复杂疾病的上位性检测方法研究
| 摘要 | 第5-6页 |
| Abstract | 第6页 |
| 第1章 绪论 | 第11-16页 |
| 1.1 研究背景与意义 | 第11-12页 |
| 1.2 国内外研究现状 | 第12-14页 |
| 1.3 主要研究内容 | 第14-15页 |
| 1.4 论文结构安排 | 第15-16页 |
| 第2章 上位性检测方法介绍 | 第16-28页 |
| 2.1 引言 | 第16页 |
| 2.2 基本概念 | 第16-18页 |
| 2.2.1 单核苷酸多态性 | 第16-17页 |
| 2.2.2 上位性 | 第17页 |
| 2.2.3 全基因组关联研究 | 第17-18页 |
| 2.3 上位性检测方法 | 第18-27页 |
| 2.3.1 统计类方法 | 第19-21页 |
| 2.3.2 机器学习类方法 | 第21-23页 |
| 2.3.3 信息熵类方法 | 第23-25页 |
| 2.3.4 两阶段类方法 | 第25-27页 |
| 2.4 小结 | 第27-28页 |
| 第3章 基于信息熵的上位性检测方法 | 第28-44页 |
| 3.1 引言 | 第28页 |
| 3.2 信息熵的相关概念 | 第28-29页 |
| 3.2.1 信息熵 | 第28-29页 |
| 3.2.2 条件熵 | 第29页 |
| 3.2.3 信息增益和相对信息增益 | 第29页 |
| 3.3 基于信息熵的上位性检测方法 | 第29-31页 |
| 3.3.1 构建列联表 | 第29-30页 |
| 3.3.2 常用的信息增益(U_o) | 第30页 |
| 3.3.3 改进的相对信息增益(U_(new)) | 第30-31页 |
| 3.4 数据集 | 第31-36页 |
| 3.4.1 仿真数据集 | 第31-34页 |
| 3.4.2 AMD数据集 | 第34-36页 |
| 3.5 实验与分析 | 第36-42页 |
| 3.5.1 实验数据集 | 第36-38页 |
| 3.5.2 实验结果与分析 | 第38-42页 |
| 3.6 小结 | 第42-44页 |
| 第4章 基于两阶段法的上位性检测方法 | 第44-53页 |
| 4.1 引言 | 第44页 |
| 4.2 基于两阶段的上位性检测方法 | 第44-47页 |
| 4.2.1 G~2检验 | 第45页 |
| 4.2.2 APD函数 | 第45-46页 |
| 4.2.3 融合方法 | 第46页 |
| 4.2.4 TwoFC | 第46-47页 |
| 4.3 实验及分析 | 第47-52页 |
| 4.3.1 实验数据集 | 第47-48页 |
| 4.3.2 实验结果与分析 | 第48-52页 |
| 4.4 小结 | 第52-53页 |
| 结论 | 第53-55页 |
| 参考文献 | 第55-61页 |
| 致谢 | 第61-62页 |
| 附录A 攻读学位期间所发表的学术论文及所参加项目 | 第62页 |
