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长毛兔候选基因5调控区多态性及其与产毛性状的关联分析

中文摘要第9-11页
Abstract第11-12页
1 引言第13-23页
    1.1 长毛兔的产业概况第13-14页
        1.1.1 长毛兔介绍及经济学价值第13页
        1.1.2 长毛兔的生产现状第13-14页
    1.2 影响长毛兔产毛性状的因素第14-16页
        1.2.1 遗传因素第14-15页
        1.2.2 营养因素第15页
        1.2.3 性别因素第15页
        1.2.4 环境因素第15-16页
    1.3 长毛兔遗传育种第16-17页
        1.3.1 传统育种技术第16页
        1.3.2 现代分子育种技术第16-17页
    1.4 单核苷酸标记在家兔上的研究进展第17-18页
    1.5 产毛性状相关候选基因研究进展第18-22页
        1.5.1 KRT角蛋白基因第18-19页
        1.5.2 Wnt通路第19-20页
        1.5.3 生长轴基因第20-21页
        1.5.4 细胞凋亡信号通路第21-22页
    1.6 本研究的目的和意义第22-23页
2 材料与方法第23-33页
    2.1 试验对象第23页
    2.2 饲养管理第23页
    2.3 样品采集第23页
    2.4 主要试剂与仪器第23-24页
        2.4.1 主要试剂第23-24页
        2.4.2 主要试剂配制第24页
        2.4.3 主要仪器第24页
    2.5 试验方法第24-30页
        2.5.1 产毛性状指标测定第24-25页
        2.5.2 耳组织DNA的提取第25-26页
        2.5.3 DNA模板检测第26页
        2.5.4 混池测序筛选基因SNP位点第26-28页
        2.5.5 SNP分型第28-30页
    2.6 数据的统计与分析第30-33页
        2.6.1 基因频率与等位基因频率第30-31页
        2.6.2 基因遗传多态性分析第31页
        2.6.3 哈代-温伯格平衡检验第31-32页
        2.6.4 SNP与产毛性状关联分析第32页
        2.6.5 单倍型效应分析第32-33页
3 结果与分析第33-62页
    3.1 基因组DNA提取第33页
    3.2 PCR扩增产物检测第33页
    3.3 SNP筛选第33-35页
    3.4 SNP位点第35页
    3.5 SNP质谱分型第35-36页
    3.6 SNP群体遗传学分析第36-40页
        3.6.1 候选基因多态性分析第36-37页
        3.6.2 哈代温伯格平衡检验第37-40页
    3.7 候选基因5'调控区SNP与产毛性状关联分析第40-55页
    3.8 SNP对产毛性状的表型方差贡献率第55-56页
    3.9 SNP连锁不平衡分析第56-57页
    3.10 候选基因5'调控区单倍型与产毛性状关联分析第57-62页
4 讨论第62-67页
    4.1 基因5'调控区SNPs的意义第62页
    4.2 候选基因SNPs群体遗传性分析第62-63页
    4.3 候选基因5'调控区SNP与产毛性状的关联第63-66页
    4.4 单倍型对产毛性状的影响第66-67页
5 结论第67-68页
参考文献第68-75页
致谢第75页

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