCR研究进展及其应用 | 第56-75页 |
| 1 定量PCR的定量原理 | 第56页 |
| 2 定量PCR的方法学进展 | 第56-60页 |
| ·外对照PCR定量 | 第57-58页 |
| ·有限稀释PCR定量分析 | 第58页 |
| ·内对照PCR定量 | 第58-59页 |
| ·竞争性定量PCR | 第59-60页 |
| 3 实时荧光定量PCR | 第60-70页 |
| ·实时定量PCR的定量基础 | 第61页 |
| ·常用的Real-time PCR仪 | 第61-62页 |
| ·实时定量PCR荧光模式 | 第62-67页 |
| ·建立实时PCR分析体系的关键 | 第67-68页 |
| ·扩增效率 | 第68-69页 |
| ·局限性 | 第69-70页 |
| 4 实时定量PCR的应用现状 | 第70-75页 |
| 第二部分 一般材料与方法 | 第75-96页 |
| 第四章 利用家蚕生物信息学数据库资源 | 第76-87页 |
| 1 家蚕新基因电子克隆的基本思路 | 第76-78页 |
| 2 目标基因相关的EST序列分析 | 第78-80页 |
| ·EST序列分析工具 | 第78-79页 |
| ·目标基因EST序列延伸相关生物信息学资源 | 第79页 |
| ·利用UniGene数据库进行目标基因电子延伸 | 第79-80页 |
| 3 目标基因cDNA序列电子克隆 | 第80-81页 |
| ·目标基因种子EST序列的获得 | 第80页 |
| ·组装序列的EST候选清单的获取 | 第80-81页 |
| ·目标基因cDNA序列的拼接组装 | 第81页 |
| ·目标基因cDNA序列开放阅读框分析 | 第81页 |
| 4 目标基因DNA序列的电子克隆与分析 | 第81-82页 |
| ·目标基因cDNA序列与基因组序列的对齐及其内含子／外显子显示 | 第82页 |
| ·目标基因因启动子及其他转录调控位点分析 | 第82页 |
| 5 目标基因蛋白质序列分析及同源性比较 | 第82-87页 |
| ·目标基因蛋白质基本性质分析 | 第82-83页 |
| ·目标基因蛋白质功能预测 | 第83页 |
| ·不同物种间目标基因蛋白质序列之间的多重比对及分子进化分析 | 第83-87页 |
| 第五章 分子生物学研究的材料和方法 | 第87-96页 |
| 1 材料 | 第87-88页 |
| ·昆虫 | 第87页 |
| ·菌种和载体 | 第87页 |
| ·试剂和仪器 | 第87-88页 |
| 2 方法 | 第88-96页 |
| ·培养基和缓冲液 | 第88页 |
| ·细菌培养 | 第88页 |
| ·质粒DNA的少量提取(碱法) | 第88-90页 |
| ·核酸纯化 | 第90-91页 |
| ·连接反应 | 第91页 |
| ·昆虫总RNA的提取 | 第91页 |
| ·RT-PCR | 第91-92页 |
| ·昆虫基因组DNA的制备 | 第92-93页 |
| ·感受态细胞制备及转化 | 第93-94页 |
| ·重组质粒的鉴定 | 第94页 |
| ·DNA序列测定及分析 | 第94-96页 |
| 第三部分 研究内容、结果和分析 | 第96-166页 |
| 第六章 家蚕磷酸甘油醛异构酶(Bmtpi)基因的克隆 | 第97-112页 |
| 1 材料和方法 | 第97-99页 |
| ·实验材料和仪器 | 第97页 |
| ·方法 | 第97-99页 |
| 2 结果 | 第99-109页 |
| ·家蚕EST数据库的检索 | 第99-103页 |
| ·家蚕Bmtpi基因cDNA片段的克隆与分析 | 第103页 |
| ·家蚕Bmtpi基因组DNA片段的克隆与结构分析 | 第103-109页 |
| ·家蚕Bmtpi基因编码蛋白的功能分析及不同物种间蛋白质同源性比较 | 第109页 |
| 3 讨论 | 第109-112页 |
| 第七章 家蚕Bmtpi基因的染色体定位 | 第112-122页 |
| 1 材料与方法 | 第112-114页 |
| ·实验材料和仪器 | 第112页 |
| ·方法 | 第112-114页 |
| 2 结果 | 第114-119页 |
| ·标准曲线的建立 | 第114-117页 |
| ·家蚕基因组中Bmtpi基因拷贝数的测定及其染色体定位 | 第117-119页 |
| 3 讨论 | 第119-122页 |
| 第八章 家蚕Bombyx mori transformer-2基因的克隆 | 第122-145页 |
| 1 材料和方法 | 第123-125页 |
| ·实验材料和仪器 | 第123页 |
| ·方法 | 第123-125页 |
| 2 结果 | 第125-141页 |
| ·家蚕EST数据库的检索 | 第125-130页 |
| ·家蚕Bmtra-2基因cDNA片段的克隆与northern杂交分析 | 第130-131页 |
| ·家蚕Bmtra-2基因DNA片段的克隆与结构分析 | 第131-138页 |
| ·家蚕Bmtra-2基因编码蛋白的功能分析及不同物种间蛋白质同源性比较 | 第138-141页 |
| 3 讨论 | 第141-145页 |
| 第九章 家蚕Bmtra-2基因pre-mRNA选择性剪切分析 | 第145-164页 |
| 1 材料和方法 | 第145-147页 |
| ·实验材料和仪器 | 第145页 |
| ·方法 | 第145-147页 |
| 2 结果 | 第147-157页 |
| ·检索家蚕Bmtra-2基因相关的EST序列 | 第147-157页 |
| ·RT-PCR检验家蚕Bmtra-2基因pre-mRNA的选择性剪接 | 第157页 |
| ·家蚕BmTRA-2同工蛋白质分析 | 第157页 |
| 3 讨论 | 第157-164页 |
| 第十章 创新与进一步研究的设想 | 第164-166页 |
| 1 创新点 | 第164页 |
| 2 进一步研究的设想 | 第164-166页 |
| ·家蚕剂量补偿的研究 | 第164-165页 |
| ·Bmtra-2基因功能的研究 | 第165-166页 |
| Abstract | 第166-171页 |
| 附录Ⅰ | 第171-175页 |
| 附录Ⅱ | 第175-176页 |
| 附录Ⅲ | 第176页 |
