| 摘要 | 第4-6页 |
| Abstract | 第6-7页 |
| 第一章 综述 | 第10-31页 |
| 1 齐口裂腹鱼的研究进展 | 第10-12页 |
| 1.1 齐口裂腹鱼简介 | 第10页 |
| 1.2 齐口裂腹鱼与免疫调节剂 | 第10-11页 |
| 1.3 齐口裂腹鱼与疾病 | 第11-12页 |
| 2 转录组学研究进展 | 第12-23页 |
| 2.1 转录组学研究技术的发展 | 第12-19页 |
| 2.1.1 EST技术 | 第12-13页 |
| 2.1.2 Microarray技术 | 第13-14页 |
| 2.1.3 SAGE技术 | 第14-15页 |
| 2.1.4 MPSS技术 | 第15页 |
| 2.1.5 新一代高通量测序技术 | 第15-19页 |
| 2.2 鱼类转录组学的研究概况 | 第19-23页 |
| 2.2.1 RNA-seq在鱼类免疫学研究中的应用 | 第20-21页 |
| 2.2.2 RNA-seq在鱼类发育学研究中的应用 | 第21页 |
| 2.2.3 RNA-seq在鱼类生理学研究中的应用 | 第21-22页 |
| 2.2.4 RNA-seq在鱼类毒理学研究中的应用 | 第22-23页 |
| 3 鱼类的免疫防御与信号通路研究进展 | 第23-30页 |
| 3.1 鱼类免疫系统 | 第23-24页 |
| 3.1.1 先天性免疫 | 第23-24页 |
| 3.1.2 获得性免疫 | 第24页 |
| 3.2 鱼类免疫识别的信号通路 | 第24-30页 |
| 3.2.1 TLR信号通路 | 第25-27页 |
| 3.2.2 RLR信号通路 | 第27-28页 |
| 3.2.3 JAK-STAT信号通路 | 第28-30页 |
| 4 本研究的目的和意义 | 第30-31页 |
| 第二章 材料和方法 | 第31-38页 |
| 1 材料 | 第31-32页 |
| 1.1 试剂 | 第31页 |
| 1.2 齐口裂腹鱼 | 第31页 |
| 1.3 设备仪器 | 第31-32页 |
| 2 方法 | 第32-38页 |
| 2.1 齐口裂腹鱼的处理 | 第32页 |
| 2.2 文库构建和测序 | 第32-33页 |
| 2.3 转录本组装和注释 | 第33-35页 |
| 2.3.1 测序数据过滤 | 第33页 |
| 2.3.2 转录本拼接 | 第33-34页 |
| 2.3.3 基因功能注释 | 第34-35页 |
| 2.4 免疫相关DEGs筛选 | 第35-36页 |
| 2.5 qPCR验证 | 第36-38页 |
| 第三章 结果和讨论 | 第38-59页 |
| 1 齐口裂腹鱼抗病毒免疫的转录组分析 | 第38-52页 |
| 1.1 结果 | 第38-48页 |
| 1.1.1 序列组装和功能注释 | 第38-40页 |
| 1.1.2 差异表达基因(DEGs) | 第40页 |
| 1.1.3 差异基因的GO和KEGG富集 | 第40-42页 |
| 1.1.4 抗病毒免疫相关DEGs | 第42-43页 |
| 1.1.5 qPCR验证 | 第43-47页 |
| 1.1.6 预测抗病毒免疫信号通路 | 第47-48页 |
| 1.2 讨论 | 第48-52页 |
| 1.2.1 转录组组装和功能注释 | 第48-49页 |
| 1.2.2 抗病毒免疫相关DEGs | 第49-50页 |
| 1.2.3 qPCR结果 | 第50-52页 |
| 1.2.4 抗病毒免疫信号通路的预测 | 第52页 |
| 2 齐口裂腹鱼抗细菌免疫的转录组分析 | 第52-59页 |
| 2.1 结果 | 第52-57页 |
| 2.1.1 序列组装和功能注释 | 第52-53页 |
| 2.1.2 差异表达基因(DEGs) | 第53页 |
| 2.1.3 差异基因的GO和KEGG富集 | 第53-55页 |
| 2.1.4 抗细菌免疫相关DEGs | 第55-56页 |
| 2.1.5 预测抗细菌免疫信号通路 | 第56-57页 |
| 2.2 讨论 | 第57-59页 |
| 2.1.2 抗细菌免疫相关DEGs | 第57页 |
| 2.2.2 抗细菌免疫信号通路的预测 | 第57-59页 |
| 结论 | 第59-60页 |
| 参考文献 | 第60-67页 |
| 致谢 | 第67-69页 |
| 研究生期间发表的学术论文 | 第69页 |
