| 摘要 | 第1-5页 |
| Summary | 第5-11页 |
| 第一章 文献综述 | 第11-35页 |
| 1 我国牦牛分类及甘肃牦牛品种介绍 | 第11-14页 |
| ·我国牦牛分类 | 第11-12页 |
| ·甘肃牦牛介绍 | 第12-14页 |
| ·甘肃天祝白牦牛（Tianzhu White yak of Gansu） | 第12-13页 |
| ·甘肃甘南牦牛（Gannan yak of Gansu） | 第13-14页 |
| 2 牛MHC（BoLA）概述 | 第14-27页 |
| ·BoLA 的发现与命名 | 第15-17页 |
| ·BoLA 基因的定位及其结构 | 第17-20页 |
| ·BoLAⅠ | 第17-19页 |
| ·BoLA Ⅱ类基因 | 第19-20页 |
| ·BoLAⅢ类基因 | 第20页 |
| ·BoLA 基因的基本特征 | 第20-21页 |
| ·BoLA 多态形成的机制 | 第21-22页 |
| ·BoLA 的生物学功能 | 第22-25页 |
| ·BoLA 与经济性状的研究进展 | 第25-27页 |
| ·BoLA 与生产性状的关联 | 第25-26页 |
| ·BoLA 与抗病性的关联 | 第26-27页 |
| 3 TLRs 概述 | 第27-34页 |
| ·TLR 的发现 | 第27-28页 |
| ·TLR 的结构和配体 | 第28-30页 |
| ·TLR 介导的信号传导 | 第30-32页 |
| ·TLRs 的生物学作用 | 第32-34页 |
| ·牛TLRs | 第34页 |
| 4 本研究的目的和意义 | 第34-35页 |
| 第二章 材料与方法 | 第35-41页 |
| 1 试验材料、试剂、仪器设备和溶液配制 | 第35页 |
| ·试验材料 | 第35页 |
| ·样品来源 | 第35页 |
| ·主要试剂及来源 | 第35页 |
| ·常用溶液配制 | 第35页 |
| ·常用仪器及设备 | 第35页 |
| 2 实验方法 | 第35-41页 |
| ·技术路线 | 第35-36页 |
| ·基因组DNA 的提取 | 第36页 |
| ·基因组DNA 浓度和纯度的检测 | 第36页 |
| ·基因扩增引物设计与PCR 体系建立 | 第36-39页 |
| ·DNA 序列的测定及其拼接 | 第39页 |
| ·分析方法 | 第39-41页 |
| ·核酸序列基本特征分析 | 第39页 |
| ·核酸序列启动子、重复元件及CpG 岛检测 | 第39页 |
| ·蛋白基本特征 | 第39-40页 |
| ·蛋白分子跨膜区与信号肽预测 | 第40页 |
| ·磷酸化位点分析 | 第40页 |
| ·糖基化位点分析 | 第40页 |
| ·亚细胞定位 | 第40页 |
| ·蛋白二级结构分析 | 第40页 |
| ·蛋白结构域的预测 | 第40-41页 |
| 第三章 结果与分析 | 第41-89页 |
| 1 牦牛基因组DNA 提取结果 | 第41页 |
| 2 牦牛DRA，TLR1，TLR2 和TLR5-9 基因PCR 扩增产物检测结果 | 第41-42页 |
| 3 牦牛DRA, TLR1，TLR2 和 TLR5-9 基因测序结果 | 第42-43页 |
| 4 牦牛DRA 基因序列分析 | 第43-49页 |
| ·DRA 基因第二外显子序列特征分析 | 第43-45页 |
| ·DRA 基因第二外显子氨基酸序列比较 | 第45-46页 |
| ·DRA 基因第二外显子氨基酸系统发育分析 | 第46-49页 |
| 5 牦牛TLR 家族部分基因及其分子 | 第49-89页 |
| ·碱基组成及SNPs 分析 | 第49-60页 |
| ·TLR1 碱基组成及SNPs 分析 | 第49-50页 |
| ·TLR2 碱基组成及SNPs 分析 | 第50-51页 |
| ·TLR5 碱基组成及SNPs 分析 | 第51-53页 |
| ·TLR6 碱基组成及SNPs 分析 | 第53-54页 |
| ·TLR7 碱基组成及SNPs 分析 | 第54-55页 |
| ·TLR8 碱基组成及SNPs 分析 | 第55-56页 |
| ·TLR9 碱基组成及 SNPs 分析 | 第56-60页 |
| ·TLR 核酸序列启动子、重复序列及CpG 岛检测 | 第60-61页 |
| ·TLR1 核酸序列分析 | 第60页 |
| ·TLR2 核酸序列分析 | 第60页 |
| ·TLR5 核酸序列分析 | 第60页 |
| ·TLR6 核酸序列分析 | 第60页 |
| ·TLR7 核酸序列分析 | 第60页 |
| ·TLR8 核酸序列分析 | 第60-61页 |
| ·TLR9 核酸序列分析 | 第61页 |
| ·TLR 蛋白序列分析 | 第61-64页 |
| ·TLR1 分子 | 第61-63页 |
| ·TLR2 分子 | 第63页 |
| ·TLR5 分子 | 第63页 |
| ·TLR6 分子 | 第63页 |
| ·TLR7 分子 | 第63页 |
| ·TLR8 分子 | 第63页 |
| ·TLR9 分子 | 第63页 |
| ·TLR 家族NJ 系统发育树 | 第63-64页 |
| ·TLR 疏水性分析 | 第64-68页 |
| ·TLR 分子跨膜区预测 | 第68-70页 |
| ·TLR 分子信号肽预测 | 第70-73页 |
| ·TLR 分子磷酸化位点分析 | 第73-75页 |
| ·TLR 分子糖基化位点分析 | 第75-80页 |
| ·亚细胞定位 | 第80-81页 |
| ·TLR 分子二级结构分析 | 第81-88页 |
| ·TLR 分子结构域分析 | 第88-89页 |
| 第四章 讨论 | 第89-98页 |
| 1 牦牛DRA 基因外显子2 多态性特点 | 第89页 |
| 2 SNPs 的检测 | 第89-90页 |
| 3 核酸序列中启动子、重复序列及CpG 岛的预测 | 第90-92页 |
| ·启动子预测 | 第90-91页 |
| ·重复序列预测 | 第91-92页 |
| ·CpG 岛预测 | 第92页 |
| 4 TLR 分子疏水性和跨膜区预测 | 第92-94页 |
| 5 信号肽预测与亚细胞定位 | 第94-95页 |
| 6 蛋白翻译后修饰 | 第95-96页 |
| 7 TLRs 分子二级和三级结构预测 | 第96页 |
| 8 牦牛 TLRs 的分子结构域特点 | 第96-97页 |
| 9 生物信息学预测牦牛TLR 基因存在的问题 | 第97-98页 |
| 第五章 全文结论 | 第98-99页 |
| 第六章 本研究的创新及不足 | 第99-100页 |
| 致谢 | 第100-101页 |
| 参考文献 | 第101-109页 |
| 作者简介 | 第109-110页 |
| 导师简介 | 第110-113页 |
