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鸡胚性分化早期性别差异表达miRNAs的鉴定及其特性分析

摘要第1-9页
ABSTRACT第9-11页
缩略词表第11-12页
1 前言第12-24页
   ·研究问题的由来第12-13页
   ·文献综述第13-23页
     ·miRNA简介第13-16页
       ·miRNA的发现、特征及其命名第13-14页
       ·miRNA的生物发生过程及其作用机制第14-16页
     ·miRNA对发育事件的调控作用第16-19页
       ·miRNA对发育时序的调控第16页
       ·miRNA对肌肉发育的调控第16-17页
       ·miRNA对神经系统发育的调控第17页
       ·miRNA对胚胎早期发育的调控第17-18页
       ·miRNA对生殖发育的调控第18页
       ·miRNA在其它组织器官发育过程中的作用第18-19页
     ·miRNA表达的检测技术第19-23页
       ·Northern blot第19页
       ·ISH第19-20页
       ·基因芯片第20-21页
       ·RT-PCR第21-22页
       ·测序法第22-23页
   ·研究目的和意义第23-24页
2 材料与方法第24-41页
   ·材料第24-28页
     ·样品第24页
       ·用于克隆的DNA样品第24页
       ·用于时间表达谱分析的鸡胚样品第24页
       ·用于空间表达模式分析的鸡胚样品第24页
     ·所用试剂和试剂盒第24-27页
       ·主要试剂和试剂盒第24-25页
       ·主要试剂的配制第25-27页
     ·主要仪器设备第27页
     ·生物信息学分析相关的软件和数据库第27-28页
   ·方法第28-41页
     ·鸡新miRNAs的结构分析第28-29页
       ·鸡新miRNAs的染色体物理定位第28页
       ·miR-363和363~*前体结构的克隆第28页
       ·鸡新miRNAs的前体结构预测第28页
       ·miR-363和miR-363~*、miR-551b前体的同源性分析第28-29页
     ·鸡胚DNA、RNA的提取及性别鉴定第29-30页
       ·DNA的提取及性别鉴定第29页
       ·鸡胚性腺总RNA的提取及质量检测第29-30页
     ·时间表达谱分析第30-36页
       ·RNA加尾以及引物延伸的RT-PCR方法扩增miRNAs第30-33页
         ·相关引物的设计第30-32页
         ·总RNA的纯化、加尾以及cDNA第一链的合成第32-33页
       ·茎环状引物的RT-PCR方法扩增miRNAs第33-34页
         ·相关引物的设计第33页
         ·cDNA第一链的合成第33-34页
       ·miRNAs的扩增、检测以及半定量分析第34-36页
     ·空间表达模式分析第36-41页
       ·探针的合成以及纯化第36-38页
       ·斑点杂交检测探针标记效率和量第38页
       ·胚胎干粉的制备以及Fab片段的预吸附第38-39页
       ·WISH程序第39-41页
3 结果与分析第41-58页
   ·鸡新MIRNAs的结构分析第41-45页
     ·鸡新miRNAs的染色体物理定位第41页
     ·miR-363和363~*前体结构的克隆第41-42页
     ·鸡新miRNAs的前体结构预测第42-43页
     ·miR-363(miR-363~*)和miR-551b前体的同源性分析第43-45页
   ·鸡胚性别鉴定以及RNA提取第45-46页
   ·时间表达谱分析第46-54页
     ·miR-363和363~*的表达及比较第46-48页
     ·雌性高表达的miRNAs第48-50页
     ·雄性高表达的miRNAs第50-53页
     ·其它miRNAs的表达第53-54页
   ·空间表达模式分析第54-58页
     ·斑点杂交结果第54-55页
     ·gga-miR-363的表达第55-56页
     ·gga-miR-1810的表达第56-58页
4 讨论第58-63页
   ·MIRNA的保守性第58页
   ·新MIRNA的确认第58-59页
   ·MIRNA的表达谱第59-60页
   ·MIRNAISH方法的改进第60页
   ·早期鸡胚性分化相关候选MIRNAs的功能分析第60-63页
     ·miR-363功能的预测第60-61页
     ·miR-1810功能的预测第61-62页
     ·miR-200b、miR-1599和miR-551b功能的预测第62-63页
5 小结第63-65页
   ·本研究所取得的结果第63页
   ·本研究的创新点和特色第63-64页
   ·下一步需要研究的问题第64-65页
参考文献第65-73页
致谢第73-74页
在读期间发表的论文第74页

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