| 摘要 | 第4-6页 |
| ABSTRACT | 第6-7页 |
| 1 绪论 | 第11-26页 |
| 1.1 华中五味子的研究现状 | 第11-16页 |
| 1.1.1 华中五味子生物学研究 | 第11-13页 |
| 1.1.2 华中五味子药理作用 | 第13-14页 |
| 1.1.3 华中五味子化学成分 | 第14-15页 |
| 1.1.4 华中五味子分子生物学研究进展 | 第15-16页 |
| 1.2 高通量测序技术 | 第16-19页 |
| 1.2.1 高通量测序技术特点 | 第16-17页 |
| 1.2.2 高通量测序技术应用 | 第17-19页 |
| 1.3 木脂素生物合成途径中的相关酶研究进展 | 第19-24页 |
| 1.3.1 苯丙氨酸解氨酶 | 第21页 |
| 1.3.2 肉桂酸4-羟化酶 | 第21页 |
| 1.3.3 4-香豆酸：辅酶A连接酶 | 第21-22页 |
| 1.3.4 香豆酸-3-羟基化酶 | 第22页 |
| 1.3.5 咖啡酸氧甲基转移酶和咖啡酰辅酶A-O-甲基转移酶 | 第22页 |
| 1.3.6 肉桂酰辅酶A还原酶 | 第22-23页 |
| 1.3.7 肉桂醇脱氢酶 | 第23页 |
| 1.3.8 蛋白氧化酶 | 第23页 |
| 1.3.9 松脂醇/落叶松脂醇还原酶 | 第23-24页 |
| 1.4 研究背景、目的与意义和技术路线 | 第24-26页 |
| 1.4.1 研究背景 | 第24-25页 |
| 1.4.2 研究目的与意义 | 第25-26页 |
| 1.4.3 技术路线 | 第26页 |
| 2 材料与方法 | 第26-37页 |
| 2.1 试验材料 | 第26页 |
| 2.2 试验试剂 | 第26-27页 |
| 2.3 试验仪器 | 第27页 |
| 2.4 试验方法 | 第27-37页 |
| 2.4.1 RNA提取 | 第27-28页 |
| 2.4.2 mRNA分离和纯化 | 第28-29页 |
| 2.4.3 mRNA DNase Ⅰ消化和纯化 | 第29页 |
| 2.4.4 cDNA文库构建 | 第29-33页 |
| 2.4.5 转录组测序 | 第33页 |
| 2.4.6 转录组数据的组装 | 第33-34页 |
| 2.4.6.1 数据过滤 | 第33页 |
| 2.4.6.2 数据组装 | 第33-34页 |
| 2.4.7 转录组数据的分析 | 第34-36页 |
| 2.4.7.1 Unigene功能注释 | 第34-35页 |
| 2.4.7.2 GO分类 | 第35页 |
| 2.4.7.3 KEGG代谢通路分析 | 第35页 |
| 2.4.7.4 预测编码蛋白框(CDS) | 第35-36页 |
| 2.4.8 简单重复序列(SSR)搜索 | 第36-37页 |
| 3 结果与分析 | 第37-65页 |
| 3.1 RNA提取及质量检测 | 第37页 |
| 3.2 转录组测序与组装 | 第37-43页 |
| 3.3 转录组序列的功能注释 | 第43-47页 |
| 3.4 COG分类 | 第47-49页 |
| 3.5 GO分类 | 第49-50页 |
| 3.6 KEGG代谢通路分析 | 第50-54页 |
| 3.7 编码蛋白框(CDS)预测 | 第54-55页 |
| 3.8 华中五味子中木脂素合成候选基因分析 | 第55-61页 |
| 3.9 SSR分析 | 第61-65页 |
| 4 结论与讨论 | 第65-69页 |
| 4.1 结论 | 第65-66页 |
| 4.2 讨论 | 第66-68页 |
| 4.2.1 总RNA提取 | 第66页 |
| 4.2.2 功能注释 | 第66-67页 |
| 4.2.3 SSR分析 | 第67-68页 |
| 4.3 创新性 | 第68页 |
| 4.4 不足与展望 | 第68-69页 |
| 参考文献 | 第69-78页 |
| 附录 A | 第78-80页 |
| 致谢 | 第80页 |