中文摘要 | 第4-6页 |
Abstract | 第6-7页 |
第一章 文献综述 | 第11-28页 |
1.文献综述 | 第11-26页 |
1.1 家蚕的杂种优势研究现状 | 第11-12页 |
1.2 肠道微生物组学技术及其应用 | 第12-20页 |
1.2.1 肠道微生物的研究方法 | 第12-14页 |
1.2.2 肠道菌群研究进展 | 第14-20页 |
1.2.2.1 肠道微生物研究的新理论与新技术 | 第14-15页 |
1.2.2.2 肠道微生物与代谢类疾病 | 第15-16页 |
1.2.2.3 肠道微生物与精神系统疾病 | 第16-18页 |
1.2.2.4 肠道微生物与消化系统疾病 | 第18-19页 |
1.2.2.5 肠道微生物与其他疾病 | 第19-20页 |
1.2.3 家蚕肠道微生物研究进展 | 第20页 |
1.3 代谢组学技术及其应用 | 第20-26页 |
1.3.1 代谢组学样本来源 | 第21-22页 |
1.3.2 代谢组学研究方法 | 第22-24页 |
1.3.3 代谢组学的研究进展 | 第24-26页 |
1.3.3.1 代谢组学与疾病研究 | 第24-25页 |
1.3.3.2 代谢组学与药物研发 | 第25页 |
1.3.3.3 代谢组学在植物和微生物领域应用 | 第25-26页 |
2.论文研究思路 | 第26-28页 |
2.1 研究目的及意义 | 第26-27页 |
2.2 研究技术路线 | 第27-28页 |
第二章 杂交种F_1及其亲本的肠道微生物组成及功能差异 | 第28-51页 |
1 引言 | 第28-29页 |
2 材料和方法 | 第29-31页 |
2.1 实验动物 | 第29页 |
2.2 家蚕肠道样本 | 第29页 |
2.3 Illumina Miseq测序 | 第29-30页 |
2.4 数据处理主要步骤 | 第30-31页 |
2.4.1 肠道细菌基因组DNA抽提和PCR扩增 | 第30页 |
2.4.2 荧光定量 | 第30-31页 |
2.4.3 测序序列分析 | 第31页 |
3 结果与分析 | 第31-50页 |
3.1 杂交种F_1及其亲本的总体肠道微生物分析 | 第32-40页 |
3.1.1 总体样本数据可靠性评估 | 第32-37页 |
3.1.2 物种组成分析 | 第37-38页 |
3.1.3 样本与物种关系 | 第38-40页 |
3.2 杂交种F_1及其亲本的肠道微生物差异分析 | 第40-48页 |
3.2.1 Alpha多样性分析 | 第40-43页 |
3.2.2 物种Venn图分析 | 第43-45页 |
3.2.3 群落柱形图 | 第45-46页 |
3.2.4 群落Heatmap图 | 第46-48页 |
3.3 杂交种F_1雌雄性别间肠道微生物差异分析 | 第48-50页 |
3.3.1 Alpha多样性分析 | 第48-49页 |
3.3.2 物种Venn图分析 | 第49-50页 |
4 讨论 | 第50-51页 |
第三章 杂交种F_1及其亲本的血淋巴代谢组学分析 | 第51-86页 |
1 引言 | 第51页 |
2 材料与方法 | 第51-53页 |
2.1 实验动物 | 第51页 |
2.2 血淋巴样本 | 第51-52页 |
2.3 GC/LC-MS测定 | 第52-53页 |
2.4 数据处理步骤 | 第53页 |
3 结果与分析 | 第53-85页 |
3.1 杂交种F_1及其亲本的总体代谢物分析 | 第55-63页 |
3.1.1 总体样本数据预处理和可靠性分析 | 第55-63页 |
3.1.2 代谢物分类 | 第63页 |
3.2 杂交种F_1及其亲本的代谢组成差异分析 | 第63-80页 |
3.2.1 差异代谢物筛选 | 第63-66页 |
3.2.2 差异代谢物层次聚类分析(热图) | 第66-71页 |
3.2.3 差异代谢物统计分析 | 第71-74页 |
3.2.4 差异代谢物关联网络分析 | 第74-78页 |
3.2.5 差异代谢物通路分析 | 第78-80页 |
3.3 杂交种F_1雌雄性别间代谢组成差异分析 | 第80-85页 |
3.3.1 杂交种F_1雌雄的样本数据的可靠性分析 | 第80-82页 |
3.3.2 差异代谢物层次聚类热图 | 第82-83页 |
3.3.3 差异代谢物统计分析 | 第83-84页 |
3.3.4 代谢通路比较图 | 第84-85页 |
3.3.5 差异代谢物关联网络图 | 第85页 |
4 讨论 | 第85-86页 |
第四章 结论与展望 | 第86-88页 |
1 结论 | 第86页 |
2 论文创新点 | 第86-87页 |
3 后续研究展望与建议 | 第87-88页 |
参考文献 | 第88-99页 |
附录 | 第99-113页 |
研究生期间参与项目与成果 | 第113-114页 |
攻读学位期间公开发表论文 | 第113页 |
攻读学位期间参与项目 | 第113-114页 |
致谢 | 第114-116页 |