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安吉白茶高氨基酸性状相关基因的全长cDNA克隆及功能的初步研究

摘要第1-6页
Abstract第6-15页
第一章 绪论第15-30页
 1 概述第15-16页
 2 安吉白茶阶段性返白过程中生理生化本质的研究进展第16-17页
 3 茶氨酸的制备方法研究进展第17-20页
   ·生物合成方法制备茶氨酸第17-19页
     ·基因工程菌合成茶氨酸第17页
     ·微生物酶催化合成茶氨酸第17-18页
     ·茶树愈伤组织悬浮培养合成茶氨酸第18页
     ·液态发酵合成茶氨酸第18-19页
   ·化学合成方法制备茶氨酸第19页
     ·L-谷氨酸与乙胺合成茶氨酸第19页
     ·N-取代谷氨酸酐法合成茶氨酸第19页
     ·L-谷氨酸γ-酯法合成茶氨酸第19页
   ·直接分离提取方法制备茶氨酸第19-20页
 4 基因差异表达的研究方法及进展第20-23页
   ·示差筛选和扣除杂交第20页
   ·差异显示PCR技术(DDRT-PCR)第20-21页
   ·差异消减展示技术(DSD)第21页
   ·cDNA代表性示差分析(cDNA-RDA)第21页
   ·抑制消减杂交技术(SSH)第21页
   ·cDNA-AFLP技术第21-23页
   ·cDNA微阵列(cDNA Microarray)第23页
 5 茶树功能基因克隆研究进展第23-25页
   ·茶氨酸合成相关基因的克隆第23页
   ·茶树多酚类物质代谢关键酶基因的克隆第23-24页
   ·茶树咖啡碱合成相关基因的克隆第24页
   ·茶树芳香物质代谢相关基因的克隆第24页
   ·茶树抗逆性相关基因的克隆第24-25页
   ·其它基因的分离第25页
 6 RACE(Rapid Amplification of cDNA Ends)技术第25-28页
   ·RACE原理第25-26页
   ·RACE技术的优点与局限性第26页
   ·RACE改进技术第26-28页
     ·锚连接RACE第26页
     ·RNA连接酶介导的RACE(RLM-RACE)第26-27页
     ·寡聚帽(Oligo-capping)法第27页
     ·环化的第一链cDNA介导的RACE(cRACE)第27页
     ·SMART-RACE技术第27-28页
 7 研究的目的与意义第28-30页
第二章 安吉白茶氨基酸组分及含量分析第30-35页
 1 材料与方法第30-31页
   ·试验材料第30页
   ·主要仪器与试剂第30页
     ·主要仪器第30页
     ·主要试剂第30页
   ·色谱条件第30页
   ·对照品储存液制备第30页
   ·样品前处理第30-31页
   ·衍生方法第31页
 2 结果与分析第31-33页
   ·安吉白茶全白期与全绿期叶氨基酸组分及含量分析第31-33页
   ·安吉白茶氨基酸含量与材料嫩度的关系第33页
   ·茶氨酸含量与氨基酸总量的关系第33页
 3 讨论第33-34页
 4 小结第34-35页
第三章 安吉白茶全白期与全绿期叶抑制消减杂交cDNA文库的构建及分析第35-42页
 1 材料与方法第35-37页
   ·试验材料第35页
   ·主要仪器与试剂第35-36页
   ·引物与接头第36页
   ·试验方法第36-37页
     ·安吉白茶全白期叶及全绿期叶总RNA提取及mRNA的分离纯化第36页
     ·抑制性消减杂交试验第36页
     ·消减杂交的二次PCR产物的纯化、转化与鉴定第36-37页
 2 结果与分析第37-41页
   ·安吉白茶总RNA检测结果第37页
   ·抑制消减杂交cDNA文库的构建第37页
   ·菌落PCR鉴定正反向消减文库第37-38页
   ·测序结果的比对与分析第38-41页
 3 讨论第41页
 4 小结第41-42页
第四章 茶氨酸合成酶基因全长cDNA克隆及序列分析第42-55页
 1 材料与方法第42-48页
   ·试验材料第42页
   ·主要仪器与试剂第42-43页
   ·引物第43页
   ·试验方法第43-48页
     ·总RNA提取第43页
     ·茶氨酸合成酶(TS)目的基因片段PCR扩增第43-44页
     ·目的条带的切胶回收第44页
     ·目的条带的克隆、测序第44-46页
     ·5’RACE/3’RACE合成第46-48页
     ·5’RACE/3’RACE反应产物的克隆及测序第48页
 2 结果与分析第48-53页
   ·茶氨酸合成酶(TS)目的基因片段的PCR扩增第48页
   ·5’RACE和3’RACE扩增产物的电泳检测第48页
   ·TS基因5’RACE和3’RACE扩增产物测序与全长序列拼接第48-49页
   ·TS蛋白质的特征分析第49-53页
     ·TS基因的ORF及其氨基酸序列预测第49-50页
     ·TS氨基酸组成及理化性质分析第50页
     ·TS蛋白亲水/疏水性分析第50-51页
     ·TS蛋白信号肽预测第51页
     ·TS蛋白卷曲螺旋结构预测与分析第51页
     ·TS蛋白的跨膜结构预测与分析第51页
     ·TS蛋白磷酸化位点预测与分析第51-53页
     ·TS蛋白亚细胞定位预测与分析第53页
 3 讨论第53-54页
 4 小结第54-55页
第五章 茶氨酸合成酶基因的原核表达研究第55-65页
 1 材料与方法第55-60页
   ·试验材料第55页
   ·主要仪器与试剂第55页
   ·引物第55页
   ·试验方法第55-60页
     ·总RNA提取第55-56页
     ·茶氨酸合成酶(TS)基因的克隆及测序第56页
     ·中间质粒pMD 19-T-TS与pET 32α(+)载体的双酶切第56-57页
     ·重组质粒pET-32α(+)-TS的构建第57页
     ·重组蛋白的诱导表达第57-58页
     ·SDS-PAGE检测重组蛋白第58-60页
     ·体外酶实验第60页
     ·反应产物检测的色谱条件第60页
 2 结果与分析第60-64页
   ·原核表达载体的构建第60-62页
     ·TS基因PCR产物鉴定与纯化第60-61页
     ·中间质粒pMD 19-T-TS与pET 32α(+)载体的双酶切检测第61页
     ·重组质粒pET-32α(+)-TS的双酶切检测第61-62页
   ·SDS-PAGE检测重组蛋白第62-63页
   ·体外酶试验结果第63-64页
 3 讨论第64页
   ·目的基因的酶切效率分析第64页
   ·重组蛋白诱导表达易形成包涵体第64页
 4 小结第64-65页
第六章 CDC48基因全长cDNA克隆及序列分析第65-76页
 1 材料与方法第65页
   ·试验材料第65页
   ·主要仪器与试剂第65页
   ·引物第65页
   ·试验方法第65页
 2 结果与分析第65-74页
   ·CDC48基因全长cDNA克隆第65-67页
     ·3’RACE扩增第65-66页
     ·5’RACE扩增第66页
     ·CDC48基因cDNA全长序列拼接第66-67页
   ·CDC48蛋白质的特征分析第67-74页
     ·CDC48的ORF及其氨基酸序列预测第67-69页
     ·氨基酸序列的同源性分析第69页
     ·CDC48氨基酸组成及理化性质分析第69页
     ·CDC48蛋白亲水/疏水性分析第69-71页
     ·CDC48蛋白信号肽预测第71-72页
     ·CDC48蛋白卷曲螺旋结构的预测与分析第72页
     ·CDC48蛋白的跨膜结构预测与分析第72-73页
     ·CDC48蛋白磷酸化位点的预测与分析第73-74页
     ·CDC48细胞定位预测与分析第74页
 3 小结第74-76页
第七章 实时荧光定量PCR分析TS基因和CDC48基因的相对表达量第76-81页
 1 材料与方法第76-78页
   ·材料第76页
   ·引物第76页
   ·主要仪器与试剂第76页
   ·试验方法与步骤第76-78页
     ·茶叶中总RNA的提取与检测第76页
     ·cDNA第一链的合成第76-77页
     ·标准曲线的制作及扩增效率分析第77页
     ·荧光定量PCR反应体系第77-78页
     ·数据统计第78页
 2 结果与分析第78-79页
   ·标准曲线的制作第78页
   ·扩增效率分析第78页
   ·实时荧光定量PCR结果第78-79页
 3 讨论与小结第79-81页
第八章 全文总结第81-83页
 1 主要研究结果第81-82页
 2 研究展望第82-83页
参考文献第83-94页
附录第94-99页
致谢第99-100页
作者简介第100-101页

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