| 摘要 | 第6-8页 |
| ABSTRACT | 第8-10页 |
| 缩略词 | 第11-13页 |
| 第一部分 文献综述 | 第13-30页 |
| 第一章 文献综述 | 第14-30页 |
| 1 数量性状 | 第14页 |
| 2 全基因组关联分析的研究进展 | 第14-24页 |
| 2.1 全基因组关联分析的概念 | 第14-15页 |
| 2.2 全基因组关联分析方法 | 第15-22页 |
| 2.2.1 关联分析的广义线性模型方法 | 第15-16页 |
| 2.2.2 全基因组关联分析的混合线性模型方法 | 第16-17页 |
| 2.2.3 全基因组关联分析的快速算法 | 第17-18页 |
| 2.2.4 多位点关联分析方法 | 第18-22页 |
| 2.3 影响全基因组关联分析的因素 | 第22-23页 |
| 2.4 全基因组关联分析方法存在的问题 | 第23-24页 |
| 3 关联分析软件包的研究进展 | 第24-27页 |
| 4 本研究的目的与研究内容 | 第27-30页 |
| 第二部分 研究报告 | 第30-66页 |
| 第二章 多位点全基因组关联分析ISIS EM-BLASSO方法软件包的原理与设计目标 | 第32-40页 |
| 1 引言 | 第32-33页 |
| 2 软件包算法的流程图 | 第33-34页 |
| 3 ISIS EM-BLASSO软件包所需硬件配置 | 第34页 |
| 4 软件包的设计目标 | 第34-40页 |
| 4.1 软件系统分析 | 第34页 |
| 4.2 设计流程 | 第34-35页 |
| 4.2.1 总体目标 | 第34-35页 |
| 4.2.2 计算流程 | 第35页 |
| 4.3 支持数据文件格式 | 第35页 |
| 4.4 功能设计 | 第35页 |
| 4.5 主界面设计 | 第35-40页 |
| 第三章 ISIS EM-BLASSO软件包的操作 | 第40-50页 |
| 1 安装软件包 | 第40-41页 |
| 2 数据文件格式 | 第41-44页 |
| 2.1 表型数据 | 第41页 |
| 2.2 基因型数据 | 第41-43页 |
| 2.3 群体结构 | 第43-44页 |
| 3 ISIS EM-BLASSO软件包的操作步骤 | 第44-50页 |
| 3.1 输入数据 | 第45-46页 |
| 3.2 运行程序 | 第46-48页 |
| 3.3 结果保存 | 第48页 |
| 3.4 作图 | 第48-50页 |
| 第四章 ISIS EM-BLASSO软件包的验证—以拟南芥实际数据分析为例 | 第50-62页 |
| 1 引言 | 第50页 |
| 2 材料与方法 | 第50-51页 |
| 2.1 数据来源 | 第50页 |
| 2.2 方法 | 第50-51页 |
| 3 结果分析 | 第51-52页 |
| 4 讨论 | 第52-62页 |
| 第五章 讨论 | 第62-64页 |
| 1 软件包内部算法的意义 | 第62页 |
| 2 软件包的优点与缺点 | 第62-64页 |
| 2.1 软件包的优点 | 第62-63页 |
| 2.2 软件包的缺点 | 第63-64页 |
| 第六章 全文结论与创新点 | 第64-66页 |
| 1 全文结论 | 第64页 |
| 2 创新点 | 第64-66页 |
| 参考文献 | 第66-78页 |
| 个人简介 | 第78-80页 |
| 致谢 | 第80-82页 |
| 硕士期间已发表和待发表的相关论文 | 第82页 |
