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基于聚类方法的脑区基因共表达模式研究与分析

摘要第5-6页
Abstract第6页
第1章 绪论第11-15页
    1.1 研究背景及意义第11-12页
    1.2 国内外研究现状第12-13页
    1.3 研究内容第13页
    1.4 本文组织安排第13-14页
    1.5 小结第14-15页
第2章 相关研究知识第15-33页
    2.1 数据挖掘第15-18页
        2.1.1 数据挖掘的概念第15-16页
        2.1.2 数据挖掘功能第16-18页
    2.2 基因表达数据第18-22页
        2.2.1 基因表达数据的获取第19-21页
        2.2.2 基因表达数据预处理第21-22页
    2.3 特征选取方法第22-28页
        2.3.1 特征选取的概况第22-25页
        2.3.2 过滤器模式(Filter)第25-27页
        2.3.3 封装器模式(Wrapper)第27-28页
    2.4 聚类方法第28-30页
        2.4.1 聚类应用的四个基本方向第28页
        2.4.2 聚类的过程第28-29页
        2.4.3 聚类算法的类别第29-30页
    2.5 双聚类算法第30-32页
        2.5.1 引入双聚类的理由第30-31页
        2.5.2 双聚类的数学模型第31页
        2.5.3 已有的常见双聚类算法第31-32页
    2.6 小结第32-33页
第3章 基于2D层次聚类的脑区共表达聚类模式研究第33-47页
    3.1 引言第33页
    3.2 基于脑区共表达聚类模式的精神分裂症机理研究第33-37页
        3.2.1 特征基因的选取第33页
        3.2.2 共表达2D层次聚类第33-36页
        3.2.3 共表达2D层次聚类的评估第36-37页
        3.2.4 GO富集分析第37页
    3.3 数据集第37-38页
        3.3.1 数据集来源第37-38页
        3.3.2 数据的预处理第38页
    3.4 实验结果和分析第38-45页
        3.4.1 基底区共表达模式和分析第38-39页
        3.4.2 海马区共表达模式和分析第39-40页
        3.4.3 枕叶共表达模式与分析第40-41页
        3.4.4 颞叶的共表达模式与分析第41-43页
        3.4.5 顶叶共表达模式和分析第43-44页
        3.4.6 额叶共表达模式和分析第44-45页
    3.5 讨论第45-46页
    3.6 小结第46-47页
第4章 基于CHPBC双聚类方法的脑区共表达聚类模式研究第47-59页
    4.1 引言第47页
    4.2 基于CHPBC双聚类的脑区共表达模式方法第47-53页
        4.2.1 提出双聚类算法的原因第47-48页
        4.2.2 双聚类基础模型及已有算法的不足分析第48-51页
        4.2.3 CHPBC聚类算法第51-53页
    4.3 数据集第53-54页
    4.4 实验结果和分析第54-58页
        4.4.1 CHPBC双聚类信息丰度比较第54-56页
        4.4.2 CHPBC生物意义敏感性比较第56-58页
    4.5 小结第58-59页
结论第59-61页
参考文献第61-65页
致谢第65-66页
附录A 攻读学位期间所发表的学术论文及所参加项目第66页

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