| 摘要 | 第1-5页 |
| Abstract | 第5-6页 |
| 目录 | 第6-8页 |
| 第一章 绪论 | 第8-12页 |
| ·研究背景及意义 | 第8-9页 |
| ·国内外研究现状 | 第9-10页 |
| ·研究内容及目标 | 第10页 |
| ·本文的结构安排 | 第10-12页 |
| 第二章 蛋白质折叠结构预测问题 | 第12-20页 |
| ·蛋白质的结构与功能 | 第12-14页 |
| ·蛋白质的分子结构 | 第12-13页 |
| ·蛋白质的功能 | 第13页 |
| ·蛋白质的结构与功能的关系 | 第13-14页 |
| ·蛋白质的折叠问题 | 第14页 |
| ·蛋白质结构预测方法 | 第14-15页 |
| ·蛋白质折叠结构预测的优化模型 | 第15-16页 |
| ·蛋白质折叠结构预测的算法 | 第16-19页 |
| ·本章小结 | 第19-20页 |
| 第三章 CPU+GPU 异构分布并行环境 | 第20-28页 |
| ·GPU 概述 | 第20-21页 |
| ·CPU+GPU 异构环境 | 第21-24页 |
| ·CUDA 平台 | 第22页 |
| ·线程层次结构 | 第22-23页 |
| ·存储系统 | 第23-24页 |
| ·线程同步 | 第24页 |
| ·GPU 多核处理器 | 第24-26页 |
| ·GPU 性能优化 | 第26-27页 |
| ·线程并行化 | 第26页 |
| ·优化内存 | 第26页 |
| ·优化指令 | 第26-27页 |
| ·本章小结 | 第27-28页 |
| 第四章 基于CPU+GPU 异构环境的遗传退火算法优化 | 第28-38页 |
| ·构建程序切片调度机制 | 第28-31页 |
| ·程序切片 | 第28-30页 |
| ·程序调度模型 | 第30页 |
| ·程序调度机制 | 第30-31页 |
| ·程序切片调度机制优化 | 第31页 |
| ·资源动态分配 | 第31-32页 |
| ·共享存储器优化 | 第32-33页 |
| ·内存合并 | 第33-34页 |
| ·指令优化 | 第34-36页 |
| ·展开循环优化 | 第36-37页 |
| ·遗传退火算法优化步骤 | 第37页 |
| ·本章小结 | 第37-38页 |
| 第五章 实验结果与分析 | 第38-45页 |
| ·实验环境 | 第38-40页 |
| ·运行环境 | 第38页 |
| ·CUDA 语言 | 第38-39页 |
| ·NVCC 编译器 | 第39-40页 |
| ·运行时API | 第40页 |
| ·实验步骤 | 第40-42页 |
| ·实验数据 | 第42-43页 |
| ·实验结果分析 | 第43-44页 |
| ·本章小节 | 第44-45页 |
| 第六章 工作总结与展望 | 第45-47页 |
| ·总结 | 第45页 |
| ·展望 | 第45-47页 |
| 参考文献 | 第47-50页 |
| 致谢 | 第50-51页 |
| 附录 A 攻读学位其间发表的论文 | 第51页 |