| 摘要 | 第6-8页 |
| Abstract | 第8-10页 |
| Abbreviation | 第11-12页 |
| 1. Introduction | 第12-26页 |
| 1.1 History | 第15-16页 |
| 1.2 Transmission | 第16-17页 |
| 1.3 Pathogenesis | 第17页 |
| 1.4 TB in other animals | 第17-18页 |
| 1.5 Epidemiology | 第18-19页 |
| 1.6 Geographical distribution of tuberculosis | 第19-20页 |
| 1.7 Drug resistance tuberculosis | 第20-21页 |
| 1.8 TB diagnosis | 第21-23页 |
| 1.8.1 Mantoux tuberculin skin test | 第22页 |
| 1.8.2 Radiographic examination through x-rays | 第22页 |
| 1.8.3 IGRA blood test | 第22页 |
| 1.8.4 XPert MTB/RIF assay | 第22-23页 |
| 1.8.5 Line probe assay (LPA) | 第23页 |
| 1.9 TB prevention and control | 第23-24页 |
| 1.10 Mtb adaptation | 第24-25页 |
| 1.11 Objectives | 第25-26页 |
| 2. Materials and Methods | 第26-36页 |
| 2.1 MIC detection | 第26页 |
| 2.2 Bacterial culture and drug treatment | 第26-27页 |
| 2.3 RNA extraction | 第27页 |
| 2.4 RNA library construction | 第27-30页 |
| 2.4.1 m RNA purification and fragmentation | 第28页 |
| 2.4.2 Synthesis of double strand c DNA | 第28-29页 |
| 2.4.3 Adding d A-tails | 第29-30页 |
| 2.4.4 Adapter ligation | 第30页 |
| 2.4.5 Library amplification | 第30页 |
| 2.5 RNA-seq analysis | 第30-31页 |
| 2.6 Functional analysis | 第31页 |
| 2.7 Construction of vector | 第31-32页 |
| 2.8 Electroporation | 第32页 |
| 2.9 Confirmation for insertion of plasmid in MTB genome through PCR | 第32页 |
| 2.10 Culturing MTB with overexpressed genes | 第32页 |
| 2.11 Optical density (OD) detection | 第32-33页 |
| 2.12 Antibiotic screening | 第33-34页 |
| 2.13 Primers used in the study | 第34-36页 |
| 3. Results and Discussion | 第36-80页 |
| 3.1 Identification of genes response during sub-lethal kanamycin exposure | 第36-64页 |
| 3.1.1 High responsive up-regulated genes upon sub-lethal kanamycin exposure | 第48-52页 |
| 3.1.2 High responsive down-regulated genes upon sub-lethal kanamycin exposure | 第52-55页 |
| 3.1.3 Mutation analysis | 第55-57页 |
| 3.1.4 Adaptive genes expression during sub-lethal kanamycin exposure | 第57-59页 |
| 3.1.5 Kanamycin stressed adaptive gene’s interacting cluster | 第59-64页 |
| 3.2 Identification of candidate genes for putative regulator of drug resistance | 第64-80页 |
| 3.2.1 Candidate gene cloning in Vector p MV261 | 第67-69页 |
| 3.2.2 Candidate genes transformation in MTB Genome | 第69页 |
| 3.2.3 Optical density (OD) detection of Mtb strains with overexpressed genes | 第69-70页 |
| 3.2.4 Antibiotic screening to identify putative regulator of drug resistant genes | 第70-75页 |
| 3.2.5 Interacting cluster of putative key regulators of drug resistant genes | 第75-80页 |
| 4. Conclusion | 第80-81页 |
| References | 第81-97页 |
| ACKNOWLEDGEMENTS | 第97-98页 |
| Appendix | 第98-100页 |
| 附件 | 第100-101页 |
