摘要 | 第6-8页 |
Abstract | 第8-9页 |
前言 | 第12-20页 |
1 miRNA概述 | 第13-17页 |
1.1 miRNA的发现 | 第14页 |
1.2 miRNA的生物合成 | 第14-15页 |
1.3 miRNA的特点 | 第15页 |
1.4 miRNA的生物学功能 | 第15-16页 |
1.5 miRNA的作用机制 | 第16-17页 |
2 外胞体概述 | 第17-19页 |
2.1 外胞体的发现 | 第17页 |
2.2 外胞体的生物合成 | 第17-18页 |
2.3 外胞体的功能 | 第18页 |
2.4 外胞体的分离与鉴定 | 第18-19页 |
3 研究的目的与意义 | 第19-20页 |
材料与方法 | 第20-28页 |
1 材料 | 第20-21页 |
1.1 试验动物 | 第20页 |
1.2 主要药品 | 第20页 |
1.3 主要仪器设备 | 第20-21页 |
1.4 主要数据库及生物软件 | 第21页 |
2 方法 | 第21-28页 |
2.1 延边黄牛和韩延牛血液Exosome的提取 | 第22-23页 |
2.1.1 延边黄牛和韩延牛血清的提取 | 第22页 |
2.1.2 延边黄牛和韩延牛血清Exosome的提取 | 第22页 |
2.1.3 延边黄牛和韩延牛Exosome RNA的提取 | 第22-23页 |
2.2 RNA质量检测 | 第23页 |
2.3 miRNA的高通量测序 | 第23-25页 |
2.3.1 小RNA测序文库的构建 | 第23-25页 |
2.3.2 小RNA的序列测序和测序原始数据的质控 | 第25页 |
2.4 小RNA的测序reads注释 | 第25页 |
2.4.1 小RNA注释 | 第25页 |
2.4.2 未知miRNA的预测 | 第25页 |
2.5 miRNA差异表达水平分析 | 第25-26页 |
2.6 miRNA的靶基因预测 | 第26页 |
2.7 miRNA的层次聚类分析 | 第26页 |
2.8 miRNA靶基因的GO与KEGG分析 | 第26-28页 |
2.8.1 miRNA靶基因的GO分析 | 第26页 |
2.8.2 miRNA靶基因的KEGG分析 | 第26-28页 |
结果 | 第28-42页 |
1 总RNA的质量检测 | 第28页 |
2 miRNA测序结果 | 第28-42页 |
2.1 测序数据质量 | 第28-29页 |
2.2 小RNA长度分布 | 第29-30页 |
2.3 小RNA分类注释与miRNA的鉴定 | 第30-31页 |
2.4 小RNA的预测 | 第31-32页 |
2.5 miRNA表达定量 | 第32-34页 |
2.6 miRNA靶基因预测 | 第34-35页 |
2.7 差异表达miRNA的筛选 | 第35-37页 |
2.8 差异表达小RNA层次聚类 | 第37-38页 |
2.9 差异表达miRNA的靶基因预测 | 第38页 |
2.10 差异表达miRNA的靶基因GO显著性富集分析 | 第38-39页 |
2.11 差异miRNA的靶基因Pathway显著性富集分析 | 第39-42页 |
讨论 | 第42-46页 |
1 RNA-seq测序技术 | 第42-43页 |
2 miRNA测序质量与RNA-seq整体评估 | 第43-44页 |
3 靶基因预测分析 | 第44页 |
4 差异表达miRNA靶基因的GO富集和KEGG通路分析 | 第44-46页 |
结论 | 第46-47页 |
参考文献 | 第47-55页 |
致谢 | 第55-56页 |
作者简介 | 第56页 |