| 摘要 | 第1-8页 |
| Abstract | 第8-10页 |
| 第一章 前言 | 第10-37页 |
| ·动物对二氧化碳的感知 | 第10-11页 |
| ·大气中的二氧化碳 | 第10-11页 |
| ·动物对二氧化碳的感知 | 第11页 |
| ·二氧化碳感知相关基因 | 第11-25页 |
| ·二氧化碳感知相关基因GC-D及其进化研究 | 第11-15页 |
| ·二氧化碳感知相关基因碳酸酐酶Ⅱ(CAⅡ) | 第15-22页 |
| ·二氧化碳感知相关基因磷酸二酯酶2A(PDE2A) | 第22-25页 |
| ·灵长类的感觉及其进化 | 第25-27页 |
| ·协同进化、共同进化和通路进化 | 第27-28页 |
| ·协同进化 | 第27页 |
| ·共同进化 | 第27页 |
| ·通路进化 | 第27-28页 |
| ·本研究涉及的生物信息学工具 | 第28-35页 |
| ·网上数据库 | 第28页 |
| ·生物信息学常用分析工具 | 第28-31页 |
| ·进化分析软件 | 第31-35页 |
| ·蛋白质三维结构模拟软件 | 第35页 |
| ·本研究的目的 | 第35-37页 |
| 第二章 碳酸酐酶Ⅱ的进化分析及生物信息学研究 | 第37-90页 |
| ·物种选择及序列获取 | 第37-48页 |
| ·序列获取 | 第37-40页 |
| ·测序实验 | 第40-48页 |
| ·构建系统发育树 | 第48-54页 |
| ·序列筛选 | 第48-53页 |
| ·构建系统发育树 | 第53-54页 |
| ·序列分析 | 第54-67页 |
| ·序列准备 | 第54-61页 |
| ·树结构比较 | 第61-64页 |
| ·Mantel检验 | 第64-66页 |
| ·相对进化速率 | 第66-67页 |
| ·适应性进化检验 | 第67-87页 |
| ·分枝模型(自由参数) | 第68页 |
| ·模型比较 | 第68-71页 |
| ·位点模型 | 第71页 |
| ·统计检验 | 第71-77页 |
| ·蛋白质三维结构模拟分析 | 第77-87页 |
| ·其他分析 | 第87页 |
| ·讨论 | 第87-90页 |
| 第三章 磷酸二酯酶2A的进化分析及生物信息学研究 | 第90-130页 |
| ·物种选择及序列获取 | 第90-92页 |
| ·构建系统发育树 | 第92-105页 |
| ·序列筛选 | 第92-102页 |
| ·构建系统发育树 | 第102-105页 |
| ·序列分析 | 第105-115页 |
| ·树结构比较 | 第105-108页 |
| ·Mantel检验 | 第108-113页 |
| ·相对进化速率 | 第113-115页 |
| ·适应性进化检验 | 第115-128页 |
| ·分枝模型 | 第115-116页 |
| ·位点模型 | 第116-117页 |
| ·分枝-位点模型 | 第117页 |
| ·各结构域进化分析 | 第117-119页 |
| ·蛋白质三维结构模拟分析 | 第119-128页 |
| ·讨论 | 第128-130页 |
| 第四章 讨论与展望 | 第130-134页 |
| ·通路进化 | 第130页 |
| ·感觉功能与生境 | 第130-131页 |
| ·生物信息学分析 | 第131-134页 |
| ·数据 | 第131-132页 |
| ·序列和结构 | 第132页 |
| ·从通路到网络 | 第132-134页 |
| 参考文献 | 第134-148页 |
| 后记 | 第148-149页 |
| 攻读博士学位期间发表论文 | 第149-150页 |
| 攻读博士学位期间出版译著及著作 | 第150-151页 |