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马流感病毒A/Equine/Xinjiang/3/07(H3N8)HA基因的序列分析及两种PCR检测方法的建立

摘要第1-7页
Abstract第7-13页
第一章 前言第13-22页
   ·马流感病原学概况第13-17页
     ·马流感病毒的形态结构第13-14页
     ·马流感病毒的基因组结构及其产物功能第14-15页
     ·理化特性第15页
     ·培养特性第15页
     ·病毒的复制第15-16页
     ·EIV 的变异第16-17页
   ·马流感诊断方法研究进展与应用概况第17-20页
     ·病原学诊断方法第17-19页
     ·血清学诊断技术第19-20页
   ·本研究的目的与意义第20-22页
第二章 马流感病毒HA 基因的克隆与序列分析第22-31页
   ·材料第22-23页
     ·菌种、鸡血与鸡胚第22页
     ·质粒载体与工具酶第22页
     ·主要仪器第22页
     ·其它主要化学试剂第22页
     ·常用溶液及培养基第22-23页
   ·方法第23-26页
     ·病毒的分离第23页
     ·引物的设计及合成第23-24页
     ·病毒总RNA 的提取第24页
     ·cDNA 的合成第24页
     ·PCR 扩增HA 片段第24页
     ·PCR 产物的回收和纯化第24页
     ·目的DNA 片段连接T 载体第24-25页
     ·连接产物转化感受态细胞第25页
     ·阳性重组质粒的筛选及鉴定第25-26页
     ·目的基因片段核苷酸序列的测定与序列分析第26页
   ·结果第26-29页
     ·EIV 的分离及电镜观察第26-27页
     ·EIV 的亚型鉴定及命名第27页
     ·EIV 的HA 基因RT-PCR 扩增第27-28页
     ·HA 基因的克隆及鉴定第28页
     ·HA 基因的序列测定第28页
     ·HA 基因的同源性分析第28页
     ·HA 基因的遗传进化树分析第28-29页
   ·讨论第29-31页
第三章 马流感病毒双重RT-PCR 检测方法的建立第31-37页
   ·材料第31页
     ·病毒第31页
     ·主要仪器第31页
     ·主要试剂第31页
   ·方法第31-33页
     ·引物设计第31-32页
     ·病毒RNA 的提取第32页
     ·病毒RNA 反转录合成cDNA第32页
     ·EIV 通用型特异性RT-PCR 扩增第32页
     ·H3N8 亚型EIV 特异性RT-PCR 扩增第32-33页
     ·双重RT-PCR 反应条件优化第33页
     ·特异性试验第33页
     ·敏感性试验第33页
     ·双重RT-PCR 检测方法的初步应用第33页
   ·结果第33-36页
     ·EIV 通用型特异性目的片段扩增结果第33-34页
     ·H3N8 亚型EIV 特异性片段扩增结果第34页
     ·序列测定第34页
     ·双重RT-PCR 反应条件优化第34-35页
     ·RT-PCR 特异性第35页
     ·RT-PCR 敏感性第35页
     ·样品检测第35-36页
   ·讨论第36-37页
第四章 H3N8 亚型马流感病毒荧光定量PCR 检测方法的建立第37-49页
   ·材料第37页
     ·病毒与菌株第37页
     ·主要仪器第37页
     ·主要试剂第37页
   ·方法第37-42页
     ·引物及探针的设计与合成第37页
     ·EIV 基因组RNA 的提取第37-38页
     ·反转录合成cDNA第38页
     ·标准质粒的构建第38-40页
     ·荧光定量PCR 方法的建立第40-42页
     ·荧光定量PCR 方法的评价第42页
     ·临床样品检测第42页
   ·结果第42-47页
     ·常规PCR 扩增HA-standard 基因片段电泳结果第42-43页
     ·重组质粒的鉴定第43-44页
     ·标准质粒浓度的计算第44页
     ·荧光定量PCR 反应条件的优化第44页
     ·荧光定量PCR 标准曲线的绘制第44-45页
     ·荧光定量PCR 的特异性第45页
     ·荧光定量PCR 的重复性第45-46页
     ·荧光定量PCR 的敏感性第46页
     ·临床样品检测结果第46-47页
   ·讨论第47-49页
第五章 全文结论第49-50页
参考文献第50-56页
附录第56-60页
致谢第60-61页
作者简介第61页

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