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蛋白质功能预测的层次化分类方法研究

提要第1-7页
第1章 绪论第7-13页
   ·论文研究背景第7-11页
     ·后基因组时代的生物信息学第7-8页
     ·生物信息学国内外研究现状第8-9页
     ·生物信息学研究的热点问题第9-11页
   ·本文的主要工作第11页
   ·本文的组织结构第11-13页
第2章 蛋白质的功能预测概述第13-18页
   ·蛋白质的结构和功能第13-15页
     ·蛋白质的分子组成第13页
     ·蛋白质的结构层次第13-15页
     ·蛋白质的功能第15页
     ·蛋白质结构与功能的关系第15页
   ·G蛋白偶联受体的结构与功能特征第15-18页
第3章 层次分类问题概述第18-26页
   ·类的不同层次结构第18-20页
   ·基于预测深度不同对于层次分类问题的分析第20-21页
   ·对于预测性能的不同评价标准第21-22页
     ·统一的错分类成本第21页
     ·基于距离的错分类成本第21-22页
   ·层次错分类成本矩阵第22-24页
   ·有的相关预测方法第24-26页
第4章 利用免疫粒子群算法提高层次分类性能第26-37页
   ·传统层次分类方法的缺陷与改进方法第26-29页
     ·传统层次分类方法的缺陷以及Secker对其的改进第26-27页
     ·Secker提出的方法的缺陷及本文想对其进行的改进第27-29页
   ·传统的应用于分类规则发现的粒子群优化算法(PSO)第29-32页
   ·免疫粒子群优化算法第32-37页
     ·免疫系统简介第32-33页
     ·用免疫粒子群优化算法选择分类器第33-37页
第5章 模拟实验与结果分析第37-48页
   ·实验准备第37-43页
     ·待选分类器的选择第37-39页
     ·数据格式第39-42页
     ·实验参数的经验设置第42-43页
   ·实验数据的处理第43-46页
   ·本实验采取的验证方法第46-47页
   ·实验结果及分析第47-48页
第6章 总结与展望第48-50页
   ·本文完成的主要工作及不足第48-49页
   ·今后的研究方向第49-50页
参考文献第50-54页
致谢第54-55页
摘要第55-57页
ABSTRACT第57-59页

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