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延边黄牛和韩延牛血液外胞体中miRNA的差异表达分析

摘要第6-8页
Abstract第8-9页
前言第12-20页
    1 miRNA概述第13-17页
        1.1 miRNA的发现第14页
        1.2 miRNA的生物合成第14-15页
        1.3 miRNA的特点第15页
        1.4 miRNA的生物学功能第15-16页
        1.5 miRNA的作用机制第16-17页
    2 外胞体概述第17-19页
        2.1 外胞体的发现第17页
        2.2 外胞体的生物合成第17-18页
        2.3 外胞体的功能第18页
        2.4 外胞体的分离与鉴定第18-19页
    3 研究的目的与意义第19-20页
材料与方法第20-28页
    1 材料第20-21页
        1.1 试验动物第20页
        1.2 主要药品第20页
        1.3 主要仪器设备第20-21页
        1.4 主要数据库及生物软件第21页
    2 方法第21-28页
        2.1 延边黄牛和韩延牛血液Exosome的提取第22-23页
            2.1.1 延边黄牛和韩延牛血清的提取第22页
            2.1.2 延边黄牛和韩延牛血清Exosome的提取第22页
            2.1.3 延边黄牛和韩延牛Exosome RNA的提取第22-23页
        2.2 RNA质量检测第23页
        2.3 miRNA的高通量测序第23-25页
            2.3.1 小RNA测序文库的构建第23-25页
            2.3.2 小RNA的序列测序和测序原始数据的质控第25页
        2.4 小RNA的测序reads注释第25页
            2.4.1 小RNA注释第25页
            2.4.2 未知miRNA的预测第25页
        2.5 miRNA差异表达水平分析第25-26页
        2.6 miRNA的靶基因预测第26页
        2.7 miRNA的层次聚类分析第26页
        2.8 miRNA靶基因的GO与KEGG分析第26-28页
            2.8.1 miRNA靶基因的GO分析第26页
            2.8.2 miRNA靶基因的KEGG分析第26-28页
结果第28-42页
    1 总RNA的质量检测第28页
    2 miRNA测序结果第28-42页
        2.1 测序数据质量第28-29页
        2.2 小RNA长度分布第29-30页
        2.3 小RNA分类注释与miRNA的鉴定第30-31页
        2.4 小RNA的预测第31-32页
        2.5 miRNA表达定量第32-34页
        2.6 miRNA靶基因预测第34-35页
        2.7 差异表达miRNA的筛选第35-37页
        2.8 差异表达小RNA层次聚类第37-38页
        2.9 差异表达miRNA的靶基因预测第38页
        2.10 差异表达miRNA的靶基因GO显著性富集分析第38-39页
        2.11 差异miRNA的靶基因Pathway显著性富集分析第39-42页
讨论第42-46页
    1 RNA-seq测序技术第42-43页
    2 miRNA测序质量与RNA-seq整体评估第43-44页
    3 靶基因预测分析第44页
    4 差异表达miRNA靶基因的GO富集和KEGG通路分析第44-46页
结论第46-47页
参考文献第47-55页
致谢第55-56页
作者简介第56页

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