| 摘要 | 第1-11页 |
| Abstract | 第11-14页 |
| 第一章 绪论 | 第14-34页 |
| ·引言 | 第14-15页 |
| ·核酸微阵列芯片技术与应用概述 | 第15-26页 |
| ·核酸微阵列芯片的分类 | 第15-16页 |
| ·核酸微阵列芯片的工作原理 | 第16-19页 |
| ·表达谱基因芯片 | 第19-21页 |
| ·检测型基因芯片 | 第21-23页 |
| ·基于基因芯片技术的崭新生物学研究模式 | 第23-24页 |
| ·基因芯片数据分析与处理概述 | 第24-26页 |
| ·论文的研究内容、主要贡献和组织结构 | 第26-34页 |
| ·论文的研究内容 | 第26-29页 |
| ·论文的主要贡献 | 第29-32页 |
| ·论文的组织结构 | 第32-34页 |
| 第二章 寡核苷酸基因芯片杂交动力学分析 | 第34-46页 |
| ·通过序列构成预测双链DNA稳定性 | 第34-38页 |
| ·计算预测完全匹配的双链DNA的稳定性 | 第35-37页 |
| ·存在错配的情况下计算预测双链DNA的稳定性 | 第37-38页 |
| ·寡核苷酸探针热力学特性的计算预测方法 | 第38-46页 |
| ·杂交反应中寡核苷酸探针和目标核酸分子折叠结构分析 | 第38-41页 |
| ·计算预测自由能与杂交反应荧光强度的相关性分析 | 第41-46页 |
| 第三章 寡核苷酸探针设计方法研究 | 第46-60页 |
| ·序列特异性寡核苷酸探针设计方法概述 | 第46-47页 |
| ·基于全局多序列对齐的组特异性寡核苷酸探针设计方法概述 | 第47-51页 |
| ·基于MCMC方法的组特异性寡核苷酸探针设计方法 | 第51-60页 |
| ·方法描述 | 第51-54页 |
| ·应用实例 | 第54-56页 |
| ·讨论 | 第56-60页 |
| 第四章 基于组合探针识别的大规模细菌分类165 rRNA基因芯片设计方法研究 | 第60-78页 |
| ·细菌分子生物学检测方法概述 | 第60-62页 |
| ·大规模16S rRNA细菌检测基因芯片设计中的关键问题 | 第62-63页 |
| ·基于相对熵和遗传算法的165 rRNA细菌检测基因芯片设计方法 | 第63-78页 |
| ·方法描述 | 第63-66页 |
| ·应用实例 | 第66-75页 |
| ·讨论 | 第75-78页 |
| 第五章 基于组合逻辑判别的细菌鉴定16S rRNA基因芯片设计方法研究 | 第78-88页 |
| ·细菌鉴定技术概述 | 第78-81页 |
| ·方法描述 | 第81-83页 |
| ·应用实例 | 第83-86页 |
| ·讨论 | 第86-88页 |
| 第六章 表达谱基因芯片数据标准化方法研究 | 第88-116页 |
| ·表达谱基因芯片数据分析方法概述 | 第88-91页 |
| ·一种新的野点剔除方法在表达谱基因芯片数据标准化中的应用 | 第91-116页 |
| ·方法描述 | 第91-102页 |
| ·仿真分析 | 第102-108页 |
| ·应用实例 | 第108-114页 |
| ·讨论 | 第114-116页 |
| 第七章 总结与展望 | 第116-122页 |
| ·论文工作总结 | 第116-118页 |
| ·未来工作展望 | 第118-122页 |
| 致谢 | 第122-124页 |
| 参考文献 | 第124-136页 |
| 作者在学期间取得的学术成果 | 第136-138页 |
| 附录A 997 个菌属特异性探针组 | 第138-171页 |
| 附录B 迭代重选择算法伪代码 | 第171-174页 |
