| ACKNOWLEDGEMENT | 第1-16页 |
| ABSTRACT | 第16-19页 |
| 摘要 | 第19-21页 |
| CHAPTER 1 | 第21-25页 |
| INTRODUCTION | 第21-25页 |
| ·General Introduction | 第21-23页 |
| ·Objectives of the Study | 第23-24页 |
| ·Overview of the Study | 第24-25页 |
| CHAPTER 2 | 第25-45页 |
| REVIEW OF LITERATURE | 第25-45页 |
| ·Mixed Linear Model | 第25-28页 |
| ·Diagnostics Analysis for Influential Observations | 第28-41页 |
| ·Diagnostic analysis forlinear models | 第29-32页 |
| ·Diagnostic analysis for mixed linear models | 第32-37页 |
| ·Case deletion diagnostics for mixed linear models | 第37-41页 |
| ·Residuals and Influence Diagnostics | 第41-42页 |
| ·Masking and Swamping Effects | 第42-43页 |
| ·Motivation in Genetic Data Analysis | 第43-45页 |
| CHAPTER 3 | 第45-56页 |
| STATISTICAL METHODS FOR ESTIMATION AND PREDICTION OF MODEL PARAMETERS | 第45-56页 |
| ·Introduction | 第45-46页 |
| ·MINQUE Methods | 第46-47页 |
| ·The EM-algorithm | 第47-49页 |
| ·Prediction of Random Effects | 第49-54页 |
| ·Best linear unbiased prediction(BLUP) | 第50-51页 |
| ·Linear unbiased prediction(LUP) | 第51-52页 |
| ·Adjusted unbiased prediction(AUP) | 第52-54页 |
| ·Residuals and Studentization | 第54-56页 |
| CHAPTER 4 | 第56-91页 |
| METHODS FOR INFLUENCE ANALYSIS:SIMULATION | 第56-91页 |
| ·Introduction | 第56-58页 |
| ·Statistical Functions for Influence Analysis | 第58-61页 |
| ·Influence on fixed effects | 第58-60页 |
| ·Analogue of the Cook's Distance | 第58-59页 |
| ·Analogue of the Variance Ratio | 第59-60页 |
| ·Analogue of the Andrews-Pregibon Statistic | 第60页 |
| ·Analogue of the Cook-Weisberg Statistic | 第60页 |
| ·Influence on random effects | 第60-61页 |
| ·Analogue of the Cook's distance | 第60-61页 |
| ·Criteria for Detection of Outliers | 第61-63页 |
| ·Detecting single outlier | 第61-62页 |
| ·Detecting multiple outliers | 第62-63页 |
| ·Monte Carlo Simulations | 第63-66页 |
| ·General genetic model | 第63-64页 |
| ·Generating the phenotype data | 第64-66页 |
| ·Simulation Results | 第66-84页 |
| ·Clean data set | 第66-68页 |
| ·Single genotype in different location(s)and year(s) | 第68-74页 |
| ·Multiple genotypes in different locations and years | 第74-79页 |
| ·Special cases for aberrant observations | 第79-84页 |
| ·Discussion | 第84-90页 |
| ·Conclusions | 第90-91页 |
| CHAPTER 5 | 第91-119页 |
| INFLUENCE DIAGNOSTIC ANALYSIS:WORKED EXAMPLES | 第91-119页 |
| ·Introduction | 第91页 |
| ·Experimental Data of Rice Yield | 第91-101页 |
| ·Results of the influence analysis:Rice yield data | 第92-95页 |
| ·Case deletion diagnostics for rice yield data | 第95-97页 |
| ·Effect of the influential observations and outliers | 第97-101页 |
| ·Effect on variance components | 第97-99页 |
| ·Effect on random components | 第99-101页 |
| ·Reduced Model for Rice Yield Data | 第101-103页 |
| ·Description of reduced model | 第101页 |
| ·Results of the influence analysis for reduced model | 第101-103页 |
| ·QTL Mapping of Experimental Data | 第103-111页 |
| ·Description of data | 第103-104页 |
| ·Methods for QTL mapping analysis | 第104-105页 |
| ·Results of the QTL mapping data | 第105-108页 |
| ·QTL Mapping Results:Simulation | 第108-111页 |
| ·Discussion | 第111-117页 |
| ·Rice yield data analysis | 第111-113页 |
| ·QTL mapping data analysis | 第113-117页 |
| ·Importance of the Methods in Biological Research | 第117-119页 |
| CHAPTER 6 | 第119-124页 |
| SUMMARY AND RECOMMENDATIONS | 第119-124页 |
| ·Summary | 第119-123页 |
| ·Recommendations | 第123-124页 |
| References | 第124-137页 |
| Curriculum Vitae | 第137页 |
