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基因互作探测的统计方法研究

感谢第1-7页
摘要第7-8页
ABSTRACT第8-13页
LIST OF TABLES第13-15页
LIST OF FIGURES第15-16页
1 INTRODUCTION第16-21页
   ·COMPLEX TRAITS第16-17页
   ·THE DEFINITIONS OF GENE-GENE INTERACTION第17-18页
   ·ASSOCIATION STUDIES第18-19页
   ·MDR第19-21页
2 ASSOCIATION OF AMYLOID PRECURSOR PROTEIN-BINDING PROTEIN,FAMILY B,MEMBER 1 WITH NICOTINE DEPENDENCE IN AFRICAN AND EUROPEAN AMERICAN SMOKERS第21-31页
   ·INTRODUCTION第21-22页
   ·METHODS第22-24页
   ·RESULTS第24-25页
     ·Association analysis of individual SNPs第24页
     ·Haplotype analysis第24-25页
   ·DISCUSSION第25-31页
3 A UNIFIED APPROACH TO DETECTING INTERACTIONS UNDERLYING COMPLEX DISEASES IN NUCLEAR FAMILY-BASED STUDIES第31-53页
   ·INTRODUCTION第31-33页
   ·METHODS第33-35页
     ·Test Statistics for nuclear families第33-34页
     ·Distribution of the test statistic for interaction第34-35页
   ·MONTE CARLO SIMULATIONS第35-40页
     ·STATISTICAL COMPARISON RESULTS OF FGMDR AND PGMDR第40-48页
     ·The conditional distribution of full sibs第40-45页
     ·The genotype distribution of the nontransmitted genotypes第45-48页
   ·APPLICATION TO A NICOTINE DEPENDENCY STUDY第48-49页
   ·RESULTS第49-50页
     ·Simulation results第49页
     ·Statistical results第49-50页
   ·DISCUSSION第50-53页
4 EXPERIMENTAL DESIGN FOR DETECTING GENE-GENE INTERACTIONS IN PRACTICAL AND THEORETICAL CONSIDERATIONS第53-70页
   ·INTRODUCTION第53-54页
   ·MATERIALS AND METHODS第54-62页
     ·Literature overview第54-58页
     ·Data reduction method第58-59页
     ·Logistic model for a dichotomous trait第59页
     ·Conditional genotype and score distributions第59-61页
     ·Accuracy and Testing Accuracy第61-62页
   ·MONTE CARLO SIMULATIONS第62-64页
   ·RESULTS第64-67页
   ·DISCUSSION第67-70页
5 GMDR:A SOFTWARE PACKAGE FOR DETECTING GENE-GENE AND GENE-ENVIRONMENT INTERACTIONS UNDERLYING COMPLEX TRAITS第70-80页
   ·INTRODUCTION第70页
   ·OVERVIEW OF THE SOFTWARE第70-71页
   ·ALGORITHM第71-75页
     ·Data reduction algorithm第71-72页
     ·Score statistics第72-75页
   ·METHODS第75-77页
     ·Population-based method第75-76页
     ·Family-based method Ⅰ(PGMDR)第76页
     ·Family-based method Ⅱ(FGMDR)第76-77页
   ·IMPLEMENTATION第77-78页
   ·WORKED EXAMPLE第78-79页
   ·AVAILABILITY第79-80页
REFERENCE第80-94页
APPENDIXES第94-99页
 APPENDIX A:ALGORITHM FOR MULTIFACTOR DIMENSIONALITY REDUCTION第94-96页
 APPENDIX B:ALGORITHM FOR COMPUTATION OF THE CONDITIONAL DISTRIBUTION OF NONTRANSMITTED GENOTYPES第96-99页
个人简历第99-100页
PUBLICATIONS第100页

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