| 摘要 | 第3-4页 |
| Abstract | 第4页 |
| 第一章 绪论 | 第7-15页 |
| 1.1 研究背景及意义 | 第7-8页 |
| 1.2 国内外研究现状 | 第8-12页 |
| 1.2.1 Fasta格式下的DNA序列存储结构与压缩性能评价标准 | 第8-9页 |
| 1.2.2 DNA压缩的发展现状 | 第9-11页 |
| 1.2.3 Context模型算法的发展现状 | 第11-12页 |
| 1.3 论文的主要工作 | 第12-13页 |
| 1.4 论文主要结构安排 | 第13-15页 |
| 第二章 Context模型的理论基础 | 第15-23页 |
| 2.1 熵和条件熵 | 第15-18页 |
| 2.2 Context建模的理论依据 | 第18-19页 |
| 2.3 描述长度 | 第19-23页 |
| 2.3.1 描述长度 | 第19页 |
| 2.3.2 Context模型中描述长度的计算 | 第19-23页 |
| 第三章 基于Context加权的基因序列压缩算法 | 第23-37页 |
| 3.1 算法基本流程 | 第23-26页 |
| 3.1.1 算法基本步骤 | 第23-24页 |
| 3.1.2 流程图 | 第24-26页 |
| 3.2 Hash表的构造及概率复制模型 | 第26-31页 |
| 3.2.1 Hash表的冲突解决方法 | 第26-28页 |
| 3.2.2 参考序列Hash表的构造 | 第28-29页 |
| 3.2.3 概率复制模型的具体工作过程 | 第29-31页 |
| 3.3 Context加权 | 第31-37页 |
| 3.3.1 Context模型 | 第31-32页 |
| 3.3.2 Context加权编码 | 第32-33页 |
| 3.3.3 权值选择 | 第33-37页 |
| 第四章 实验设计及分析 | 第37-51页 |
| 4.1 实验一 GReEn压缩编码与无条件自适应压缩编码 | 第37-40页 |
| 4.2 实验二 Context加权模型阶数和条件的选择 | 第40-46页 |
| 4.2.1 模型阶数的选择 | 第40-44页 |
| 4.2.2 模型条件组合的选择 | 第44-46页 |
| 4.3 实验三Context加权模型个数的选择 | 第46-47页 |
| 4.4 实验四Context加权模型的权值优化 | 第47-51页 |
| 第五章 总结与展望 | 第51-53页 |
| 5.1 研究内容总结 | 第51-52页 |
| 5.2 实验的不足 | 第52页 |
| 5.3 今后研究工作 | 第52-53页 |
| 参考文献 | 第53-55页 |
| 攻读硕士学位期间的科研成果 | 第55-56页 |
| 致谢 | 第56页 |
