| 摘要 | 第3-4页 |
| abstract | 第4-5页 |
| 第一章 前言 | 第9-21页 |
| 1 深海海山环境的特点 | 第9-10页 |
| 2 深海海山微生物研究进展 | 第10页 |
| 3 海洋细菌多样性研究方法 | 第10-12页 |
| 3.1 海洋细菌多样性研究的传统方法 | 第11页 |
| 3.1.1 直接观察法 | 第11页 |
| 3.1.2 分离培养法 | 第11页 |
| 3.2 海洋细菌多样性研究的现代分子生物学方法 | 第11-12页 |
| 3.2.1 16 SrDNA基因序列分析 | 第11页 |
| 3.2.2 基于PCR技术的研究方法 | 第11-12页 |
| 3.2.3 荧光原位杂交技术(FISH) | 第12页 |
| 4 深海细菌资源的开发利用 | 第12-14页 |
| 4.1 极端高温酶 | 第13页 |
| 4.2 极端低温酶 | 第13-14页 |
| 4.3 生物活性代谢产物 | 第14页 |
| 4.4 生物修复 | 第14页 |
| 5 “科学号”赴西太平洋航次简介 | 第14页 |
| 6 细菌新种的分类鉴定 | 第14-18页 |
| 6.1 遗传学分类鉴定 | 第16-17页 |
| 6.1.1 16 SrDNA序列测定 | 第16-17页 |
| 6.1.2 DNA-DNA杂交 | 第17页 |
| 6.1.3 DNAG+C%含量的测定 | 第17页 |
| 6.2 表型特征 | 第17-18页 |
| 6.2.1 形态学与生理生化特征 | 第17-18页 |
| 6.2.2 化学特征 | 第18页 |
| 7 本论文的目的及意义 | 第18-21页 |
| 第二章 西太平洋海山水体中可培养细菌多样性研究 | 第21-47页 |
| 1 实验材料和方法 | 第21-25页 |
| 1.1 实验材料和仪器 | 第21-22页 |
| 1.1.1 实验试剂与培养基 | 第21-22页 |
| 1.1.2 实验仪器 | 第22页 |
| 1.2 实验方法 | 第22-25页 |
| 1.2.1 样品的采集 | 第22-23页 |
| 1.2.2 样品的涂布 | 第23页 |
| 1.2.3 细菌的分离纯化及保藏 | 第23页 |
| 1.2.4 细菌基因组DNA提取 | 第23-24页 |
| 1.2.5 细菌16SrDNA基因的PCR扩增 | 第24页 |
| 1.2.6 PCR扩增产物的检测 | 第24页 |
| 1.2.716 SrDNA序列测定及系统发育分析 | 第24-25页 |
| 2 结果与讨论 | 第25-44页 |
| 2.1 实验结果 | 第25-38页 |
| 2.1.1 水体细菌的分离培养 | 第25页 |
| 2.1.2 细菌16SrDNA基因序列的比对 | 第25-37页 |
| 2.1.3 系统发育分析 | 第37-38页 |
| 2.2 讨论 | 第38-44页 |
| 2.2.1 西太平洋海山可培养细菌的多样性 | 第38-44页 |
| 2.2.2 西太平洋海山可培养细菌潜在新种(属) | 第44页 |
| 3 本章总结 | 第44-47页 |
| 第三章 海山细菌新种Oceanisphaeramarinasp.nov.的多相分类鉴定 | 第47-63页 |
| 1 实验材料和仪器 | 第47-48页 |
| 1.1 菌株 | 第47页 |
| 1.2 主要仪器 | 第47页 |
| 1.3 实验试剂和培养基 | 第47-48页 |
| 2 实验方法 | 第48-55页 |
| 2.1 菌株分离纯化及保藏 | 第48-49页 |
| 2.1.1 样品的获取 | 第48页 |
| 2.1.2 样品的处理 | 第48页 |
| 2.1.3 菌株复苏及纯化 | 第48-49页 |
| 2.2 遗传学特征的分类鉴定 | 第49页 |
| 2.2.1 实验菌株YM319的16SrDNA基因序列测定及分析 | 第49页 |
| 2.2.2 实验菌株YM319的DNAG+C%含量测定 | 第49页 |
| 2.2.3 基因组DNA-DNA杂交 | 第49页 |
| 2.3 表型特征的分类鉴定 | 第49-55页 |
| 2.3.1 形态学特征观察 | 第50页 |
| 2.3.2 生理生化特征鉴定 | 第50-54页 |
| 2.3.3 化学特征鉴定 | 第54-55页 |
| 3 实验结果及分析讨论 | 第55-63页 |
| 3.1 遗传学特征分类鉴定结果 | 第55-56页 |
| 3.1.1 YM31916SrDNA测序结果及系统发育树的构建 | 第55页 |
| 3.1.2 YM319DNAG+C%含量的测定 | 第55-56页 |
| 3.2 表型特征分类鉴定结果 | 第56-60页 |
| 3.2.1 YM319形态学特征鉴定结果 | 第56-57页 |
| 3.2.2 YM319生理生化特征鉴定结果 | 第57-59页 |
| 3.2.3 化学特征鉴定结果 | 第59-60页 |
| 3.3 讨论 | 第60-63页 |
| 第四章 海山细菌新种Thalassotaleaprofundisp.nov.的多相分类鉴定 | 第63-73页 |
| 1 实验材料和仪器 | 第63-64页 |
| 1.1 菌株 | 第63-64页 |
| 1.2 主要仪器 | 第64页 |
| 1.3 实验试剂和培养基 | 第64页 |
| 2 实验方法 | 第64页 |
| 2.1 菌株分离纯化及保藏 | 第64页 |
| 2.1.1 样品的获取 | 第64页 |
| 2.1.2 样品的处理 | 第64页 |
| 2.1.3 菌株复苏及纯化 | 第64页 |
| 2.2 遗传学特征的分类鉴定 | 第64页 |
| 2.3 表型特征的分类鉴定 | 第64页 |
| 3 实验结果及分析讨论 | 第64-73页 |
| 3.1 遗传学特征分类鉴定结果 | 第64-67页 |
| 3.1.1 YM15516SrDNA测序结果及系统发育树的构建 | 第64-66页 |
| 3.1.2 YM155DNAG+C%含量的测定 | 第66-67页 |
| 3.1.3 YM155DNA-DNA杂交 | 第67页 |
| 3.2 表型特征分类鉴定结果 | 第67-71页 |
| 3.2.1 YM155形态学特征鉴定结果 | 第67页 |
| 3.2.2 YM155生理生化特征鉴定结果 | 第67-69页 |
| 3.2.3 化学特征鉴定结果 | 第69-71页 |
| 3.3 讨论 | 第71-73页 |
| 全文结论 | 第73-74页 |
| 创新点 | 第74-75页 |
| 参考文献 | 第75-81页 |
| 附录 | 第81-82页 |
| 致谢 | 第82-83页 |
| 攻读学位期间发表的学术论文 | 第83-84页 |
