| 目录 | 第1-12页 |
| 摘要 | 第12-15页 |
| Abstract | 第15-19页 |
| 缩略词语表 | 第19-21页 |
| 第一章 文献综述 | 第21-50页 |
| 1 下丘脑-垂体-甲状腺轴基因研究进展 | 第21-42页 |
| ·下丘脑-垂体-甲状腺轴总论 | 第21-24页 |
| ·下丘脑-垂体系统 | 第21-22页 |
| ·下丘脑-垂体-甲状腺轴(HPT轴) | 第22-24页 |
| ·其他激素与HPT轴关系 | 第24页 |
| ·促甲状腺激素释放激素TRH基因研究进展 | 第24-27页 |
| ·引言 | 第24-25页 |
| ·TRH基因结构与表达调控 | 第25-26页 |
| ·TRH前体蛋白加工与翻译后调控 | 第26页 |
| ·TRH基因多态性与功能关联 | 第26-27页 |
| ·促甲状腺激素释放激素受体TRHR基因研究进展 | 第27-32页 |
| ·引言 | 第27-28页 |
| ·TRHR基因结构与表达调控 | 第28-29页 |
| ·TRHR蛋白结构与翻译后调控 | 第29-31页 |
| ·TRHR胞内信号通路 | 第31-32页 |
| ·TRHR基因多态性与功能关联 | 第32页 |
| ·促甲状腺激素TSH研究进展 | 第32-37页 |
| ·引言 | 第32-33页 |
| ·糖蛋白激素共同α亚基CGA基因结构与表达调控 | 第33-34页 |
| ·促甲状腺激素特异β亚基TSHB基因结构与表达调控 | 第34-35页 |
| ·TSH蛋白结构 | 第35-36页 |
| ·CGA基因多态性与功能关联 | 第36页 |
| ·TSHB基因多态性与功能关联 | 第36-37页 |
| ·促甲状腺激素受体TSHR基因研究进展 | 第37-42页 |
| ·引言 | 第37-38页 |
| ·TSHR基因结构与表达调控 | 第38-39页 |
| ·TSHR蛋白结构与翻译后调控 | 第39-40页 |
| ·TSHR胞内信号通路 | 第40-41页 |
| ·TSHR基因多态性与功能关联 | 第41-42页 |
| 2 单核苷酸多态性分型技术 | 第42-47页 |
| ·引言 | 第42页 |
| ·酶切法 | 第42-43页 |
| ·引物延伸法 | 第43-45页 |
| ·等位基因特异延伸 | 第43-45页 |
| ·微测序(单核苷酸引物延伸) | 第45页 |
| ·等位基因特异性杂交 | 第45页 |
| ·SNP分型技术应用前景 | 第45-47页 |
| 3 标签SNP选择 | 第47-49页 |
| ·标签SNP选择的意义和生物学依据 | 第47页 |
| ·标签SNP选择算法 | 第47-49页 |
| 4 本研究目的和意义 | 第49-50页 |
| 第二章 基因定位、克隆与表达谱分析 | 第50-83页 |
| 1 HPT轴五个关键基因的染色体定位与QTL分布 | 第50-61页 |
| ·TRH、CGA、TSHB、TSHR基因电子定位与QTL分布 | 第50-56页 |
| ·材料与方法 | 第50-51页 |
| ·TRH定位结果与QTL分析 | 第51-52页 |
| ·CGA定位结果与QTL分析 | 第52页 |
| ·TSHB定位结果与QTL分析 | 第52-54页 |
| ·TSHR定位结果与QTL分析 | 第54-56页 |
| ·TRHR基因RH定位与QTL分布 | 第56-59页 |
| ·RH定位原理 | 第56-57页 |
| ·材料与方法 | 第57-58页 |
| ·结果与分析 | 第58-59页 |
| ·讨论 | 第59-61页 |
| 2 TRHR基因克隆 | 第61-73页 |
| ·引言 | 第61-62页 |
| ·材料与方法 | 第62-68页 |
| ·实验材料、仪器设备和试剂 | 第62页 |
| ·总RNA提取与纯化 | 第62-63页 |
| ·3’RACE引物设计 | 第63-64页 |
| ·3’RACE扩增和产物纯化测序 | 第64-65页 |
| ·TRHR mRNA编码区全长扩增 | 第65-67页 |
| ·猪TRHR基因5’端结构分析 | 第67-68页 |
| ·结果与分析 | 第68-72页 |
| ·3’RACE实验结果 | 第68-69页 |
| ·猪TRHR mRNA编码区扩增结果 | 第69页 |
| ·编码序列生物信息学分析 | 第69-71页 |
| ·猪TRHR基因5’端结构 | 第71-72页 |
| ·讨论 | 第72-73页 |
| 3 组织表达谱分析 | 第73-83页 |
| ·材料与方法 | 第73-76页 |
| ·实验材料、仪器设备和试剂 | 第74页 |
| ·总RNA提取与纯化 | 第74页 |
| ·cDNA第一链合成 | 第74页 |
| ·荧光定量RT-PCR引物设计 | 第74页 |
| ·荧光定量RT-PCR | 第74-76页 |
| ·结果与分析 | 第76-81页 |
| ·内参基因扩增 | 第76页 |
| ·TRH基因组织表达谱 | 第76-77页 |
| ·TRHR基因组织表达谱 | 第77-78页 |
| ·CGA基因组织表达谱 | 第78-79页 |
| ·TSHB基因组织表达谱 | 第79-80页 |
| ·TSHR基因组织表达谱 | 第80-81页 |
| ·讨论 | 第81-83页 |
| 第三章 HPT轴基因遗传多态性发现与分析 | 第83-107页 |
| 1 HPT轴基因遗传多态性发现与功能预测 | 第83-90页 |
| ·材料与方法 | 第83-88页 |
| ·实验材料、仪器设备和试剂 | 第83-84页 |
| ·基因组DNA提取 | 第84-85页 |
| ·再测序PCR引物设计 | 第85-87页 |
| ·再测序PCR与产物纯化测序 | 第87页 |
| ·分析寻找基因多态座位 | 第87-88页 |
| ·多态座位功能预测分析软件与网站 | 第88页 |
| ·结果与分析 | 第88-90页 |
| ·TRH基因遗传多态性座位 | 第88-89页 |
| ·TRHR基因遗传多态性座位 | 第89页 |
| ·CGA基因遗传多态性座位 | 第89-90页 |
| ·TSHB基因遗传多态性座位 | 第90页 |
| ·TSHR基因遗传多态性座位 | 第90页 |
| ·讨论 | 第90页 |
| 2 HPT轴基因多态性座位分型方法的建立 | 第90-99页 |
| ·材料与方法 | 第90-95页 |
| ·实验材料、仪器设备与试剂 | 第90-91页 |
| ·PCR-RFLP分型 | 第91-92页 |
| ·四引物ARMS-PCR分型 | 第92-95页 |
| ·结果与分析 | 第95-99页 |
| ·TRH基因多态性座位分型电泳图 | 第95-96页 |
| ·TRHR基因多态性座位分型电泳图 | 第96页 |
| ·CGA基因多态性座位分型电泳图 | 第96-97页 |
| ·TSHB基因多态性座位分型电泳图 | 第97-98页 |
| ·TSHR基因多态性座位分型电泳图 | 第98-99页 |
| ·讨论 | 第99页 |
| 3 金华猪与皮特兰猪群中HPT轴基因SNP频率分布 | 第99-107页 |
| ·材料与方法 | 第99-100页 |
| ·实验材料、仪器设备和试剂 | 第99页 |
| ·基因组DNA提取 | 第99-100页 |
| ·HPT轴基因多态性座位分型 | 第100页 |
| ·统计分析 | 第100页 |
| ·结果与分析 | 第100-105页 |
| ·TRH基因SNP频率分布与单倍型分析 | 第100-102页 |
| ·TRHR基因SNP频率分布与单倍型分析 | 第102-103页 |
| ·CGA基因SNP频率分布与单倍型分析 | 第103-104页 |
| ·TSHB基因SNP频率分布与单倍型分析 | 第104-105页 |
| ·TSHR基因SNP频率分布与单倍型分析 | 第105页 |
| ·讨论 | 第105-107页 |
| 第四章 HPT轴基因多态性座位与经济性状的关联分析 | 第107-133页 |
| 1 材料与方法 | 第107-109页 |
| ·实验动物 | 第107页 |
| ·主要经济性状测定 | 第107-108页 |
| ·生长性状 | 第107页 |
| ·胴体性状 | 第107页 |
| ·肉质性状 | 第107-108页 |
| ·基因组DNA提取 | 第108页 |
| ·HPT轴基因SNP分型 | 第108页 |
| ·统计分析 | 第108-109页 |
| ·表型性状描述性统计分析 | 第108页 |
| ·单基因模型关联分析 | 第108-109页 |
| ·多基因模型关联分析 | 第109页 |
| 2 结果与分析 | 第109-130页 |
| ·表型性状描述性统计分析结果 | 第109-115页 |
| ·金皮资源家系生长性状统计结果 | 第109-111页 |
| ·金皮资源家系胴体性状统计结果 | 第111-113页 |
| ·金皮资源家系肉质性状统计结果 | 第113-115页 |
| ·TRH基因多态性对猪主要经济性状的遗传效应 | 第115-120页 |
| ·TRH基因多态性与猪生长性状关联分析结果 | 第115-117页 |
| ·TRH基因多态性与猪胴体性状关联分析结果 | 第117-118页 |
| ·TRH基因多态性与猪肉质性状关联分析结果 | 第118-120页 |
| ·TRHR基因多态对猪主要经济性状的遗传效应 | 第120-122页 |
| ·TRHR基因多态性与猪生长性状关联分析结果 | 第120页 |
| ·TRHR基因多态性与猪胴体性状关联分析结果 | 第120-121页 |
| ·TRHR基因多态性与猪肉质性状关联分析结果 | 第121-122页 |
| ·CGA基因多态性对猪主要经济性状的遗传效应 | 第122-124页 |
| ·CGA基因多态与猪生长性状关联分析结果 | 第122-123页 |
| ·CGA基因多态与猪胴体性状关联分析结果 | 第123-124页 |
| ·CGA基因多态与猪肉质性状关联分析结果 | 第124页 |
| ·TSHB基因多态性对猪主要经济性状的遗传效应 | 第124-127页 |
| ·TSHB基因多态与猪生长性状关联分析结果 | 第124-125页 |
| ·TSHB基因多态与猪胴体性状关联分析结果 | 第125-126页 |
| ·TSHB基因多态与猪肉质性状关联分析结果 | 第126-127页 |
| ·TSHR基因多态性对猪主要经济性状的遗传效应 | 第127-129页 |
| ·TSHR基因多态与猪生长性状关联分析结果 | 第127-128页 |
| ·TSHR基因多态性与猪胴体性状关联分析结果 | 第128页 |
| ·TSHR基因多态性与猪肉质性状关联分析结果 | 第128-129页 |
| ·多基因模型分析结果 | 第129-130页 |
| ·对生长性状的多基因模型分析结果 | 第129页 |
| ·对胴体性状的多基因模型分析结果 | 第129-130页 |
| ·对肉质性状的多基因模型分析结果 | 第130页 |
| 3 讨论 | 第130-133页 |
| ·TRH基因多态性遗传效应 | 第130-131页 |
| ·TRHR基因多态性遗传效应 | 第131页 |
| ·CGA基因多态性遗传效应 | 第131-132页 |
| ·TSHB基因多态性遗传效应 | 第132页 |
| ·TSHR基因多态性遗传效应 | 第132-133页 |
| 第五章 HPT轴基因多态性在其他品种群体中的分析 | 第133-143页 |
| 1 材料与方法 | 第133-134页 |
| ·实验材料 | 第133页 |
| ·实验动物 | 第133页 |
| ·性状记录 | 第133页 |
| ·基因组DNA提取 | 第133页 |
| ·HPT轴SNP座位分型 | 第133页 |
| ·统计分析 | 第133-134页 |
| ·群体遗传学分析 | 第133-134页 |
| ·关联分析 | 第134页 |
| 2 结果与分析 | 第134-141页 |
| ·群体遗传学分析 | 第134-139页 |
| ·基因与基因型频率 | 第134-138页 |
| ·哈代-温伯格平衡检验 | 第138页 |
| ·HPT轴基因遗传多样性 | 第138页 |
| ·种群间遗传距离 | 第138-139页 |
| ·关联分析 | 第139-141页 |
| ·HPT轴基因多态性在约克夏中的关联分析 | 第140页 |
| ·HPT轴基因多态性在杜洛克中的关联分析 | 第140页 |
| ·HPT轴基因多态性在长白猪中的关联分析 | 第140-141页 |
| 3 讨论 | 第141-143页 |
| 第六章 结论 | 第143-146页 |
| 参考文献 | 第146-160页 |
| 附录 | 第160-171页 |
| 攻读博士学位期间以第一作者发表(录用)的学术论文 | 第171-172页 |
| 致谢 | 第172页 |
