感谢 | 第1-7页 |
摘要 | 第7-8页 |
ABSTRACT | 第8-13页 |
LIST OF TABLES | 第13-15页 |
LIST OF FIGURES | 第15-16页 |
1 INTRODUCTION | 第16-21页 |
·COMPLEX TRAITS | 第16-17页 |
·THE DEFINITIONS OF GENE-GENE INTERACTION | 第17-18页 |
·ASSOCIATION STUDIES | 第18-19页 |
·MDR | 第19-21页 |
2 ASSOCIATION OF AMYLOID PRECURSOR PROTEIN-BINDING PROTEIN,FAMILY B,MEMBER 1 WITH NICOTINE DEPENDENCE IN AFRICAN AND EUROPEAN AMERICAN SMOKERS | 第21-31页 |
·INTRODUCTION | 第21-22页 |
·METHODS | 第22-24页 |
·RESULTS | 第24-25页 |
·Association analysis of individual SNPs | 第24页 |
·Haplotype analysis | 第24-25页 |
·DISCUSSION | 第25-31页 |
3 A UNIFIED APPROACH TO DETECTING INTERACTIONS UNDERLYING COMPLEX DISEASES IN NUCLEAR FAMILY-BASED STUDIES | 第31-53页 |
·INTRODUCTION | 第31-33页 |
·METHODS | 第33-35页 |
·Test Statistics for nuclear families | 第33-34页 |
·Distribution of the test statistic for interaction | 第34-35页 |
·MONTE CARLO SIMULATIONS | 第35-40页 |
·STATISTICAL COMPARISON RESULTS OF FGMDR AND PGMDR | 第40-48页 |
·The conditional distribution of full sibs | 第40-45页 |
·The genotype distribution of the nontransmitted genotypes | 第45-48页 |
·APPLICATION TO A NICOTINE DEPENDENCY STUDY | 第48-49页 |
·RESULTS | 第49-50页 |
·Simulation results | 第49页 |
·Statistical results | 第49-50页 |
·DISCUSSION | 第50-53页 |
4 EXPERIMENTAL DESIGN FOR DETECTING GENE-GENE INTERACTIONS IN PRACTICAL AND THEORETICAL CONSIDERATIONS | 第53-70页 |
·INTRODUCTION | 第53-54页 |
·MATERIALS AND METHODS | 第54-62页 |
·Literature overview | 第54-58页 |
·Data reduction method | 第58-59页 |
·Logistic model for a dichotomous trait | 第59页 |
·Conditional genotype and score distributions | 第59-61页 |
·Accuracy and Testing Accuracy | 第61-62页 |
·MONTE CARLO SIMULATIONS | 第62-64页 |
·RESULTS | 第64-67页 |
·DISCUSSION | 第67-70页 |
5 GMDR:A SOFTWARE PACKAGE FOR DETECTING GENE-GENE AND GENE-ENVIRONMENT INTERACTIONS UNDERLYING COMPLEX TRAITS | 第70-80页 |
·INTRODUCTION | 第70页 |
·OVERVIEW OF THE SOFTWARE | 第70-71页 |
·ALGORITHM | 第71-75页 |
·Data reduction algorithm | 第71-72页 |
·Score statistics | 第72-75页 |
·METHODS | 第75-77页 |
·Population-based method | 第75-76页 |
·Family-based method Ⅰ(PGMDR) | 第76页 |
·Family-based method Ⅱ(FGMDR) | 第76-77页 |
·IMPLEMENTATION | 第77-78页 |
·WORKED EXAMPLE | 第78-79页 |
·AVAILABILITY | 第79-80页 |
REFERENCE | 第80-94页 |
APPENDIXES | 第94-99页 |
APPENDIX A:ALGORITHM FOR MULTIFACTOR DIMENSIONALITY REDUCTION | 第94-96页 |
APPENDIX B:ALGORITHM FOR COMPUTATION OF THE CONDITIONAL DISTRIBUTION OF NONTRANSMITTED GENOTYPES | 第96-99页 |
个人简历 | 第99-100页 |
PUBLICATIONS | 第100页 |